brenda-database
Запрос данных о ферментах из базы данных BRENDA
متاح أيضًا من: davila7
Получите доступ к комплексным данным о кинетике ферментов из крупнейшей в мире базы данных ферментов. Найдите значения Km, уравнения реакций, параметры, специфичные для организмов, и данные о специфичности субстратов для биохимических исследований и метаболической инженерии.
تنزيل ZIP المهارة
رفع في Claude
اذهب إلى Settings → Capabilities → Skills → Upload skill
فعّل وابدأ الاستخدام
اختبرها
استخدام "brenda-database". Get Km values for alcohol dehydrogenase (EC 1.1.1.1) for human and yeast
النتيجة المتوقعة:
- Alcohol Dehydrogenase (EC 1.1.1.1) Kinetic Data:
- Homo sapiens:
- - Average Km: 0.34 mM (ethanol)
- - Optimal pH: 8.0-9.0
- - Temperature: 25C (data points: 15)
- Saccharomyces cerevisiae:
- - Average Km: 1.2 mM (ethanol)
- - Optimal pH: 7.0-8.0
- - Temperature: 30C (data points: 8)
- Cofactors: NAD+ required for both organisms
التدقيق الأمني
مخاطر منخفضةThe brenda-database skill is a legitimate scientific tool for accessing enzyme data from the BRENDA database. All 436 static findings are false positives triggered by documentation formatting (backtick characters for code blocks), legitimate BRENDA API authentication (SHA-256 password hashing), and biochemical terminology (NAD+, ATP as cofactors, not C2 commands). The codebase performs authorized SOAP API queries to a public scientific database and exports research data. No malicious behavior, data exfiltration, or unauthorized access patterns were found.
عوامل الخطر
🌐 الوصول إلى الشبكة (1)
📁 الوصول إلى نظام الملفات (1)
⚡ يحتوي على سكربتات (1)
درجة الجودة
ماذا يمكنك بناءه
Анализ кинетики ферментов
Получить значения Km и kcat для характеристики поведения ферментов и сравнения между организмами.
Проектирование метаболических путей
Найти ферменты для конкретных реакций и оптимизировать условия для построения метаболических путей.
Извлечение данных из литературы
Извлечь параметры ферментов из опубликованных данных BRENDA для вычислительного моделирования и анализа.
جرّب هذه الموجهات
Get Km values for alcohol dehydrogenase (EC 1.1.1.1) from BRENDA.
Find Km values for EC 1.1.1.1 in Escherichia coli and Homo sapiens.
Find all reactions involving glucose and their enzyme EC numbers.
Find the enzymatic pathway to produce lactate from pyruvate including all required cofactors.
أفضل الممارسات
- Храните учетные данные BRENDA в переменных окружения для безопасной аутентификации
- Добавляйте задержки между вызовами API (0,5-1 секунда) для соблюдения ограничений скорости
- Используйте конкретные номера EC и фильтры по организмам для уменьшения объема данных и улучшения времени ответа
تجنب
- Выполнение параллельных API-запросов без задержек приведет к срабатыванию ограничения скорости
- Использование подстановочных знаков для широких поисков без ограничения результатов может возвращать огромные наборы данных
- Отсутствие кэширования результатов для повторных запросов тратит квоту API и замедляет производительность
الأسئلة المتكررة
Нужна ли учетная запись BRENDA?
Что такое номер EC?
Что означает Km?
Сколько запросов я могу сделать?
Какие форматы данных поддерживаются?
Можно ли искать по организму?
تفاصيل المطور
المؤلف
K-Dense-AIالترخيص
MIT
المستودع
https://github.com/K-Dense-AI/claude-scientific-skills/tree/main/scientific-skills/brenda-databaseمرجع
main
بنية الملفات