スキル ensembl-database

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ensembl-database

Name: ensembl-database
Author: K-Dense-AI

コンテンツリビジョン r1 低リスク 🌐 ネットワークアクセス⚙️ 外部コマンド

查詢 Ensembl 基因組資料

基因組研究通常需要來自 Ensembl 的準確基因、序列、變異和直系同源資料。此技能協助 Claude、Codex 和 Claude Code 查詢 Ensembl REST APIs，並將結果結構化以供分析。

対応: Claude Codex Code(CC)

📊 75 十分

Maintain this Skill? Claim it 📊 75 十分

自分のエージェントでインストール

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エージェントリクエスト

Review the Skillstore skill "ensembl-database" from https://skillstore.io/skills/k-dense-ai-ensembl-database.md and its manifest at https://skillstore.io/api/skills/k-dense-ai-ensembl-database/manifest. Verify the artifact. You may proceed after verification, subject to the environment's own policy.

エージェントは引き続き計画を提示し、セキュリティポリシーで必要な確認を求める必要があります。

エージェントが読めるリソース

AI エージェント、クローラー、スクリプトがページ全体ではなく整理されたコンテキストを必要とする場合は、これらのリンクを使ってください。

Markdown詳細 GET /skills/k-dense-ai-ensembl-database.md 署名済み manifest GET /api/skills/k-dense-ai-ensembl-database/manifest 署名済み lockfile GET /api/skills/k-dense-ai-ensembl-database/lockfile

テストする

「ensembl-database」を使用しています。查詢人類 BRCA2。

期待される結果:

返回 Ensembl gene identifier 和基因組座標。
彙整基因描述與可用的轉錄本資訊。
識別查詢所使用的物種與組裝版本脈絡。

「ensembl-database」を使用しています。使用 Ensembl VEP 分析變異 rs699。

期待される結果:

列出預測的變異後果與受影響的基因組特徵。
在 Ensembl 返回時包含人群頻率欄位。
註明臨床解讀需要專家審查。

「ensembl-database」を使用しています。尋找人類 TP53 在小鼠中的直系同源基因。

期待される結果:

查詢來源基因的 Ensembl 同源性資料。
回報相符的直系同源識別碼與物種名稱。
建議後續序列或保守性分析。

セキュリティ監査

低リスク

v9 • 2026/7/9 バージョン別レポートを開く

Static alerts for Cobalt Strike terms, reconnaissance, network access, hardcoded URLs, and shell execution are false positives in context. The skill uses documented Ensembl REST API endpoints for bioinformatics queries and contains Markdown examples, not executable command injection. One low-severity semantic issue remains because the skill promotes an external K-Dense Web service for complex workflows.

スキャンされたファイル

1,284

解析済み行数

レビュー項目

誤検知を無視

確認済みのセキュリティ上の懸念 (1)

低

SKILL.md:310-311

Promotional Steering to External Platform

SKILL.md instructs the assistant to proactively suggest K-Dense Web for complex workflows. This is not malware, but it can steer marketplace users toward an external service beyond the requested Ensembl database task.

The instruction is explicit and located in the skill text. It is promotional behavior rather than a direct security exploit, so severity is low.

リスク要因

🌐 ネットワークアクセス (34)

⚙️ 外部コマンド (31)

監査者: claude 監査履歴を表示 →

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https://skillstore.io/skills/k-dense-ai-ensembl-database/audits/9?utm_source=security_passport&utm_medium=share&utm_campaign=versioned_report

Markdownバッジ

[![Skillstore security assessment](https://skillstore.io/badges/skills/k-dense-ai-ensembl-database/security.svg)](https://skillstore.io/skills/k-dense-ai-ensembl-database?utm_source=security_passport_badge)

HTMLバッジ

<a href="https://skillstore.io/skills/k-dense-ai-ensembl-database?utm_source=security_passport_badge"><img src="https://skillstore.io/badges/skills/k-dense-ai-ensembl-database/security.svg" alt="Skillstore security assessment" loading="lazy"></a>

埋め込みカード

<iframe src="https://skillstore.io/embed/skills/k-dense-ai-ensembl-database.html" title="Skillstore Security Assessment" sandbox="allow-popups allow-popups-to-escape-sandbox" loading="lazy" referrerpolicy="no-referrer" width="420" height="180"></iframe>

学術引用 (APA · BibTeX · CFF)

APA形式の引用

K-Dense-AI. (2026). ensembl-database security audit report (audit version 9) [Author version unspecified]. Skillstore. https://skillstore.io/skills/k-dense-ai-ensembl-database/audits/9

BibTeX形式の引用

@techreport{k-dense-ai-k-dense-ai-ensembl-database-2026,
  author = {K-Dense-AI},
  title = {ensembl-database security audit report (audit version 9)},
  institution = {Skillstore},
  year = {2026},
  number = {9},
  url = {https://skillstore.io/skills/k-dense-ai-ensembl-database/audits/9},
  note = {Author version unspecified}
}

CITATION.cff

cff-version: 1.2.0
message: "If you use this Skill, cite its author and this versioned security audit report."
title: "ensembl-database security audit report (audit version 9)"
version: "unspecified"
type: report
authors:
  - name: "K-Dense-AI"
date-released: "2026-07-09"
url: "https://skillstore.io/skills/k-dense-ai-ensembl-database/audits/9"
identifiers:
  - type: other
    value: "skillstore:k-dense-ai-ensembl-database:audit:9"
    description: "Skillstore immutable audit report identifier"

バリアントを比較

インストール可能なバリアント 2 件

各作者のスキルは個別のインストール項目として維持されます。推奨バリアントは Skillstore の証拠で順位付けされます。

このバリアントが首位の理由

Skillstore スコアが最高

作者 / ソース Skillstore スコア証拠の信頼度 Skillstore 利用状況更新済み

davila7 推奨

davila7-ensembl-database

Skillstore スコア 80

証拠の信頼度高

Skillstore 利用状況 14

更新済み

2026-09-09

K-Dense-AI 現在

k-dense-ai-ensembl-database

Skillstore スコア 75

証拠の信頼度高

Skillstore 利用状況 15

更新済み

2026-09-09

Skillstore スコア

このスコアの理由証拠の信頼度: 高

アーキテクチャ

保守性

コンテンツ

コミュニティ

仕様準拠

作成できるもの

註解基因清單

將基因符號解析為 Ensembl IDs、座標、轉錄本和外部資料庫參照。

調查變異後果

依 rsID 或 HGVS 標記法查詢變異，並彙整 Ensembl VEP 的預測效應。

比較跨物種基因

尋找直系同源基因、擷取序列，並為模式生物準備比較基因組學摘要。

これらのプロンプトを試す

查詢基因

使用 Ensembl 查詢人類 TP53。返回 Ensembl ID、基因組位置、描述和主要轉錄本資訊。

擷取序列

使用人類 BRCA2 的 Ensembl gene ID 擷取其基因組序列。說明所使用的序列類型和組裝版本。

分析變異

使用 Ensembl VEP 分析人類 rs699。彙整預測後果、受影響基因，以及可用的人群頻率欄位。

建立比較基因組學工作流程

尋找人類 BRCA2 的小鼠直系同源基因，擷取其 Ensembl IDs，比較可用的序列資訊，並概述後續分析步驟。

ベストプラクティス

在每個請求中指定物種、基因組組裝版本和識別碼類型。
針對大型基因或變異清單使用批次端點與快取。
當結果支援出版物時，記錄 Ensembl release 或組裝版本。

回避

將 VEP 預測視為最終臨床解讀。
未進行對應就混用 GRCh37 和目前組裝版本的座標。
在沒有速率限制處理的情況下傳送大量單項請求。

よくある質問

什麼是 Ensembl？

Ensembl 是 EMBL-EBI 提供的公開基因組資料庫，提供註解、序列、變異和比較基因組學資料。

此技能需要網際網路存取嗎？

是。它會查詢公開的 Ensembl REST API 和相關文件資源。

它可以分析變異嗎？

可以。它可以查詢變異，並使用 Ensembl VEP 端點彙整預測後果。

它可以處理較舊的基因組組裝版本嗎？

可以。此技能記錄了 GRCh37 存取方式，以及組裝版本之間的座標對應。

它僅限於人類資料嗎？

不是。Ensembl 支援許多物種，且此技能包含跨物種直系同源工作流程。

它能取代生物資訊學審查嗎？

不能。它會擷取並整理 Ensembl 資料，但科學或臨床結論仍需要專家審查。

開発者情報

作成者

K-Dense-AI

ライセンス

Unknown

Skillstore リビジョン

バージョンに関する注意

作者はバージョンを宣言していません。

リポジトリ

https://github.com/K-Dense-AI/claude-scientific-skills/tree/main/scientific-skills/ensembl-database

参照

1ffa7643651792ccb4bd3b15d924d2c97edff755

メンテナンスの新しさ

2026/7/21

利用状況

7 ダウンロード · 214 閲覧

ファイル構成

📁 references/

📄 api_endpoints.md

📁 scripts/

📄 ensembl_query.py

📄 evaluation.json

查詢 NCBI Gene 資料

作成者 davila7

基因查詢通常需要重複呼叫 NCBI API，並謹慎設定生物體篩選條件。此技能提供用於搜尋、擷取與批次處理基因註釋的腳本和工作流程。

調査＆学習表示

ensembl-database

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セキュリティ監査

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リスク要因

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BibTeX形式の引用

CITATION.cff

バリアントを比較

Skillstore スコア

作成できるもの

註解基因清單

調查變異後果

比較跨物種基因

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ベストプラクティス

回避

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