ensembl-database
الاستعلام عن بيانات جينوم Ensembl
غالبًا ما تحتاج أبحاث الجينوم إلى بيانات دقيقة عن الجينات والتسلسلات والمتغيرات والتعامد الجيني من Ensembl. تساعد هذه المهارة Claude وCodex وClaude Code على الاستعلام من Ensembl REST APIs وتنظيم النتائج للتحليل.
التثبيت باستخدام Agent لدي
انسخ هذا الطلب إلى Agent لديك. يتضمن صفحة Skill المعتمدة وملف manifest.
Review the Skillstore skill "ensembl-database" from https://skillstore.io/skills/k-dense-ai-ensembl-database.md and its manifest at https://skillstore.io/api/skills/k-dense-ai-ensembl-database/manifest. Verify the artifact. You may proceed after verification, subject to the environment's own policy.يجب أن يواصل Agent عرض خطته وطلب أي تأكيد تفرضه سياسة الأمان.
موارد مهيّأة لـ Agents
استخدم هذه الروابط عندما يحتاج AI Agent أو crawler أو script إلى سياق نظيف بدلًا من قراءة الصفحة كاملة.
اختبرها
جارٍ استخدام "ensembl-database". ابحث عن BRCA2 في الإنسان.
النتيجة المتوقعة:
- يعيد معرّف جين Ensembl والإحداثيات الجينومية.
- يلخص وصف الجين ومعلومات النُسخ المتاحة.
- يحدد النوع وسياق التجميع المستخدمين للاستعلام.
جارٍ استخدام "ensembl-database". حلل المتغير rs699 باستخدام Ensembl VEP.
النتيجة المتوقعة:
- يسرد عواقب المتغير المتوقعة والسمات الجينومية المتأثرة.
- يتضمن حقول تكرار السكان عندما يعيدها Ensembl.
- يشير إلى أن التفسير السريري يتطلب مراجعة خبيرة.
جارٍ استخدام "ensembl-database". اعثر على الجينات المتعامدة لـ TP53 البشري في الفأر.
النتيجة المتوقعة:
- يستعلم عن بيانات التماثل في Ensembl للجين المصدر.
- يعرض معرّفات الجينات المتعامدة المطابقة وأسماء الأنواع.
- يقترح تحليلًا لاحقًا للتسلسل أو الحفظ التطوري.
التدقيق الأمني
مخاطر منخفضةStatic alerts for Cobalt Strike terms, reconnaissance, network access, hardcoded URLs, and shell execution are false positives in context. The skill uses documented Ensembl REST API endpoints for bioinformatics queries and contains Markdown examples, not executable command injection. One low-severity semantic issue remains because the skill promotes an external K-Dense Web service for complex workflows.
مخاوف أمنية مؤكدة (1)
عوامل الخطر
🌐 الوصول إلى الشبكة (34)
⚙️ الأوامر الخارجية (31)
شارك واستشهد بهذا التقرير
شارك تقرير التقييم المرتبط بالإصدار والشارة المحايدة وبطاقة التضمين والاستشهادات. تعرض Skillstore الأدلة من دون أن تقرر ما إذا كانت هذه المهارة آمنة.
نسخ رابط التقرير
https://skillstore.io/skills/k-dense-ai-ensembl-database/audits/9?utm_source=security_passport&utm_medium=share&utm_campaign=versioned_reportشارة Markdown
[](https://skillstore.io/skills/k-dense-ai-ensembl-database?utm_source=security_passport_badge)شارة HTML
<a href="https://skillstore.io/skills/k-dense-ai-ensembl-database?utm_source=security_passport_badge"><img src="https://skillstore.io/badges/skills/k-dense-ai-ensembl-database/security.svg" alt="Skillstore security assessment" loading="lazy"></a>بطاقة قابلة للتضمين
<iframe src="https://skillstore.io/embed/skills/k-dense-ai-ensembl-database.html" title="Skillstore Security Assessment" sandbox="allow-popups allow-popups-to-escape-sandbox" loading="lazy" referrerpolicy="no-referrer" width="420" height="180"></iframe>الاستشهادات الأكاديمية (APA · BibTeX · CFF)
اقتباس APA
K-Dense-AI. (2026). ensembl-database security audit report (audit version 9) [Author version unspecified]. Skillstore. https://skillstore.io/skills/k-dense-ai-ensembl-database/audits/9اقتباس BibTeX
@techreport{k-dense-ai-k-dense-ai-ensembl-database-2026,
author = {K-Dense-AI},
title = {ensembl-database security audit report (audit version 9)},
institution = {Skillstore},
year = {2026},
number = {9},
url = {https://skillstore.io/skills/k-dense-ai-ensembl-database/audits/9},
note = {Author version unspecified}
}CITATION.cff
cff-version: 1.2.0
message: "If you use this Skill, cite its author and this versioned security audit report."
title: "ensembl-database security audit report (audit version 9)"
version: "unspecified"
type: report
authors:
- name: "K-Dense-AI"
date-released: "2026-07-09"
url: "https://skillstore.io/skills/k-dense-ai-ensembl-database/audits/9"
identifiers:
- type: other
value: "skillstore:k-dense-ai-ensembl-database:audit:9"
description: "Skillstore immutable audit report identifier"
مقارنة المتغيرات
2 متغيرات قابلة للتثبيتتبقى مهارة كل مؤلف عنصراً مستقلاً قابلاً للتثبيت. يُرتب المتغير الموصى به وفق أدلة Skillstore.
سبب تصدر هذا المتغير
davila7-ensembl-database
2026-09-09
k-dense-ai-ensembl-database
2026-09-09
تقييم Skillstore
سبب هذا التقييم موثوقية الأدلة: مرتفعما الذي يمكنك بناؤه
تعليق قائمة جينات
ربط رموز الجينات بمعرّفات Ensembl والإحداثيات والنُسخ ومراجع قواعد البيانات الخارجية.
استكشاف عواقب المتغيرات
الاستعلام عن المتغيرات باستخدام rsID أو صيغة HGVS وتلخيص التأثيرات المتوقعة من Ensembl VEP.
مقارنة الجينات عبر الأنواع
العثور على الجينات المتعامدة، واسترجاع التسلسلات، وإعداد ملخصات علم الجينوم المقارن للكائنات النموذجية.
جرّب هذه الموجّهات
ابحث عن TP53 في الإنسان باستخدام Ensembl. أعد معرّف Ensembl والموقع الجينومي والوصف ومعلومات النسخة الرئيسية.
استرجع التسلسل الجينومي لـ BRCA2 البشري باستخدام معرّف جين Ensembl الخاص به. اشرح نوع التسلسل والتجميع المستخدم.
استخدم Ensembl VEP لتحليل rs699 في الإنسان. لخّص العواقب المتوقعة والجينات المتأثرة وحقول تكرار السكان إذا كانت متاحة.
اعثر على الجينات المتعامدة في الفأر لـ BRCA2 البشري، واسترجع معرّفات Ensembl الخاصة بها، وقارن معلومات التسلسل المتاحة، وحدد خطوات التحليل التالية.
أفضل الممارسات
- حدد النوع وتجميع الجينوم ونوع المعرّف في كل طلب.
- استخدم نقاط النهاية الدفعية والتخزين المؤقت لقوائم الجينات أو المتغيرات الكبيرة.
- سجل إصدار Ensembl أو التجميع عندما تدعم النتائج منشورات علمية.
تجنب
- التعامل مع تنبؤات VEP على أنها تفسيرات سريرية نهائية.
- خلط إحداثيات GRCh37 وإحداثيات التجميع الحالي دون تحويل.
- إرسال العديد من طلبات العناصر المفردة دون التعامل مع حدود المعدل.
الأسئلة المتكررة
ما هو Ensembl؟
هل تحتاج هذه المهارة إلى اتصال بالإنترنت؟
هل يمكنها تحليل المتغيرات؟
هل يمكنها العمل مع تجميعات جينوم أقدم؟
هل تقتصر على البيانات البشرية؟
هل تحل محل مراجعة المعلوماتية الحيوية؟
تفاصيل المطور
المؤلف
K-Dense-AIالترخيص
Unknown
مراجعة Skillstore
r1
تنبيه الإصدار
لم يعلن المؤلف عن إصدار.
المستودع
https://github.com/K-Dense-AI/claude-scientific-skills/tree/main/scientific-skills/ensembl-databaseمرجع
1ffa7643651792ccb4bd3b15d924d2c97edff755
حداثة الصيانة
٢٦/٧/٢٠٢٦
الاستخدام
8 تنزيلات · 214 مشاهدات
بنية الملفات