Скрининг больших библиотек соединений для поиска кандидатов в лекарственные препараты занимает много времени. Этот навык применяет установленные правила медицинской химии, такие как правило пяти Липинского, фильтры PAINS и структурные оповещения, для автоматического выявления перспективных соединений для дальнейшего изучения.
下载技能 ZIP
在 Claude 中上传
前往 设置 → 功能 → 技能 → 上传技能
开启并开始使用
测试它
正在使用“medchem”。 Check if these SMILES pass drug-likeness rules: CC(=O)OC1=CC=CC=C1C(=O)O, c1ccccc1
预期结果:
- Aspirin (CC(=O)OC1=CC=CC=C1C(=O)O): PASSES Rule of Five, PASSES Veber rules, no PAINS detected
- Benzene (c1ccccc1): FAILS Rule of Five (MW < 200), no alerts but poor drug candidate
正在使用“medchem”。 Filter this compound library for leadlike properties with max 400 complexity
预期结果:
- Applied leadlike strict filter and Bertz complexity threshold
- Results: 127 of 500 compounds passed all filters
- Summary report saved to filtered_compounds_summary.txt
正在使用“medchem”。 Apply NIBR structural alerts and Lilly demerits to flag problematic molecules
预期结果:
- NIBR filter: 89 compounds flagged for structural alerts
- Lilly demerits: 34 compounds exceed 100 demerits threshold
- Top alert patterns: anilines, Michael acceptors, reactive carbonyls
安全审计
安全Pure medicinal chemistry library for molecule filtering. All 286 static findings are false positives: markdown code block delimiters flagged as shell commands, chemical terminology (filter, DES, complexity) mistaken for weak cryptography, and legitimate file I/O for chemical data processing. No network calls, credential access, or malicious behavior detected.
风险因素
质量评分
你能构建什么
Приоритизация результатов виртуального скрининга
Фильтрация больших виртуальных библиотек для выявления лекарственноподобных кандидатов перед экспериментальным тестированием.
Поддержка оптимизации лидеров
Применение более строгих критериев во время оптимизации лидеров для улучшения разрабатываемости соединений.
Контроль качества библиотек
Удаление соединений с реакционноспособными группами или известными паттернами интерференции анализа из скрининговых коллекций.
试试这些提示
Check if this SMILES [SMILES_STRING] passes the Rule of Five and has no PAINS alerts using medchem.
Filter this list of molecules for drug-likeness. Apply rule of five, rule of cns, and flag any with common structural alerts.
Apply leadlike strict criteria and Lilly demerits filter to these compounds. Report which ones pass all filters.
Run a comprehensive medchem analysis on this compound library: apply all relevant rules, check structural alerts, calculate complexity, and generate a summary report.
最佳实践
- Используйте параллелизацию (n_jobs=-1) для больших библиотек для ускорения фильтрации
- Комбинируйте несколько фильтров (правила плюс структурные оповещения) для комплексного контроля качества
- Документируйте, какие соединения были отфильтрованы и почему, для воспроизводимости
避免
- Слепое принятие всех результатов фильтрации без проверки на основе знаний предметной области
- Применение одних и тех же фильтров ко всем классам мишеней без корректировки
- Игнорирование того факта, что многие одобренные лекарства часто нарушают стандартные правила