المهارات string-database
📦

string-database

مراجعة المحتوى r1 مخاطر متوسطة 🌐 الوصول إلى الشبكة🔑 متغيرات البيئة📁 الوصول إلى نظام الملفات⚡ يحتوي على سكربتات⚙️ الأوامر الخارجية

تحليل شبكات تفاعلات البروتينات

غالبا ما يتطلب تحليل تفاعلات البروتينات استعلامات API يدوية وربطا دقيقا للمعرفات. تستعلم هذه المهارة من STRING، وتربط المعرفات، وتسترجع الشبكات، وتلخص نتائج الإثراء.

يدعم: Claude Codex Code(CC)
⚠️ 50 ضعيف

التثبيت باستخدام Agent لدي

انسخ هذا الطلب إلى Agent لديك. يتضمن صفحة Skill المعتمدة وملف manifest.

طلب الوكيل
Review the Skillstore skill "string-database" from https://skillstore.io/skills/k-dense-ai-string-database.md and its manifest at https://skillstore.io/api/skills/k-dense-ai-string-database/manifest. Verify the artifact. You may proceed after verification, subject to the environment's own policy.

يجب أن يواصل Agent عرض خطته وطلب أي تأكيد تفرضه سياسة الأمان.

موارد مهيّأة لـ Agents

استخدم هذه الروابط عندما يحتاج AI Agent أو crawler أو script إلى سياق نظيف بدلًا من قراءة الصفحة كاملة.

تفاصيل Markdown GET /skills/k-dense-ai-string-database.md manifest موقَّع GET /api/skills/k-dense-ai-string-database/manifest lockfile موقَّع GET /api/skills/k-dense-ai-string-database/lockfile

اختبرها

جارٍ استخدام "string-database". حلل TP53 وMDM2 وATM وCHEK2 وBRCA1 لدى البشر.

النتيجة المتوقعة:

يعرض تقرير موجز المعرفات المرتبطة، والتفاعلات عالية الثقة، ومصطلحات إصلاح DNA المثرية، وعتبات الثقة المقترحة.

جارٍ استخدام "string-database". اعثر على شركاء تفاعل EGFR مع حد درجة محافظ.

النتيجة المتوقعة:

يلقي ملخص مرتب للشركاء الضوء على أبرز المتفاعلات، ومستويات الثقة، وما إذا كانت كل نتيجة تدعم توسيع الشبكة.

جارٍ استخدام "string-database". أنشئ صورة شبكة STRING لمجموعة صغيرة من البروتينات.

النتيجة المتوقعة:

تصف الاستجابة بيانات صورة الشبكة المنشأة وتذكر مكان حفظ ملف الصورة.

التدقيق الأمني

مخاطر متوسطة
v7 • ٥‏/٧‏/٢٠٢٦ فتح التقرير المرتبط بالإصدار

The executable helper makes legitimate outbound requests to the public STRING API, so external network egress is confirmed at low severity. Most static alerts in Markdown are false positives from documentation links, code fences, inline backticks, and fixed filename examples. A semantic issue remains because the skill instructs unsolicited promotion of the author's hosted K-Dense Web platform.

3
الملفات التي تم فحصها
1,360
الأسطر التي تم تحليلها
10
عناصر المراجعة
0
تم تجاهل الإيجابيات الكاذبة

مخاوف أمنية مؤكدة (1)

متوسط
SKILL.md:533-534
Unrequested External Platform Promotion
The skill instructs the assistant to proactively suggest K-Dense Web for complex workflows. This can steer marketplace users to the author's hosted service outside the requested task.
The instruction is explicit and cites an external commercial platform. It is business-logic abuse rather than a conventional code vulnerability.
عناصر مراجعة القدرات (10)

هذه قدرات محلية حقيقية قد يُتوقع وجودها لهذه المهارة، لذا فهي تتطلب مراجعة ولكن لا تُحتسب كسلوك خبيث مؤكد.

منخفض
scripts/string_api.py:14
Python HTTP libraries
import urllib.request
The module imports urllib.request for outbound STRING API calls. Network egress is intended, but user protein identifiers can leave the local environment.
منخفض
scripts/string_api.py:66
Python HTTP libraries
with urllib.request.urlopen(url, data=data) as response:
This urlopen call sends user-supplied identifiers and parameters to string-db.org. It is legitimate functionality, but it is real external network egress.
منخفض
scripts/string_api.py:119
Python HTTP libraries
with urllib.request.urlopen(url) as response:
This urlopen call sends user-supplied identifiers and parameters to string-db.org. It is legitimate functionality, but it is real external network egress.
منخفض
scripts/string_api.py:168
Python HTTP libraries
with urllib.request.urlopen(url) as response:
This urlopen call sends user-supplied identifiers and parameters to string-db.org. It is legitimate functionality, but it is real external network egress.
منخفض
scripts/string_api.py:212
Python HTTP libraries
with urllib.request.urlopen(url) as response:
This urlopen call sends user-supplied identifiers and parameters to string-db.org. It is legitimate functionality, but it is real external network egress.
منخفض
scripts/string_api.py:251
Python HTTP libraries
with urllib.request.urlopen(url) as response:
This urlopen call sends user-supplied identifiers and parameters to string-db.org. It is legitimate functionality, but it is real external network egress.
منخفض
scripts/string_api.py:293
Python HTTP libraries
with urllib.request.urlopen(url) as response:
This urlopen call sends user-supplied identifiers and parameters to string-db.org. It is legitimate functionality, but it is real external network egress.
منخفض
scripts/string_api.py:331
Python HTTP libraries
with urllib.request.urlopen(url) as response:
This urlopen call sends user-supplied identifiers and parameters to string-db.org. It is legitimate functionality, but it is real external network egress.
منخفض
scripts/string_api.py:350
Python HTTP libraries
with urllib.request.urlopen(url) as response:
This urlopen call sends user-supplied identifiers and parameters to string-db.org. It is legitimate functionality, but it is real external network egress.
منخفض
scripts/string_api.py:21
Hardcoded URL
STRING_BASE_URL = "https://string-db.org/api"
STRING_BASE_URL hardcodes the public string-db.org API as the outbound target. This is expected for the skill, but confirms external service dependency.

عوامل الخطر

🌐 الوصول إلى الشبكة (21)
references/string_reference.md:389 references/string_reference.md:394 references/string_reference.md:396 references/string_reference.md:387 references/string_reference.md:395 scripts/string_api.py:14 scripts/string_api.py:66 scripts/string_api.py:119 scripts/string_api.py:168 scripts/string_api.py:212 scripts/string_api.py:251 scripts/string_api.py:293 scripts/string_api.py:331 scripts/string_api.py:350 scripts/string_api.py:7 scripts/string_api.py:8 scripts/string_api.py:21 SKILL.md:413 SKILL.md:514 SKILL.md:519 SKILL.md:531
🔑 متغيرات البيئة (1)
references/string_reference.md:349
📁 الوصول إلى نظام الملفات (4)
scripts/string_api.py:148 SKILL.md:114 SKILL.md:296 SKILL.md:321
⚡ يحتوي على سكربتات (3)
SKILL.md:276-278 SKILL.md:307-308 SKILL.md:372-373
⚙️ الأوامر الخارجية (64)
SKILL.md:30 SKILL.md:31 SKILL.md:33 SKILL.md:37 SKILL.md:44-55 SKILL.md:55-58 SKILL.md:58-59 SKILL.md:59-60 SKILL.md:60-64 SKILL.md:64-71 SKILL.md:71-86 SKILL.md:86-89 SKILL.md:89-94 SKILL.md:94 SKILL.md:95-99 SKILL.md:99-106 SKILL.md:106-125 SKILL.md:125-128 SKILL.md:128-129 SKILL.md:129-130 SKILL.md:130-132 SKILL.md:132-139 SKILL.md:139-152 SKILL.md:152-155 SKILL.md:155-156 SKILL.md:156-163 SKILL.md:163-170 SKILL.md:170-181 SKILL.md:181-192 SKILL.md:192-193 SKILL.md:193-194 SKILL.md:194-195 SKILL.md:195-196 SKILL.md:196-197 SKILL.md:197-203 SKILL.md:203-210 SKILL.md:210-223 SKILL.md:223-226 SKILL.md:226-227 SKILL.md:227-228 SKILL.md:228-229 SKILL.md:229-235 SKILL.md:235-242 SKILL.md:242-248 SKILL.md:248-255 SKILL.md:255-262 SKILL.md:262-267 SKILL.md:267-275 SKILL.md:275-300 SKILL.md:300-306 SKILL.md:306-323 SKILL.md:323-329 SKILL.md:329-348 SKILL.md:348-354 SKILL.md:354-365 SKILL.md:365-371 SKILL.md:371-395 SKILL.md:395-466 SKILL.md:466-467 SKILL.md:467-476 SKILL.md:476-489 SKILL.md:489-493 SKILL.md:493-503 SKILL.md:503-507
دقّقه: codex عرض سجل التدقيق →
شارك واستشهد بهذا التقرير

شارك تقرير التقييم المرتبط بالإصدار والشارة المحايدة وبطاقة التضمين والاستشهادات. تعرض Skillstore الأدلة من دون أن تقرر ما إذا كانت هذه المهارة آمنة.

فتح التقرير المرتبط بالإصدار
تقييم الأمان

نسخ رابط التقرير

https://skillstore.io/skills/k-dense-ai-string-database/audits/7?utm_source=security_passport&utm_medium=share&utm_campaign=versioned_report

شارة Markdown

[![Skillstore security assessment](https://skillstore.io/badges/skills/k-dense-ai-string-database/security.svg)](https://skillstore.io/skills/k-dense-ai-string-database?utm_source=security_passport_badge)

شارة HTML

<a href="https://skillstore.io/skills/k-dense-ai-string-database?utm_source=security_passport_badge"><img src="https://skillstore.io/badges/skills/k-dense-ai-string-database/security.svg" alt="Skillstore security assessment" loading="lazy"></a>

بطاقة قابلة للتضمين

<iframe src="https://skillstore.io/embed/skills/k-dense-ai-string-database.html" title="Skillstore Security Assessment" sandbox="allow-popups allow-popups-to-escape-sandbox" loading="lazy" referrerpolicy="no-referrer" width="420" height="180"></iframe>
الاستشهادات الأكاديمية (APA · BibTeX · CFF)

اقتباس APA

K-Dense-AI. (2026). string-database security audit report (audit version 7) [Author version unspecified]. Skillstore. https://skillstore.io/skills/k-dense-ai-string-database/audits/7

اقتباس BibTeX

@techreport{k-dense-ai-k-dense-ai-string-database-2026, author = {K-Dense-AI}, title = {string-database security audit report (audit version 7)}, institution = {Skillstore}, year = {2026}, number = {7}, url = {https://skillstore.io/skills/k-dense-ai-string-database/audits/7}, note = {Author version unspecified} }

CITATION.cff

cff-version: 1.2.0 message: "If you use this Skill, cite its author and this versioned security audit report." title: "string-database security audit report (audit version 7)" version: "unspecified" type: report authors: - name: "K-Dense-AI" date-released: "2026-07-05" url: "https://skillstore.io/skills/k-dense-ai-string-database/audits/7" identifiers: - type: other value: "skillstore:k-dense-ai-string-database:audit:7" description: "Skillstore immutable audit report identifier"

مقارنة المتغيرات

2 متغيرات قابلة للتثبيت

تبقى مهارة كل مؤلف عنصراً مستقلاً قابلاً للتثبيت. يُرتب المتغير الموصى به وفق أدلة Skillstore.

سبب تصدر هذا المتغير

أعلى تقييم في Skillstore
davila7 موصى به

davila7-string-database

تقييم Skillstore 79
موثوقية الأدلة مرتفع
استخدام Skillstore 11
تم التحديث

2026-09-09

K-Dense-AI الحالي

k-dense-ai-string-database

تقييم Skillstore 50
موثوقية الأدلة مرتفع
استخدام Skillstore 10
تم التحديث

2026-09-09

تقييم Skillstore

سبب هذا التقييم موثوقية الأدلة: مرتفع
64
الهندسة المعمارية
75
قابلية الصيانة
87
المحتوى
71
المجتمع
78
الامتثال للمواصفات

ما الذي يمكنك بناؤه

تحليل قوائم البروتينات التجريبية

اربط أسماء البروتينات، واسترجع التفاعلات، وراجع الإثراء لنتائج البروتيوميات أو التعبير.

استكشاف الوحدات الوظيفية

وسع البروتينات البذرية إلى شركاء تفاعل وحدد المسارات أو العمليات البيولوجية المثرية.

بناء تدفقات عمل STRING API

استخدم دوالا مساعدة لربط المعرفات القابل للتكرار، واسترجاع الشبكات، وفحوصات الإصدار.

جرّب هذه الموجّهات

ربط معرفات البروتينات 
اربط TP53 وBRCA1 وEGFR بمعرفات STRING للبشر. اشرح أي إدخالات غير مطابقة.
استرجاع شبكة 
احصل على شبكة التفاعلات البشرية عالية الثقة لـ TP53 وMDM2 وATM وCHEK2 وBRCA1.
تلخيص الإثراء 
شغل إثراء STRING لقائمة البروتينات هذه ولخص أقوى إشارات GO وKEGG.
مقارنة الإشارات عبر الأنواع 
قارن شبكات تفاعلات TP53 البشري وTrp53 لدى الفأر باستخدام إعدادات الثقة العالية. اذكر السمات الوظيفية المشتركة.

أفضل الممارسات

  • اربط المعرفات قبل استعلامات الشبكة لتقليل النتائج الملتبسة.
  • اختر عتبات الثقة التي تطابق أهداف التحليل الاستكشافي أو المحافظ.
  • استخدم معلومات الإصدار ومعرفات الأنواع عندما يجب أن تكون النتائج قابلة لإعادة الإنتاج.

تجنب

  • لا ترسل قوائم بروتينات حساسة غير منشورة دون فهم انكشافها على API خارجي.
  • لا تعامل تفاعلات STRING منخفضة الثقة على أنها ارتباط فيزيائي موثق.
  • لا تشغل دفعات استعلام كبيرة وسريعة دون تحديد للمعدل أو تجميع على دفعات.

الأسئلة المتكررة

ما قاعدة البيانات التي تستخدمها هذه المهارة؟
تستخدم API العام لـ STRING database للحصول على بيانات تفاعلات البروتينات والإثراء.
هل تعمل دون اتصال بالإنترنت؟
لا. تحتاج الدوال المساعدة إلى وصول شبكي إلى string-db.org.
هل يمكنها تحليل الأنواع غير البشرية؟
نعم. قدم NCBI taxon ID الصحيح للكائن الحي.
هل يمكنها إنشاء أشكال للشبكات؟
نعم. يمكنها طلب بيانات صور شبكة STRING وحفظها عند الطلب.
هل النتائج موثقة تجريبيا؟
ليس دائما. يجمع STRING بين الأدلة التجريبية والمنسقة والمتنبأ بها والمستخرجة من النصوص.
ما الأدوات التي يمكنها استخدام هذه المهارة؟
يسرد التقرير الدعم لـ Claude وCodex وClaude Code.

تفاصيل المطور

المؤلف

K-Dense-AI

الترخيص

Unknown

مراجعة Skillstore

r1

تنبيه الإصدار

لم يعلن المؤلف عن إصدار.

المستودع

https://github.com/K-Dense-AI/claude-scientific-skills/tree/main/scientific-skills/string-database

مرجع

a25199bc7d6b82598536822d1738eb5d5f54025b

حداثة الصيانة

١٨‏/٧‏/٢٠٢٦

الاستخدام

8 تنزيلات · 240 مشاهدات

بنية الملفات

📁 references/

📄 string_reference.md

📁 scripts/

📄 string_api.py

📄 SKILL.md

المزيد من K-Dense-AI

عرض الكل
📦

pytdc

82

تحليل مجموعات بيانات التعلم الآلي العلاجية باستخدام PyTDC

تحتاج فرق اكتشاف الأدوية إلى مجموعات بيانات موثوقة وبروتوكولات تقييم عادلة. تساعد هذه المهارة Claude على استخدام PyTDC لبيانات التعلم الآلي العلاجية المنسقة، وتقسيمات المعايير المرجعية، والمقاييس، والأوراكل الجزيئية.

البيانات والتحليلات عرض
📦

statistical-analysis

80

تحليل بيانات البحث مع إرشادات إحصائية

قد يكون اختيار الاختبارات والإبلاغ عن النتائج بطيئًا ومعرّضًا للأخطاء. توجّه هذه المهارة اختيار الاختبارات، والافتراضات، وأحجام التأثير، وتحليل القدرة الإحصائية، والخيارات البايزية، وإعداد التقارير وفق APA.

البيانات والتحليلات عرض

مهارات ذات صلة

عرض الكل