drugbank-database
Доступ к базе данных лекарственных препаратов DrugBank
Также доступно от: davila7
DrugBank — это комплексная биоинформатическая база данных, содержащая подробную информацию о лекарственных препаратах. Этот навык обеспечивает программный доступ к свойствам лекарств, взаимодействиям, мишеням, путям и химическим структурам для фармакологических исследований и разработки лекарств.
Скачать ZIP навыка
Загрузить в Claude
Перейдите в Settings → Capabilities → Skills → Upload skill
Включите и начните использовать
Протестировать
Использование «drugbank-database». Получить информацию об ибупрофене, включая его взаимодействия с другими лекарствами
Ожидаемый результат:
- Ибупрофен (DB01050) — одобренный FDA низкомолекулярный НПВС
- Показания: Лечение боли, воспаления и лихорадки
- Механизм действия: Ингибитор циклооксигеназы
- Найдено взаимодействий между лекарствами: 267
- Основные взаимодействия: Варфарин (повышенный риск кровотечения), Аспирин (сниженная кардиопротекция), Литий (повышенные уровни)
- Мишени: Простагландиновые G/H синтазы 1 и 2 (COX-1, COX-2)
Использование «drugbank-database». Найти мишени варфарина, включая их названия генов
Ожидаемый результат:
- Мишень 1: Субъединица 1 комплекса редуктазы эпоксида витамина K (VKORC1) — Ген: VKORC1
- Мишень 2: Цитохром P450 2C9 (CYP2C9) — Ген: CYP2C9
- Мишень 3: Цитохром P450 3A4 (CYP3A4) — Ген: CYP3A4
- Мишень 4: Протромбин (F2) — Ген: F2
- Ферменты: CYP2C9, CYP3A4, CYP1A2, CYP2C19 (метаболизм)
Аудит безопасности
БезопасноThis is a legitimate scientific skill for accessing the DrugBank bioinformatics database. All 353 static findings are FALSE POSITIVES caused by the analyzer misinterpreting Markdown code block syntax and bioinformatics terminology. The skill uses the official drugbank-downloader package for authenticated access to a recognized public database. No actual security risks were identified after manual evaluation.
Факторы риска
⚙️ Внешние команды (3)
🌐 Доступ к сети (2)
📁 Доступ к файловой системе (2)
🔑 Переменные окружения (1)
Оценка качества
Что вы можете построить
Исследование механизма действия лекарств
Извлечение данных о механизме действия, фармакодинамике и ADME для кандидатных лекарств
Анализ безопасности взаимодействий
Проверка взаимодействий лекарств для режимов полипрагмазии и выявление противопоказаний
Перепрофилирование на основе сходства
Поиск структурно похожих лекарств для выявления потенциальных кандидатов для перепрофилирования
Попробуйте эти промпты
Получить информацию о препарате DB00001, включая название, тип, показания и механизм действия
Проверить, есть ли известные взаимодействия между аспирином (DB00945) и варфарином (DB00682)
Найти все белковые мишени для метформина (DB00331) и их идентификаторы UniProt
Найти 5 лекарств, структурно похожих на аспирин, на основе сходства Танимото
Лучшие практики
- Используйте переменные окружения для учётных данных DrugBank, никогда не вставляйте их напрямую
- Указывайте точную версию DrugBank для воспроизводимых исследований
- Кэшируйте разобранные XML-данные, чтобы избежать повторных загрузок и разбора
Избегать
- Использование устаревших версий DrugBank без указания версии
- Игнорирование классификации серьёзности взаимодействий при анализе безопасности
- Доверие прогнозируемым свойствам ADMET без экспериментальной проверки
Часто задаваемые вопросы
Как получить учётные данные для доступа к DrugBank?
Разрешено ли коммерческое использование?
Какие Python-пакеты мне нужны?
Могу ли я искать лекарства по названию?
Как проверить взаимодействия нескольких лекарств?
Какие химические свойства доступны?
Сведения для разработчиков
Автор
K-Dense-AIЛицензия
MIT
Репозиторий
https://github.com/K-Dense-AI/claude-scientific-skills/tree/main/scientific-skills/drugbank-databaseСсылка
main
Структура файлов