brenda-database
Запрос базы данных ферментов BRENDA для получения кинетических данных
也可從以下取得: K-Dense-AI
Поиск кинетических параметров ферментов в литературе требует обширного поиска. Этот навык обеспечивает прямой доступ к базе данных BRENDA через простой интерфейс для получения значений Km, уравнений реакций и специфичных для организмов данных о ферментах для биохимических исследований.
下載技能 ZIP
在 Claude 中上傳
前往 設定 → 功能 → 技能 → 上傳技能
開啟並開始使用
測試它
正在使用「brenda-database」。 Get Km values for alcohol dehydrogenase in yeast
預期結果:
- Alcohol dehydrogenase (EC 1.1.1.1) in Saccharomyces cerevisiae:
- Km for ethanol: 1.2 mM (pH 7.4, 25C)
- Km for acetaldehyde: 0.8 mM (pH 7.0, 30C)
- Data points available: 15 entries from literature
安全審計
低風險Legitimate scientific research tool for accessing the BRENDA enzyme database via SOAP API. All static findings are false positives: markdown documentation backticks flagged as shell execution, EC numbers (enzyme classification) misidentified as IP addresses, SHA-256 password hashing is secure, and biochemistry cofactor names (NAD, NADH) flagged as C2 keywords are legitimate metabolite names. The skill only accesses environment variables for API credentials and makes documented SOAP calls to brenda-enzymes.org.
風險因素
🌐 網路存取 (1)
📁 檔案系統存取 (1)
🔑 環境變數 (1)
品質評分
你能建構什麼
Поиск кинетических параметров
Поиск значений Km для экспериментов по характеризации ферментов
Проектирование путей
Поиск кандидатов в ферменты для построения метаболических путей
Сравнение литературы
Сравнение свойств ферментов у разных организмов для публикаций
試試這些提示
Get Km values for EC number 1.1.1.1 (alcohol dehydrogenase) for Escherichia coli and Saccharomyces cerevisiae
Find enzymes that act on glucose and show their Km values and organisms
Compare the kinetic parameters of hexokinase (EC 2.7.1.1) across human, yeast, and E. coli
Find a pathway to produce lactate starting from glucose including all enzyme EC numbers
最佳實務
- Кэшировать часто запрашиваемые данные о ферментах для уменьшения вызовов API
- Использовать специфичные фильтры по организму и субстрату для сужения результатов
- Корректно обрабатывать отсутствующие данные, так как не все ферменты имеют полные записи
- Реализовать задержки между запросами для соблюдения ограничений скорости
避免
- Выполнение быстрых последовательных вызовов API без ограничения скорости
- Предположение, что все кинетические параметры существуют для каждого фермента
- Использование навыка без действительных учетных данных BRENDA
- Экспорт больших наборов данных без предварительной фильтрации