Les équipes de bioinformatique ont besoin de workflows reproductibles, d’une gestion des données et de paramètres de ressources sur Latch. Cette compétence guide la création de workflows, leur déploiement, l’utilisation du Registry et l’intégration de pipelines vérifiés.

Les équipes de recherche ont besoin de moyens fiables pour gérer les données de cahiers électroniques de laboratoire via l'API LabArchives. Cette skill guide la configuration, les sauvegardes, la création d'entrées, les téléversements de pièces jointes et la planification des intégrations.

Les travaux de bioinformatique nécessitent souvent des correspondances de voies biologiques, de gènes, de composés et de médicaments issues de KEGG. Cette compétence aide Claude, Codex et Claude Code à interroger les KEGG REST APIs et à interpréter les résultats.

Les équipes informatiques ont besoin de conseils cohérents pour les incidents, la surveillance, l’automatisation et la reprise. Cette skill fournit des runbooks structurés, des cadres de décision et des modèles opérationnels.

Les vérifications échouées et les commentaires de revue dispersés ralentissent le travail sur les pull requests. Cette skill guide Claude, Codex et Claude Code dans une boucle répétable de correction, push et vérification.

Les équipes Healthcare et MedTech ont besoin de programmes de sécurité ISO 27001 structurés qui relient les risques, les contrôles, les incidents et les audits. Cette compétence guide la planification de l'ISMS, l'évaluation des risques, la sélection des contrôles et la préparation à la certification à l'aide d'ISO 27001 et d'ISO 27002.

Les travaux de métabolomique nécessitent souvent de vérifier l’identité des métabolites, les spectres, les voies métaboliques et le contexte clinique dans de nombreux enregistrements. Cette compétence guide Claude, Codex et Claude Code dans les workflows de recherche, de téléchargement et d’interprétation HMDB.

Les chercheurs en génétique ont besoin d’un accès fiable à des associations SNP-caractère sélectionnées et à des statistiques récapitulatives. Cette compétence guide Claude, Codex et Claude Code dans les recherches au sein du GWAS Catalog et les processus utilisant les API.

Les workflows d’intervalles génomiques ont besoin d’outils rapides pour le chevauchement, la couverture et la tokenisation. Cette compétence guide Claude, Codex et Claude Code dans les APIs gtars et les workflows CLI.

Les vérifications de PR échouées ralentissent la livraison lorsque les journaux sont difficiles à inspecter. Cette compétence guide Claude, Codex ou Claude Code dans le triage, la planification et les corrections approuvées de GitHub Actions.

Les commentaires de revue peuvent être difficiles à suivre dans une pull request très active. Cette compétence guide Claude, Codex ou Claude Code pour trouver les commentaires, choisir les corrections et appliquer les changements avec GitHub CLI.

La recherche en bioinformatique nécessite souvent de nombreuses requêtes dans des bases de données et l'utilisation de multiples formats de fichiers. Cette compétence guide Claude, Codex et Claude Code dans l'utilisation des commandes gget et des flux de travail Python.

Les tâches scientifiques échouent lorsque les limites de ressources sont inconnues. Cette compétence détecte la capacité locale en CPU, GPU, mémoire et disque, et recommande des stratégies de calcul adaptées.

Le travail géospatial échoue souvent lorsque les formats de fichiers, les systèmes de coordonnées et les opérations spatiales ne sont pas clairs. Cette skill fournit des modèles GeoPandas pour charger des données, transformer le CRS, analyser la géométrie et créer des cartes.

Les jeux de données publics de GEO sont difficiles à rechercher, à télécharger et à préparer de manière cohérente. Cette compétence guide Claude, Codex et Claude Code dans les workflows de recherche, de récupération et d’analyse transcriptomique de NCBI GEO.

Les projets d'intervalles génomiques nécessitent un prétraitement cohérent, l'entraînement d'embeddings et la construction d'univers. Cette skill guide les workflows Geniml pour les fichiers BED, les données scATAC-seq et l'évaluation de modèles.

Les recherches de gènes nécessitent souvent des appels répétés à l’API de NCBI et des filtres précis sur les organismes. Cette compétence fournit des scripts et des workflows pour rechercher, récupérer et traiter par lots les annotations génétiques.

Les équipes ont besoin de revues structurées de conformité en matière de confidentialité couvrant les obligations du RGPD et du DSGVO allemand. Cette skill guide les évaluations, la planification des DPIA, les workflows relatifs aux droits, la préparation aux audits et les contrôles de gouvernance.

Les simulations de dynamique des fluides nécessitent des choix soigneux de solveurs, de paramètres et de workflows de sortie. Cette compétence guide Claude, Codex et Claude Code dans la configuration de FluidSim, la configuration des simulations, l’exécution et l’analyse.

Les fichiers FCS peuvent être difficiles à inspecter, convertir et réparer dans les workflows Python. Cette skill guide Claude, Codex et Claude Code dans l’analyse FlowIO, l’extraction des métadonnées et l’export FCS.