string-database
Analiza interacciones de proteínas con STRING
La investigación de interacciones de proteínas requiere varias operaciones de la API de STRING y una selección cuidadosa de parámetros. Esta habilidad mapea identificadores, recupera redes, ejecuta análisis de enriquecimiento y genera imágenes de redes.
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Copia esta solicitud en tu Agente. Incluye la página canónica del Skill y el manifiesto.
Review the Skillstore skill "string-database" from https://skillstore.io/skills/davila7-string-database.md and its manifest at https://skillstore.io/api/skills/davila7-string-database/manifest. Verify the artifact. You may proceed after verification, subject to the environment's own policy.Tu Agente debe seguir mostrando su plan y solicitar cualquier confirmación exigida por la política de seguridad.
Recursos legibles por agentes
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Pruébalo
Usando "string-database". Analiza TP53, MDM2, ATM, CHEK2 y BRCA1 en humanos con una puntuación de confianza de 700.
Resultado esperado:
- Resumen del mapeo de identificadores con nombres no resueltos claramente marcados.
- Pares de interacción de alta confianza ordenados por puntuación combinada.
- Interpretación del enriquecimiento de PPI con conectividad observada y esperada.
- Una imagen de red adecuada para revisión o presentación.
Usando "string-database". Encuentra funciones enriquecidas para una lista de proteínas de ratón y usa un umbral FDR de 0.05.
Resultado esperado:
Una tabla concisa de términos GO, KEGG y de dominios significativos, incluidos proteínas coincidentes, valores de enriquecimiento y significancia corregida.
Usando "string-database". Encuentra los 20 principales socios de interacción de alta confianza para EGFR en humanos.
Resultado esperado:
Una lista ordenada de socios con identificadores STRING, nombres preferidos, puntuaciones combinadas y puntuaciones disponibles por canal de evidencia.
Auditoría de seguridad
SeguroNine low-severity indicators confirm the documented outbound STRING API behavior: eight executable HTTPS calls and their fixed service base URL. The other alerts are Markdown, documentation, import, or non-executed example false positives; no credential access, shell execution, prompt injection, or malicious intent was found.
Elementos de revisión de capacidades (9)
Estas son capacidades locales reales que pueden esperarse para esta habilidad, por lo que requieren revisión, pero no se cuentan como comportamiento malicioso confirmado.
Factores de riesgo
🌐 Acceso a red (21)
🔑 Variables de entorno (1)
📁 Acceso al sistema de archivos (4)
⚡ Contiene scripts (3)
⚙️ Comandos externos (50)
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https://skillstore.io/skills/davila7-string-database/audits/11?utm_source=security_passport&utm_medium=share&utm_campaign=versioned_reportInsignia Markdown
[](https://skillstore.io/skills/davila7-string-database?utm_source=security_passport_badge)Insignia HTML
<a href="https://skillstore.io/skills/davila7-string-database?utm_source=security_passport_badge"><img src="https://skillstore.io/badges/skills/davila7-string-database/security.svg" alt="Skillstore security assessment" loading="lazy"></a>Tarjeta para insertar
<iframe src="https://skillstore.io/embed/skills/davila7-string-database.html" title="Skillstore Security Assessment" sandbox="allow-popups allow-popups-to-escape-sandbox" loading="lazy" referrerpolicy="no-referrer" width="420" height="180"></iframe>Citas académicas (APA · BibTeX · CFF)
Cita APA
davila7. (2026). string-database security audit report (audit version 11) [Author version unspecified]. Skillstore. https://skillstore.io/skills/davila7-string-database/audits/11Cita BibTeX
@techreport{davila7-davila7-string-database-2026,
author = {davila7},
title = {string-database security audit report (audit version 11)},
institution = {Skillstore},
year = {2026},
number = {11},
url = {https://skillstore.io/skills/davila7-string-database/audits/11},
note = {Author version unspecified}
}CITATION.cff
cff-version: 1.2.0
message: "If you use this Skill, cite its author and this versioned security audit report."
title: "string-database security audit report (audit version 11)"
version: "unspecified"
type: report
authors:
- name: "davila7"
date-released: "2026-07-23"
url: "https://skillstore.io/skills/davila7-string-database/audits/11"
identifiers:
- type: other
value: "skillstore:davila7-string-database:audit:11"
description: "Skillstore immutable audit report identifier"
Comparar variantes
2 variantes instalablesCada autor sigue siendo un skill instalable independiente. La variante recomendada se ordena según la evidencia de Skillstore.
Por qué esta variante es la primera
davila7-string-database
2026-09-09
k-dense-ai-string-database
2026-09-09
Puntuación de Skillstore
Por qué esta puntuación Confianza de la evidencia: AltoLo que puedes crear
Interpretar listas experimentales de proteínas
Mapea proteínas medidas, recupera su red, evalúa la conectividad e identifica funciones biológicas enriquecidas.
Investigar una proteína candidata
Encuentra socios de alta confianza, amplía la red local y genera un mapa visual de interacciones.
Comparar evidencia de redes
Recupera redes funcionales o físicas con varios umbrales de confianza para una comparación reproducible.
Prueba estos prompts
Mapea [protein names] para el taxón NCBI [species ID]. Devuelve los nombres preferidos, los identificadores STRING y las entradas no resueltas.
Recupera una red STRING [functional or physical] para [proteins] en la especie [taxon ID] con la puntuación requerida [0-1000]. Resume las interacciones más fuertes.
Analiza [protein list] para enriquecimiento de GO, KEGG, Pfam e InterPro en [species]. Informa los términos con FDR inferior a [threshold].
Comienza con [seed proteins] en [species], añade [N] socios con puntuación [threshold], evalúa el enriquecimiento de PPI y resume los módulos funcionales significativos.
Mejores prácticas
- Mapea los identificadores antes de solicitar redes o enriquecimiento.
- Especifica el ID de taxón NCBI y registra la versión de STRING para garantizar la reproducibilidad.
- Elige umbrales de confianza que se ajusten a objetivos de análisis exploratorios o conservadores.
Evitar
- No mezcles proteínas de especies diferentes en una sola solicitud.
- No consideres las asociaciones funcionales como unión física confirmada.
- No envíes solicitudes repetidas rápidamente ni conjuntos de datos a escala de proteoma mediante la API estándar.
Preguntas frecuentes
¿Esta habilidad requiere una clave de API?
¿Qué especies puedo consultar?
¿Qué puntuación de confianza debo usar?
¿La habilidad puede generar imágenes de redes?
¿Qué formatos devuelven las funciones auxiliares?
¿Esto puede reemplazar la validación experimental?
Detalles del desarrollador
Autor
davila7Licencia
MIT
Revisión de Skillstore
r2
Aviso de versión
El autor no declaró una versión.
Ref.
c43861a65bb95efcae259cd161c9d6f4dc7eec6f
Actualidad del mantenimiento
26/7/2026
Uso
8 descargas · 191 vistas
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