存取 ChEMBL 資料庫以按結構和屬性搜索化合物。檢索生物活性測量數據,尋找抑制劑,並進行結構-活性關係研究以支援藥物發現研究。
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测试它
正在使用“chembl-database”。 從 ChEMBL 獲取阿司匹林的信息
预期结果:
- ChEMBL ID: CHEMBL25
- Preferred Name: ASPIRIN
- Molecular Weight: 180.16 g/mol
- LogP: 1.19
- Drug Type: Small molecule
- 首次批准: 1930
正在使用“chembl-database”。 查找 IC50 低於 100 nM 的激酶抑制劑
预期结果:
- 檢索到 247 個 IC50 < 100 nM 的激酶抑制劑
- 熱門 hits 包括 Imatinib、Gefitinib 和 Erlotinib 等批准藥物
- 結果按效力排序(最低 IC50 優先)
正在使用“chembl-database”。 查找與咖啡因相似的化合物
预期结果:
- 發現 156 個與咖啡因相似的化合物(>80% 相似度)
- 最相似的化合物:可可鹼 (96%)、茶鹼 (94%)
- 包含天然黃嘌呤衍生物和合成類似物
安全审计
安全All 198 static findings are FALSE POSITIVES. The analyzer misidentified markdown code formatting (backticks) as shell command execution, SMILES chemical notation as shell operators, and documentation URLs as network endpoints. This is a legitimate scientific database integration skill containing only documentation for the ChEMBL Web Resource Client library. The Python example file contains only wrapper functions that call the official chembl_webresource_client library. No executable malicious code or dangerous functionality exists.
风险因素
⚙️ 外部命令 (155)
质量评分
你能构建什么
尋找藥物靶點的抑制劑
通過查詢生物活性測量數據,搜索特定靶點(如 EGFR 或激酶)的強效抑制劑。
分析藥物-靶點相互作用
檢索藥物機制、適應症和活性概況,以了解化合物-靶點關係。
結構-活性關係研究
尋找相似化合物並分析分子屬性,以識別結構-活性模式。
试试这些提示
從 ChEMBL 獲取分子 CHEMBL25(阿司匹林)的信息
查找所有分子量低於 500、LogP 低於 5、氫鍵受體最多 10 個的分子
查找所有 IC50 值低於 100 nM 的 EGFR 抑制劑
查找與阿司匹林 (CC(=O)Oc1ccccc1C(=O)O) 85% 相似的化合物
最佳实践
- 進行重複查詢時使用緩存以遵守速率限制
- 早期應用分子量和 LogP 過濾以減少結果集
- 始終檢查 data_validity_comment 字段以了解潛在問題
避免
- 不遵守速率限制進行快速連續請求
- 比較活性時忽略 pchembl_value 標準化
- 假設 ChEMBL 中的所有化合物都經過實驗驗證
常见问题
什麼是 ChEMBL?
此技能需要 API 密鑰嗎?
有哪些活性值可用?
我可以按化學結構搜索嗎?
結果如何返回?
什麼是類藥性的良好屬性過濾器?
开发者详情
作者
K-Dense-AI许可证
MIT
仓库
https://github.com/K-Dense-AI/claude-scientific-skills/tree/main/scientific-skills/chembl-database引用
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