bioservices
تحليل بيانات المعلوماتية الحيوية باستخدام BioServices
غالبا ما يتطلب عمل المعلوماتية الحيوية استعلامات متكررة عبر قواعد بيانات عامة غير مترابطة. ترشد هذه المهارة Claude وCodex وClaude Code خلال سير عمل BioServices للبروتينات والمسارات والمركبات والمعرفات.
التثبيت باستخدام Agent لدي
انسخ هذا الطلب إلى Agent لديك. يتضمن صفحة Skill المعتمدة وملف manifest.
Review the Skillstore skill "bioservices" from https://skillstore.io/skills/davila7-bioservices.md and its manifest at https://skillstore.io/api/skills/davila7-bioservices/manifest. Verify the artifact. You may proceed after verification, subject to the environment's own policy.يجب أن يواصل Agent عرض خطته وطلب أي تأكيد تفرضه سياسة الأمان.
موارد مهيّأة لـ Agents
استخدم هذه الروابط عندما يحتاج AI Agent أو crawler أو script إلى سياق نظيف بدلًا من قراءة الصفحة كاملة.
اختبرها
جارٍ استخدام "bioservices". Analyze ZAP70_HUMAN with protein, pathway, and GO workflows.
النتيجة المتوقعة:
تحدد النتيجة إدخال UniProt، وتبلغ عن توفر التسلسل، وتسرد مسارات KEGG المطابقة، وتجمع مصطلحات GO حسب العملية الحيوية والوظيفة الجزيئية والمكون الخلوي.
جارٍ استخدام "bioservices". Convert a text file of UniProt accessions to KEGG identifiers.
النتيجة المتوقعة:
تصف النتيجة قواعد البيانات المصدر والهدف، وإجمالي المعرفات المعالجة، وعمليات الربط الناجحة، وعمليات الربط الفاشلة، وأعمدة CSV المحفوظة للمراجعة.
جارٍ استخدام "bioservices". Find cross-database identifiers for Geldanamycin.
النتيجة المتوقعة:
تلخص النتيجة مركب KEGG المحدد، ومعرف ChEBI، ومعرف ChEMBL، والخصائص الجزيئية، وأي مراجع مسارات ذات صلة.
التدقيق الأمني
آمنAll 138 static findings are false positives caused by Markdown formatting, biological identifiers, harmless prose, and documented result exports. No dynamic execution, system reconnaissance, prompt injection, or malicious network intent was found. The workflows intentionally contact public biological services and may write user-selected output files.
عوامل الخطر
⚡ يحتوي على سكربتات (2)
📁 الوصول إلى نظام الملفات (10)
⚙️ الأوامر الخارجية (50)
🌐 الوصول إلى الشبكة (2)
شارك واستشهد بهذا التقرير
شارك تقرير التقييم المرتبط بالإصدار والشارة المحايدة وبطاقة التضمين والاستشهادات. تعرض Skillstore الأدلة من دون أن تقرر ما إذا كانت هذه المهارة آمنة.
نسخ رابط التقرير
https://skillstore.io/skills/davila7-bioservices/audits/9?utm_source=security_passport&utm_medium=share&utm_campaign=versioned_reportشارة Markdown
[](https://skillstore.io/skills/davila7-bioservices?utm_source=security_passport_badge)شارة HTML
<a href="https://skillstore.io/skills/davila7-bioservices?utm_source=security_passport_badge"><img src="https://skillstore.io/badges/skills/davila7-bioservices/security.svg" alt="Skillstore security assessment" loading="lazy"></a>بطاقة قابلة للتضمين
<iframe src="https://skillstore.io/embed/skills/davila7-bioservices.html" title="Skillstore Security Assessment" sandbox="allow-popups allow-popups-to-escape-sandbox" loading="lazy" referrerpolicy="no-referrer" width="420" height="180"></iframe>الاستشهادات الأكاديمية (APA · BibTeX · CFF)
اقتباس APA
davila7. (2026). bioservices security audit report (audit version 9) [Author version unspecified]. Skillstore. https://skillstore.io/skills/davila7-bioservices/audits/9اقتباس BibTeX
@techreport{davila7-davila7-bioservices-2026,
author = {davila7},
title = {bioservices security audit report (audit version 9)},
institution = {Skillstore},
year = {2026},
number = {9},
url = {https://skillstore.io/skills/davila7-bioservices/audits/9},
note = {Author version unspecified}
}CITATION.cff
cff-version: 1.2.0
message: "If you use this Skill, cite its author and this versioned security audit report."
title: "bioservices security audit report (audit version 9)"
version: "unspecified"
type: report
authors:
- name: "davila7"
date-released: "2026-07-23"
url: "https://skillstore.io/skills/davila7-bioservices/audits/9"
identifiers:
- type: other
value: "skillstore:davila7-bioservices:audit:9"
description: "Skillstore immutable audit report identifier"
مقارنة المتغيرات
2 متغيرات قابلة للتثبيتتبقى مهارة كل مؤلف عنصراً مستقلاً قابلاً للتثبيت. يُرتب المتغير الموصى به وفق أدلة Skillstore.
سبب تصدر هذا المتغير
davila7-bioservices
2026-09-09
k-dense-ai-bioservices
2026-09-09
تقييم Skillstore
سبب هذا التقييم موثوقية الأدلة: مرتفعما الذي يمكنك بناؤه
توصيف بروتين
العثور على إدخال UniProt، واسترجاع بيانات التسلسل، وربط المسارات، وجمع تعليقات GO التوضيحية لبروتين واحد.
ربط معرفات البحث
تحويل دفعات من معرفات UniProt وKEGG وEnsembl وRefSeq وPDB وGO إلى معرفات قواعد البيانات المستهدفة.
مضاهاة المركبات عبر القواعد
البحث عن مركب بالاسم وجمع معلومات KEGG وChEBI وChEMBL والصيغة والكتلة والمسارات.
جرّب هذه الموجّهات
Use the BioServices skill to look up [protein name or UniProt ID]. Return the UniProt ID, gene name, organism, sequence availability, and key annotations.
Use the batch identifier workflow to convert my [source database] IDs to [target database]. Explain input format, chunk size, output columns, and failure handling.
Use the KEGG pathway workflow for organism code [organism code]. Summarize pathway counts, interaction types, export files, and rate-limit precautions.
Design a BioServices workflow that starts with [protein, gene, or compound], maps related database IDs, retrieves annotations, and lists validation checks before saving results.
أفضل الممارسات
- استخدم مرشحات الكائن الحي عند البحث عن رموز الجينات لتقليل المطابقات الغامضة.
- أضف فواصل زمنية وقسم الدفعات الكبيرة إلى أجزاء لاحترام حدود قواعد البيانات العامة.
- راجع متطلبات مشاركة البيانات الخارجية قبل إرسال التسلسلات أو عناوين البريد الإلكتروني.
تجنب
- لا ترسل تسلسلات مملوكة إلى BLAST دون موافقة صريحة.
- لا تفترض أن أول مطابقة في قاعدة البيانات صحيحة للأسماء الغامضة.
- لا تستبدل الملفات المهمة بأسماء مخرجات افتراضية.
الأسئلة المتكررة
ما BioServices؟
ما قواعد البيانات التي تغطيها هذه المهارة؟
هل تشغل التحليل محليا فقط؟
هل يمكنني استخدامها مع Claude Code وCodex؟
هل يمكنها تحويل العديد من المعرفات دفعة واحدة؟
هل BLAST اختياري؟
تفاصيل المطور
المؤلف
davila7الترخيص
MIT
مراجعة Skillstore
r2
تنبيه الإصدار
لم يعلن المؤلف عن إصدار.
مرجع
c43861a65bb95efcae259cd161c9d6f4dc7eec6f
حداثة الصيانة
٢٤/٧/٢٠٢٦
الاستخدام
7 تنزيلات · 250 مشاهدات