搜尋藥物發現資料需要查詢多個資料庫並理解複雜的 API 查詢。此技能提供現成可用的功能，用於查詢 ChEMBL 超過 200 萬種生物活性化合物、1900 萬筆生物活性測量數據及核准藥物的資料庫。
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正在使用“chembl-database”。 從 ChEMBL 取得阿斯匹靈的資訊
预期结果:
- 名稱: 阿斯匹靈
- ChEMBL ID: CHEMBL25
- 分子量: 180.16 g/mol
- 化學式: C9H8O4
- 藥物類型: 小分子
- 最大階段: 核准
正在使用“chembl-database”。 找出 IC50 低於 100 nM 的激酶抑制劑
预期结果:
- 搜尋 10 個激酶標靶
- 找到 234 個 IC50 <= 100 nM 的化合物
- 熱門匹配: Sunitinib、Imatinib、Erlotinib
- 範圍: 2.4 - 98.7 nM 活性數值
正在使用“chembl-database”。 搜尋與咖啡因相似的化合物
预期结果:
- 查詢: 咖啡因 SMILES (CN1C=NC2=C1C(=O)N(C(=O)N2C)C)
- 找到 12 個相似度 85% 的化合物
- 最佳匹配: 可可鹼 (96% 相似)
- 所有匹配皆為甲基黃嘌呤衍生物
安全审计
低风险All 186 static findings are FALSE POSITIVES. The skill is a legitimate scientific documentation package for querying the ChEMBL database via the official chembl_webresource_client Python library. All detected 'backtick execution' patterns are markdown code formatting syntax, not shell commands. Hardcoded URLs point to official EBI/ChEMBL resources. No malicious patterns found in actual code.
低风险问题 (1)
风险因素
🌐 网络访问 (1)
⚡ 包含脚本 (1)
质量评分
你能构建什么
尋找標靶抑制劑
透過查詢 IC50 值低於 100 nM 的生物活性數據，識別強效激酶抑制劑
探索藥物重新定位
查找核准藥物並找出其標靶作用機制、適應症和生物活性概況
SAR 研究工作流程
依結構找出相似化合物，並分析分子屬性如何與活性相關聯
试试这些提示
使用 ChEMBL 技能取得阿斯匹靈 (CHEMBL25) 的資訊，包括其分子屬性和優先名稱
搜尋 ChEMBL 中分子量低於 500 且 LogP 低於 5 的分子
查詢 EGFR 標靶 (CHEMBL203) 的生物活性數據，找出所有 IC50 值低於 100 nM 的化合物
找出與阿斯匹靈 (CC(=O)Oc1ccccc1C(=O)O) 相似度至少 85% 的化合物
最佳实践
- 使用快取來減少重複的 API 呼叫並遵守 ChEMBL 速率限制
- 透過分子屬性如 MW 和 LogP 進行篩選，以找到類藥化合物
- 將結果轉換為 pandas DataFrames 以進行統計分析
避免
- 在沒有實作速率限制的情況下進行快速連續請求
- 忽略資料有效性標誌和結果中可能的重複標記
- 在比較生物活性數值時忘記檢查單位 (nM、uM)