string-database
Consultar base de datos de interacciones proteicas STRING
또한 다음에서 사용할 수 있습니다: K-Dense-AI
Accede a redes de interacciones proteína-proteína desde la base de datos STRING que cubre 59M proteínas y 20B interacciones. Realiza análisis de enriquecimiento funcional, descubre socios de interacción y genera visualizaciones de redes para investigación en biología de sistemas.
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토글을 켜고 사용 시작
테스트해 보기
"string-database" 사용 중입니다. Get interaction partners for TP53
예상 결과:
- Principales interactores de TP53: MDM2 (puntuación 999), MDM4 (puntuación 995), ATM (puntuación 957)
- MDM2 es el interactor más fuerte con evidencia experimental
"string-database" 사용 중입니다. Enrich BRCA1 gene list
예상 결과:
- Reparación de ADN (GO:0006281) FDR: 1.2e-15
- Ciclo celular (GO:0007049) FDR: 3.4e-12
- Recombinación homóloga (GO:0000724) FDR: 8.9e-10
"string-database" 사용 중입니다. Create network image
예상 결과:
- Imagen de red generada mostrando conexiones de TP53, ATM, CHEK2, BRCA1
- Aristas coloreadas por tipo de evidencia, grosor por puntuación de confianza
보안 감사
안전All static findings are false positives. External command detections are markdown code fences, network access is to legitimate STRING database API, filesystem operations save visualization images, and heuristic alerts are standard API client patterns. No malicious intent detected.
위험 요인
🌐 네트워크 접근 (1)
📁 파일 시스템 액세스 (1)
품질 점수
만들 수 있는 것
Análisis de interacciones proteicas
Analizar redes de proteínas para listas de genes provenientes de experimentos de proteómica o RNA-seq
Enriquecimiento de rutas
Identificar términos GO y rutas KEGG enriquecidos en conjuntos de proteínas
Descubrimiento de socios de interacción
Encontrar y visualizar proteínas que interactúan con una proteína de interés
이 프롬프트를 사용해 보세요
Use string-database to get the interaction network for TP53 and MDM2 at high confidence (score 700)
Perform GO and KEGG enrichment analysis on these proteins: TP53, BRCA1, ATM, CHEK2, MDM2
Create a confidence-colored network image for these cancer genes and save as png
Check if these proteins form a significantly connected module: BRCA1, BRCA2, PALB2, RAD51, ATM
모범 사례
- Mapear nombres de genes a IDs de STRING primero para consultas más rápidas
- Usar umbral de puntuación de confianza apropiado para tus objetivos de análisis
- Esperar 1 segundo entre llamadas a la API para respetar límites de tasa
피하기
- No usar umbrales de confianza bajos para figuras de publicación
- No omitir el parámetro de especie para listas grandes de proteínas
- No omitir verificación de errores al analizar respuestas de la API