المهارات pubchem-database
⚗️

pubchem-database

مخاطر منخفضة 🌐 الوصول إلى الشبكة⚡ يحتوي على سكربتات📁 الوصول إلى نظام الملفات

Поиск химических соединений и свойств в PubChem

متاح أيضًا من: K-Dense-AI

Поиск химической информации требует навигации по множеству баз данных и сложных API-запросов. Этот навык предоставляет единый доступ к базе данных PubChem с простым поиском по названию, структуре или идентификатору, а также получением свойств и поиском по сходству для хемоинформатических рабочих процессов.

يدعم: Claude Code(CC)
🥉 72 برونزي
1

تنزيل ZIP المهارة

2

رفع في Claude

اذهب إلى Settings → Capabilities → Skills → Upload skill

3

فعّل وابدأ الاستخدام

اختبرها

استخدام "pubchem-database". Найди аспирин и покажи его свойства

النتيجة المتوقعة:

  • Соединение: Аспирин (CID 2244)
  • Молекулярная формула: C9H8O4
  • Молекулярная масса: 180.16 г/моль
  • XLogP: 1.19
  • TPSA: 63.60 Ų
  • Доноры H-связей: 1
  • Акцепторы H-связей: 3
  • Канонический SMILES: CC(=O)OC1=CC=CC=C1C(=O)O

استخدام "pubchem-database". Найди соединения, похожие на кофеин

النتيجة المتوقعة:

  • Найдено 10 похожих соединений:
  • CID 2519: Кофеин (100% сходство)
  • CID 71587428: Теобромин (94% сходство)
  • CID 92825: Теофиллин (92% сходство)
  • Все соединения имеют молекулярную массу < 250 и соответствуют правилам Липинского

التدقيق الأمني

مخاطر منخفضة
v5 • 1/17/2026

Legitimate cheminformatics tool that queries the official NCBI PubChem database. All network requests go to pubchem.ncbi.nlm.nih.gov government API. The 269 static findings are false positives: markdown code blocks (backticks) were misidentified as shell commands, chemical identifiers (InChI, InChIKey) were flagged as weak crypto, and HTTP requests to official APIs were marked as network activity. No malicious behavior or command injection risks were found.

5
الملفات التي تم فحصها
1,933
الأسطر التي تم تحليلها
3
النتائج
5
إجمالي عمليات التدقيق

عوامل الخطر

🌐 الوصول إلى الشبكة (1)
⚡ يحتوي على سكربتات (1)
📁 الوصول إلى نظام الملفات (1)
تم تدقيقه بواسطة: claude عرض سجل التدقيق →

درجة الجودة

64
الهندسة المعمارية
100
قابلية الصيانة
85
المحتوى
21
المجتمع
90
الأمان
78
الامتثال للمواصفات

ماذا يمكنك بناءه

Поиск похожих кандидатов в лекарства

Поиск соединений, структурно похожих на известные лекарства, с фильтрацией по лекарственноподобным свойствам.

Получение свойств соединений

Поиск молекулярной массы, LogP и других свойств для известных химических соединений.

Доступ к данным биоактивности

Запрос результатов анализов и поиск соединений с активностью против конкретных биологических мишеней.

جرّب هذه الموجهات

Базовый поиск соединения
Найди в PubChem [название соединения] и покажи его молекулярную формулу, массу и канонический SMILES.
Поиск по сходству
Найди [число] соединений, похожих на [строка SMILES], используя порог Танимото [число].
Поиск по субструктуре
Найди в PubChem соединения, содержащие субструктуру [SMILES], и верни их CID и названия.
Поиск биоактивности
Получи сводку биоактивности для CID [число], показывающую количество анализов и результаты активности.

أفضل الممارسات

  • Используйте CID вместо названий для повторяющихся запросов для повышения скорости и уменьшения неоднозначности
  • Добавляйте задержки 0.2-0.3 секунды между запросами для соблюдения лимитов API
  • Кэшируйте часто запрашиваемые данные о соединениях локально для уменьшения количества вызовов API

تجنب

  • Выполнение больших поисков по субструктуре без ограничения MaxRecords, вызывающее таймауты
  • Игнорирование отсутствующих значений свойств вместо проверки существования свойств для соединения
  • Использование поиска по сходству с очень низкими порогами, возвращающими тысячи результатов

الأسئلة المتكررة

Какие идентификаторы я могу использовать для поиска?
Вы можете искать по химическому названию, CID (идентификатор соединения), SMILES, InChI, InChIKey или молекулярной формуле.
Каково максимальное количество запросов?
PubChem ограничивает запросы до 5 в секунду и 400 в минуту. Добавляйте задержки между запросами, чтобы избежать ограничения скорости.
Могу ли я интегрироваться с другими базами данных?
Этот навык фокусируется только на PubChem. Для других баз данных, таких как ChEMBL или DrugBank, используйте отдельные интеграции.
Сохраняются ли мои данные поиска конфиденциальными?
Поисковые запросы отправляются на серверы NCBI PubChem. Никакие пользовательские данные не хранятся и не передаются в другие места.
Почему поиск по сходству занимает так много времени?
Большие поиски по сходству и субструктуре используют асинхронную обработку, которая может занимать 15-30 секунд.
Как это сравнивается с другими химическими инструментами?
PubChem предлагает крупнейшую бесплатную химическую базу данных. Для специализированных областей рассмотрите ChEMBL (лекарства) или ChEBI (биомолекулы).

تفاصيل المطور

بنية الملفات