Habilidades opentargets-database
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opentargets-database

Seguro 🌐 Acceso a red

Consultar Open Targets para objetivos terapéuticos

También disponible en: davila7

Encuentra objetivos terapéuticos y candidatos a fármacos utilizando datos de Open Targets Platform. Accede a evidencia genética, evaluaciones de tractabilidad, datos de seguridad y fármacos conocidos para asociaciones objetivo-enfermedad.

Soporta: Claude Codex Code(CC)
🥉 76 Bronce
1

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2

Subir en Claude

Ve a Configuración → Capacidades → Skills → Subir skill

3

Activa y empieza a usar

Pruébalo

Usando "opentargets-database". Find targets for Alzheimer's disease with genetic evidence

Resultado esperado:

  • BRCA1 - asociado con puntuación 0.85, evidencia de GWAS y asociación genética
  • PICALM - tractabilidad: potencialmente druggable, seguridad: no se han reportado responsabilidades
  • CLU - fármacos conocidos: ninguno en ensayos clínicos, datos de expresión disponibles

Auditoría de seguridad

Seguro
v4 • 1/17/2026

All 150 static findings are false positives. The skill is a legitimate bioinformatics library with no shell commands, no cryptographic operations, and no malicious network behavior. Backticks flagged in markdown are code formatting delimiters, not Ruby/shell execution. Network requests target only the public Open Targets GraphQL API for therapeutic target research.

6
Archivos escaneados
2,456
Líneas analizadas
1
hallazgos
4
Auditorías totales

Factores de riesgo

🌐 Acceso a red (1)
scripts/query_opentargets.py:40
Auditado por: claude Ver historial de auditorías →

Puntuación de calidad

68
Arquitectura
100
Mantenibilidad
81
Contenido
29
Comunidad
100
Seguridad
83
Cumplimiento de la especificación

Lo que puedes crear

Identificar nuevos objetivos

Encuentra posibles objetivos terapéuticos para una enfermedad consultando evidencia genética y datos de tractabilidad.

Referencia cruzada de evidencia

Reúne evidencia de respaldo para enlaces objetivo-enfermedad desde múltiples fuentes de datos y tipos de evidencia.

Encontrar reutilización de fármacos

Identifica fármacos existentes para una enfermedad que podrían ser reutilizados basándose en los mecanismos de los objetivos.

Prueba estos prompts

Encontrar genes objetivo 
Encuentra genes asociados con [DISEASE] que tengan buena evidencia genética y datos de tractabilidad.
Obtener detalles de evidencia 
¿Qué evidencia respalda la asociación entre [GENE] y [DISEASE]?
Verificar opciones de fármacos 
Lista los fármacos conocidos para [DISEASE] y sus fases de ensayos clínicos.
Comparar objetivos 
Compara tractabilidad, seguridad y restricción genética para [GENE1] y [GENE2].

Mejores prácticas

  • Comienza con la evidencia genética como el indicador más fuerte de relevancia de enfermedad
  • Considera múltiples tipos de evidencia para tener confianza en la selección de objetivos
  • Revisa las evaluaciones de tractabilidad antes de priorizar objetivos
  • Revisa las responsabilidades de seguridad para posibles preocupaciones de toxicidad

Evitar

  • Usar puntuaciones de asociación como medidas de confianza absolutas
  • Confiar en una única fuente de evidencia para decisiones críticas
  • Ignorar enfermedades poco estudiadas que pueden tener puntuaciones más bajas
  • Olvidar la cita correcta de Open Targets Platform en publicaciones

Preguntas frecuentes

¿Qué es Open Targets Platform?
Una base de datos pública que integra genética, ómics y datos de literatura para la identificación de objetivos terapéuticos.
¿Necesito acceso a la API?
No se requiere autenticación. La API GraphQL es de acceso libre para uso investigador y comercial.
¿Qué entidades puedo consultar?
Objetivos (genes), enfermedades (IDs EFO) y fármacos (IDs ChEMBL) con anotaciones exhaustivas.
¿Cómo filtrar por tipo de evidencia?
Usa el parámetro data_types en get_target_disease_evidence para filtrar categorías de evidencia.
¿Qué son las puntuaciones de asociación?
Clasificaciones relativas de fuerza de evidencia de 0-1, no medidas de confianza absolutas.
¿Con qué frecuencia se actualizan los datos?
Open Targets Platform se actualiza trimestralmente con nuevos lanzamientos de datos.

Detalles del desarrollador

Licencia

MIT

Repositorio

https://github.com/K-Dense-AI/claude-scientific-skills/tree/main/scientific-skills/opentargets-database

Ref.

main

Estructura de archivos

📁 references/

📄 api_reference.md

📄 evidence_types.md

📄 target_annotations.md

📁 scripts/

📄 query_opentargets.py

📄 SKILL.md