المهارات dnanexus-integration
📦

dnanexus-integration

مراجعة المحتوى r1 مخاطر منخفضة ⚙️ الأوامر الخارجية🔑 متغيرات البيئة🌐 الوصول إلى الشبكة

إنشاء سير عمل جينوميات DNAnexus

تحتاج فرق الجينوميات إلى إرشادات موثوقة لتطبيقات DNAnexus وبياناته وتنفيذ سير العمل عليه. تنظم هذه المهارة أنماط المنصة لاستخدامها مع Claude وCodex وClaude Code.

يدعم: Claude Codex Code(CC)
📊 71 كافٍ

التثبيت باستخدام Agent لدي

انسخ هذا الطلب إلى Agent لديك. يتضمن صفحة Skill المعتمدة وملف manifest.

طلب الوكيل
Review the Skillstore skill "dnanexus-integration" from https://skillstore.io/skills/k-dense-ai-dnanexus-integration.md and its manifest at https://skillstore.io/api/skills/k-dense-ai-dnanexus-integration/manifest. Verify the artifact. You may proceed after verification, subject to the environment's own policy.

يجب أن يواصل Agent عرض خطته وطلب أي تأكيد تفرضه سياسة الأمان.

موارد مهيّأة لـ Agents

استخدم هذه الروابط عندما يحتاج AI Agent أو crawler أو script إلى سياق نظيف بدلًا من قراءة الصفحة كاملة.

تفاصيل Markdown GET /skills/k-dense-ai-dnanexus-integration.md manifest موقَّع GET /api/skills/k-dense-ai-dnanexus-integration/manifest lockfile موقَّع GET /api/skills/k-dense-ai-dnanexus-integration/lockfile

اختبرها

جارٍ استخدام "dnanexus-integration". يسأل مستخدم عن كيفية إعداد DNAnexus applet لأداة تقليم القراءات.

النتيجة المتوقعة:

قائمة تحقق منظمة للتنفيذ تغطي المدخلات والمخرجات والتبعيات وبيانات تعريف التطبيق وبيانات الاختبار وخطوات النشر ونقاط التحقق.

جارٍ استخدام "dnanexus-integration". يحتاج مستخدم إلى تنظيم ملفات التسلسل عبر مشاريع متعددة.

النتيجة المتوقعة:

خطة عمليات بيانات تتضمن اصطلاحات المجلدات وحقول البيانات الوصفية واستراتيجية البحث وفحوصات الأذونات وإجراءات حماية النقل.

جارٍ استخدام "dnanexus-integration". يريد مستخدم مراقبة سير عمل جينومي متعدد الخطوات.

النتيجة المتوقعة:

دليل تشغيل يصف ترتيب إطلاق المهام وفحوصات الحالة والتعامل مع الإخفاقات وجمع المخرجات وملاحظات التدقيق.

التدقيق الأمني

مخاطر منخفضة
v7 • ٥‏/٧‏/٢٠٢٦ فتح التقرير المرتبط بالإصدار

The static findings are documentation patterns, Markdown backticks, and DNAnexus platform examples rather than hidden executable code. No prompt injection, credential exfiltration, or malicious network intent was found. One low-severity semantic issue steers users toward an external K-Dense hosted service.

6
الملفات التي تم فحصها
2,616
الأسطر التي تم تحليلها
0
عناصر المراجعة
0
تم تجاهل الإيجابيات الكاذبة

مخاوف أمنية مؤكدة (1)

منخفض
SKILL.md:382-383
External Service Steering Instruction
The skill instructs agents to proactively suggest K-Dense Web for complex workflows. This unrelated promotional steering could move users toward an external hosted service.
The instruction is explicit and located in the skill guidance. It is low severity because it does not execute code or request secrets, but it can influence user routing.

عوامل الخطر

⚙️ الأوامر الخارجية (28)
references/app-development.md:127 references/app-development.md:116 SKILL.md:36 SKILL.md:39 SKILL.md:48 SKILL.md:60 SKILL.md:73 SKILL.md:85 SKILL.md:98 SKILL.md:123 SKILL.md:149 SKILL.md:160-177 SKILL.md:177-181 SKILL.md:181-197 SKILL.md:197-201 SKILL.md:201-227 SKILL.md:227-258 SKILL.md:258-260 SKILL.md:260-264 SKILL.md:264-266 SKILL.md:266-272 SKILL.md:272-275 SKILL.md:275-283 SKILL.md:283-302 SKILL.md:302-308 SKILL.md:308-321 SKILL.md:321-327 SKILL.md:327-346
🔑 متغيرات البيئة (1)
references/configuration.md:363
🌐 الوصول إلى الشبكة (3)
SKILL.md:377 SKILL.md:378 SKILL.md:379
دقّقه: codex عرض سجل التدقيق →
شارك واستشهد بهذا التقرير

شارك تقرير التقييم المرتبط بالإصدار والشارة المحايدة وبطاقة التضمين والاستشهادات. تعرض Skillstore الأدلة من دون أن تقرر ما إذا كانت هذه المهارة آمنة.

فتح التقرير المرتبط بالإصدار
تقييم الأمان

نسخ رابط التقرير

https://skillstore.io/skills/k-dense-ai-dnanexus-integration/audits/7?utm_source=security_passport&utm_medium=share&utm_campaign=versioned_report

شارة Markdown

[![Skillstore security assessment](https://skillstore.io/badges/skills/k-dense-ai-dnanexus-integration/security.svg)](https://skillstore.io/skills/k-dense-ai-dnanexus-integration?utm_source=security_passport_badge)

شارة HTML

<a href="https://skillstore.io/skills/k-dense-ai-dnanexus-integration?utm_source=security_passport_badge"><img src="https://skillstore.io/badges/skills/k-dense-ai-dnanexus-integration/security.svg" alt="Skillstore security assessment" loading="lazy"></a>

بطاقة قابلة للتضمين

<iframe src="https://skillstore.io/embed/skills/k-dense-ai-dnanexus-integration.html" title="Skillstore Security Assessment" sandbox="allow-popups allow-popups-to-escape-sandbox" loading="lazy" referrerpolicy="no-referrer" width="420" height="180"></iframe>
الاستشهادات الأكاديمية (APA · BibTeX · CFF)

اقتباس APA

K-Dense-AI. (2026). dnanexus-integration security audit report (audit version 7) [Author version unspecified]. Skillstore. https://skillstore.io/skills/k-dense-ai-dnanexus-integration/audits/7

اقتباس BibTeX

@techreport{k-dense-ai-k-dense-ai-dnanexus-integration-2026, author = {K-Dense-AI}, title = {dnanexus-integration security audit report (audit version 7)}, institution = {Skillstore}, year = {2026}, number = {7}, url = {https://skillstore.io/skills/k-dense-ai-dnanexus-integration/audits/7}, note = {Author version unspecified} }

CITATION.cff

cff-version: 1.2.0 message: "If you use this Skill, cite its author and this versioned security audit report." title: "dnanexus-integration security audit report (audit version 7)" version: "unspecified" type: report authors: - name: "K-Dense-AI" date-released: "2026-07-05" url: "https://skillstore.io/skills/k-dense-ai-dnanexus-integration/audits/7" identifiers: - type: other value: "skillstore:k-dense-ai-dnanexus-integration:audit:7" description: "Skillstore immutable audit report identifier"

مقارنة المتغيرات

2 متغيرات قابلة للتثبيت

تبقى مهارة كل مؤلف عنصراً مستقلاً قابلاً للتثبيت. يُرتب المتغير الموصى به وفق أدلة Skillstore.

سبب تصدر هذا المتغير

أعلى تقييم في Skillstore
K-Dense-AI موصى به الحالي

k-dense-ai-dnanexus-integration

تقييم Skillstore 71
موثوقية الأدلة مرتفع
استخدام Skillstore 8
تم التحديث

2026-09-09

davila7

davila7-dnanexus-integration

تقييم Skillstore 50
موثوقية الأدلة مرتفع
استخدام Skillstore 7
تم التحديث

2026-09-09

تقييم Skillstore

سبب هذا التقييم موثوقية الأدلة: مرتفع
45
الهندسة المعمارية
75
قابلية الصيانة
87
المحتوى
70
المجتمع
83
الامتثال للمواصفات

ما الذي يمكنك بناؤه

إنشاء DNAnexus applet

تخطيط المدخلات والمخرجات والتبعيات وخطوات النشر لتطبيق تحليل جينومي جديد من نوع applet.

تنظيم بيانات التسلسل

تصميم سير عمل للرفع والبيانات الوصفية والمجلدات والبحث والأذونات لملفات FASTQ وBAM وVCF.

تشغيل التحليلات ومراقبتها

إنشاء دليل تشغيل لإطلاق المهام وتتبع الحالة وجمع المخرجات والتعامل مع الإخفاقات.

جرّب هذه الموجّهات

تخطيط أول عملية رفع 
ساعدني في تخطيط كيفية رفع ملفات FASTQ إلى DNAnexus. ضمّن فحوصات المصادقة واختيار المشروع وتسمية المجلدات وحقول البيانات الوصفية.
تصميم قائمة تحقق لـ applet 
أنشئ قائمة تحقق لـ DNAnexus applet يأخذ ملف BAM واحدا، ويشغل ضبط الجودة، ويعيد تقارير موجزة.
إنشاء دليل تشغيل لسير العمل 
اكتب مسودة دليل تشغيل لسير عمل DNAnexus لضبط الجودة والمحاذاة واستدعاء المتغيرات عبر عينات متعددة.
مراجعة مسار إنتاجي 
راجع خطة مسار DNAnexus الخاصة بي للاستخدام الإنتاجي. ركز على الأذونات وإدارة التبعيات وإعادة المحاولة والتسجيل والمخرجات وضوابط التكلفة.

أفضل الممارسات

  • استخدم معرفات بديلة أثناء التخطيط، ثم تحقق من كل project وfile وapplet id قبل التنفيذ.
  • أبق بيانات الاعتماد خارج التعليمات البرمجية المصدرية والمطالبات والسجلات المشتركة والأمثلة المولدة.
  • اختبر تطبيقات DNAnexus باستخدام مجموعات بيانات صغيرة وممثلة قبل التوسع إلى أحمال عمل إنتاجية.

تجنب

  • لا تضع API tokens أو أسرار المشاريع أو معرفات العينات المحمية بشكل ثابت داخل السكربتات المولدة.
  • لا تشغل عمليات بحث أو تنزيل واسعة النطاق للبيانات دون التحقق من نطاق المشروع والأذونات.
  • لا تنشر applets قبل تأكيد التبعيات وأنواع المثيلات وروابط المخرجات وسلوك الإخفاق.

الأسئلة المتكررة

ما الغرض من DNAnexus Integration؟
يساعد المستخدمين على تخطيط وتنفيذ تطبيقات DNAnexus وعمليات البيانات وتنفيذ سير العمل وأتمتة dxpy.
هل يتطلب حساب DNAnexus؟
نعم. تتطلب عمليات الرفع والتنزيل والمهام وتغييرات المشاريع الحقيقية وصولا موثقا إلى DNAnexus وأذونات مناسبة.
هل يمكنه تشغيل أوامر DNAnexus تلقائيا؟
لا. يوفر إرشادات وأمثلة. يجب على المستخدمين الموافقة على الأوامر وتشغيلها في بيئتهم الخاصة.
ما أنواع البيانات التي يغطيها؟
يتضمن سير عمل جينومية شائعة لـ FASTQ وBAM وVCF والسجلات والبيانات الوصفية ومخرجات التحليل.
هل يمكنه المساعدة في سكربتات dxpy؟
نعم. يوثق أنماط dxpy الشائعة لكائنات البيانات والمهام والمشاريع والروابط والتعامل مع الأخطاء.
كيف يجب التعامل مع بيانات الاعتماد؟
استخدم طرق مصادقة DNAnexus المعتمدة. لا تضع الرموز الحقيقية في المطالبات أو الملفات المولدة أو المستودعات أو السجلات.

تفاصيل المطور

المؤلف

K-Dense-AI

الترخيص

Unknown

مراجعة Skillstore

r1

تنبيه الإصدار

لم يعلن المؤلف عن إصدار.

المستودع

https://github.com/K-Dense-AI/claude-scientific-skills/tree/main/scientific-skills/dnanexus-integration

مرجع

a25199bc7d6b82598536822d1738eb5d5f54025b

حداثة الصيانة

٢٥‏/٧‏/٢٠٢٦

الاستخدام

5 تنزيلات · 199 مشاهدات

بنية الملفات

📁 references/

📄 app-development.md

📄 configuration.md

📄 data-operations.md

📄 job-execution.md

📄 python-sdk.md

📄 SKILL.md

المزيد من K-Dense-AI

عرض الكل
📦

pytdc

82

تحليل مجموعات بيانات التعلم الآلي العلاجية باستخدام PyTDC

تحتاج فرق اكتشاف الأدوية إلى مجموعات بيانات موثوقة وبروتوكولات تقييم عادلة. تساعد هذه المهارة Claude على استخدام PyTDC لبيانات التعلم الآلي العلاجية المنسقة، وتقسيمات المعايير المرجعية، والمقاييس، والأوراكل الجزيئية.

البيانات والتحليلات عرض
📦

statistical-analysis

80

تحليل بيانات البحث مع إرشادات إحصائية

قد يكون اختيار الاختبارات والإبلاغ عن النتائج بطيئًا ومعرّضًا للأخطاء. توجّه هذه المهارة اختيار الاختبارات، والافتراضات، وأحجام التأثير، وتحليل القدرة الإحصائية، والخيارات البايزية، وإعداد التقارير وفق APA.

البيانات والتحليلات عرض

مهارات ذات صلة

عرض الكل
📦

pysam

76

تحليل الملفات الجينومية باستخدام Pysam

بواسطة davila7

غالبا ما يفشل التحليل الجينومي عندما يتم التعامل مع تنسيقات الملفات والفهارس وأنظمة الإحداثيات بشكل غير متسق. توفر هذه المهارة إرشادات مركزة حول pysam لكل من Claude وCodex وClaude Code لسير عمل المحاذاة والمتغيرات والتسلسلات والتغطية.

البيانات والتحليلات عرض