adaptyv
إرسال تسلسل البروتين للتحقق من صحة مختبر السحابة
متاح أيضًا من: davila7
يتطلب تصميم البروتين تحققاً تجريبياً. يوفر Adaptyv واجهة برمجة تطبيقات للوصول إلى مختبر سحابات للاختبار الآلي للترابط القوي، مستويات التعبير، الاستقرار الحراري، ونشاط الإنزيم. احصل على نتائج تجريبية في حوالي 21 يوماً.
تنزيل ZIP المهارة
رفع في Claude
اذهب إلى Settings → Capabilities → Skills → Upload skill
فعّل وابدأ الاستخدام
اختبرها
استخدام "adaptyv". إرسال تسلسلي جسم مضاد لقياسات الترابط ضد PD-L1
النتيجة المتوقعة:
- تم إرسال التجربة بنجاح
- معرف التجربة: exp_new123xyz
- الحالة: submitted
- الانتهاء المتوقع: 2025-02-07
- الهدف: PD-L1 البشري
استخدام "adaptyv". ما هي حالة تجربة الترابط الخاصة بي؟
النتيجة المتوقعة:
- التجربة: exp_abc123xyz
- الحالة: processing
- التقدم: 65%
- المرحلة الحالية: assay
- التحديث: 2025-01-25T14:30:00Z
استخدام "adaptyv". تحميل و تلخيص نتائج الترابط
النتيجة المتوقعة:
- تم تحميل النتائج: exp_abc123xyz_results.json
- التسلسلات المختبرة: 12
- أفضل رابط: variant_7 (KD: 0.8 nM)
- الثقة: عالية (R-squared: 0.98)
التدقيق الأمني
مخاطر منخفضةAll 304 static findings are FALSE POSITIVES. The skill is legitimate scientific software for protein research. Scanner patterns triggered on: FASTA format headers (protein sequences in markdown code blocks), API calls to official platform endpoints, environment variable usage for API keys (recommended practice), and scientific notation (e.g., binding affinity values like 1.2e-9). No malicious behavior confirmed.
عوامل الخطر
⚡ يحتوي على سكربتات (3)
🌐 الوصول إلى الشبكة (2)
🔑 متغيرات البيئة (2)
درجة الجودة
ماذا يمكنك بناءه
اختبار تقارب الجسم المضاد
إرسال متغيرات الجسم المضاد لقياس الترابط القوي ضد المستضدات المستهدفة وتحديد المرشحين ذوي التقارب العالي.
التحقق من صحة تحسين التسلسل
استخدام الأدوات الحسابية لتصميم متغيرات البروتين، ثم التحقق تجريبياً من تنبؤات التعبير والاستقرار.
تحسين نشاط التحفيز
فحص متغيرات الإنزيم لتحسين معدل الدوران وتقارب الركيزة وحساسية المثبطات.
جرّب هذه الموجهات
إرسال تسلسلات جسدي المضاد إلى Adaptyv لقياسات الترابط ضد PD-L1 البشري. التسلسلات بتنسيق FASTA وأريد قياس قيم KD.
تحقق من حالة التجربة exp_abc123xyz وأخبرني بالمرحلة الحالية وتاريخ الانتهاء المتوقع.
تحميل نتائج من التجربة exp_abc123xyz وتحليل قياسات الترابط في جدول يعرض التسلسل وKD وkon وkoff.
تحسين تسلسلات البروتين الخاصة بي باستخدام NetSolP و SolubleMPNN، ثم إرسال أفضل 50 مرشحاً إلى Adaptyv لاختبار التعبير مع إشعار الويب هوك.
أفضل الممارسات
- فحص التسلسلات مسبقاً باستخدام الأدوات الحسابية (NetSolP، ESM) قبل الإرسال التجريبي لتقليل التكاليف
- استخدام الويب هوك بدلاً من الاستعلام الدوري لإشعارات اكتمال التجربة
- تضمين تسلسلات النوع البري أو المرجعية كضوابط في كل دفعة إرسال
تجنب
- إرسال التسلسلات دون التحقق - تشغيل الفحص الحسابي دائماً أولاً
- الاستعلام الدوري للحالة بدلاً من استخدام الويب هوك - يهدر حصة API ويضيف تأخيراً
- تجاهل متطلبات تنسيق FASTA - التحقق من التسلسلات محلياً قبل الإرسال