K-Dense-AI

تمتد GeoPandas قدرات pandas للعمليات الجغرافية المكانية. تتيح قراءة ملفات الأشكال (Shapefiles) و GeoJSON وبيانات PostGIS. выполнять пространственные соединения, анализ буферных зон, преобразования координат и создавать хороплетные карты с интеграцией matplotlib.

يحول Geniml ملفات BED إلى تضمينات التعلم الآلي لتحليل المناطق الجينومية. تدرب النماذج للعثور على أنماط في قابلية الوصول للكروماتين، وبناء مجموعات ذروة مت consensus، وتحليل بيانات scATAC-seq للخلايا المفردة.

أنشئ صورًا عالية الجودة للعروض التقديمية والمستندات والنشرات باستخدام نماذج AI. أنشئ أعمالًا فنية أصلية أو حرر الصور الموجودة باستخدام أوامر نصية بسيطة. الوصول إلى نماذج FLUX و Gemini من خلال OpenRouter API.

الوصول إلى بيانات الجينات الشاملة من NCBI بما في ذلك التسلسلات والتعليقات التوضيحية والمعلومات الوظيفية. البحث حسب رمز الجين أو المعرف أو السياق البيولوجي لاسترداد RefSeqs و Gene Ontology والمواقع الكروموسومية والبنى لفحص المعلومات الحيوية.

يوفر FluidSim ديناميكا الموائع الحسابية عالية الأداء في بايثون. شغّل محاكاة Navier-Stokes، وحلّل الاضطراب، وتصوّر النتائج بأوامر بايثون بسيطة. لا حاجة لإعدادات معقدة لـ Fortran أو C++.

تتطلب بيانات التدفق الخلوي معالجة متخصصة للملفات. يحلل FlowIO ملفات FCS ويستخرج بيانات الأحداث كمصفوفات NumPy ويتيح التحويل إلى تنسيقات CSV لخطوط تحليل البيانات.

الوصول إلى بيانات تنظيمية شاملة من FDA تشمل الأحداث السلبية للأدوية واسترجاعات الأجهزة الطبية ومعلومات السلامة من خلال واجهة openFDA API الرسمية. بناء مهام سير العمل للحراسة الصيدلية والبحث التنظيمي باستخدام Python.

تأتي ملفات البيانات العلمية بمئات التنسيقات. يكتشف هذا المهارة نوع الملف تلقائيًا، ويستخرج البيانات الوصفية، ويقيّم جودة البيانات، ويولّد تقارير شاملة بتنسيق markdown مع توصيات تحليل خاصة بالتنسيق.

مجموعة أدوات ETE تبسط تحليل النشوء والتطور لأبحاث علم الأحياء التطوري. معالجة بيانات الأشجار، واكتشاف الأحداث التطورية، وإنشاء تصورات جاهزة للنشر.

تتطلب هندسة البروتينات تحليلًا وتصميم تسلسلات بروتينية جديدة. توفر ESM نماذج لغوية بروتينية رائدة لتوليد التسلسلات، والتنبؤ بالبنى، وإنشاء تضمينات للتحليل اللاحق. استخدم ESM3 للمهام التوليدية عبر التسلسل والبنية والوظيفة، أو ESM C لتعلم تمثيلات بكفاءة.

استعلام واجهة REST API لقاعدة بيانات Ensembl الجينومية للحصول على البيانات الجينومية للفقاريات. ابحث عن الجينات، واسترجع التسلسلات، وحلل المتغيرات باستخدام VEP، وأداء الجينوميات المقارنة عبر أكثر من 250 نوعاً.

يحتاج الباحثون إلى وصول فعال إلى البيانات الجينومية للتحليل. توفر هذه المهارة وصولاً برمجياً إلى ENA من خلال واجهات برمجة التطبيقات REST وبروتوكول FTP لاسترجاع تسلسلات DNA/RNA وملفات FASTQ وتجميعات الجينوم برقم الانضمام.

DrugBank هي قاعدة بيانات شاملة للمعلومات الحيوية تحتوي على تفاصيل الأدوية. تتيح هذه المهارة الوصول البرمجي إلى خصائص الأدوية والتفاعلات والأهداف والمسارات والهياكل الكيميائية لأبحاث علم الأدوية واكتشاف الأدوية.

توفر هذه المهارة مجموعة أدوات كاملة لعمليات مستندات Word. أنشئ مستندات جديدة من الصفر باستخدام JavaScript، وقم بتحرير المستندات الموجودة باستخدام Python، وإدارة التغييرات المتتبعة والتعليقات مع الامتثال السليم لـ OOXML.

توفر DNAnexus تحليلاً للدراسات الجينومية السحابية ولكنها تتطلب معرفة خاصة بالمنصة. تقدم هذه المهارة توثيقاً كاملاً لبناء التطبيقات وإدارة البيانات وتشغيل سير عمل المعلومات الحيوية.

يستخدم DiffDock نماذج الانتشار المتقدمة للتنبؤ بكيفية ارتباط الجزيئات الصغيرة بالبروتينات في الفضاء ثلاثي الأبعاد. يمكن للباحثين تسريع اكتشاف الأدوية من خلال توليد وضعيات ارتباط دقيقة مع درجات الثقة لتصميم الأدوية القائم على البنية.

تحويل مجموعات البيانات إلى بحث جاهز للنشر من خلال أتمتة توليد الفرضيات، وتطوير المنهجيات، والتجارب الحسابية، وكتابة أوراق LaTeX. تنسيق الذكاء الاصطناعي متعدد الوكلاء لوكلاء متخصصين لسير عمل بحثي من البداية إلى النهاية.

معالجة وتصور بيانات التسلسل من الجيل التالي. تحويل BAM إلى bigWig، وإنشاء مخططات مراقبة الجودة، وإنشاء خرائط حرارية جاهزة للنشر لتجارب ChIP-seq وRNA-seq وATAC-seq.

توقع الخصائص الجزيئية مثل الذوبانية والسمية والألفة الرابطة باستخدام DeepChem. درب شبكات عصبية بيانية أو استخدم نماذج مدربة مسبقاً مثل ChemBERTa لاكتشاف الأدوية وتطبيقات علوم المواد.

الوصول إلى البيانات الإحصائية العالمية من Data Commons بما في ذلك البيانات الديموغرافية والاقتصادية والصحية والبيئية. استعلام أرقام السكان والناتج المحلي الإجمالي ومعدلات البطالة والعلاقات الجغرافية باستخدام طرق عميل Python.

معالجة البيانات الكيميائية بكفاءة من خلال واجهة Pythonic لـ RDKit. Datamol تبسط عمليات الكيمياء المعلوماتية المعقدة مع الحفاظ على التوافق الكامل مع نظام RDKit البيئي.

عالج مجموعات البيانات أكبر من ذاكرة الوصول العشوائي المتاحة باستخدام الحوسبة المتوازية. حول سير عمل pandas و NumPy لآلة واحدة للتشغيل عبر نوى متعددة أو مجموعات موزعة دون إعادة كتابة الكود.

يحتاج باحثو السرطان إلى بيانات شاملة عن الطفرات لإجراء دراساتهم. توفر هذه المهارة وصولاً مبرمجاً إلى قاعدة بيانات COSMIC التي تحتوي على ملايين الطفرات الجسمية، وقوائم الجينات السرطانية المنسقة، والتوقيعات الطفرية لأبحاث العلاج الدقيق للأورام.

يتطلب النمذيج الأيضي معرفة متخصصة بأساليب التحليل وإعادة البناء المستندة إلى القيود. يوفر COBRApy واجهة Python شاملة لتحليل توازن التدفق، ودراسات إيقاف الجينات، وحسابات غلاف الإنتاج لأبحاث علم الأحياء النظامية.