スキル ensembl-database

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ensembl-database

Name: ensembl-database
Author: davila7

コンテンツリビジョン r1 安全 🌐 ネットワークアクセス⚙️ 外部コマンド

Ensemblゲノムデータをクエリする

ゲノム研究では、遺伝子、バリアント、配列、アセンブリへの高速なアクセスが必要になることがよくあります。このスキルは、Claude、Codex、Claude CodeにEnsembl RESTワークフローを案内します。

対応: Claude Codex Code(CC)

🥈 80 シルバー

自分のエージェントでインストール

このリクエストをエージェントにコピーしてください。正規の Skill ページとマニフェストが含まれています。

エージェントリクエスト

Review the Skillstore skill "ensembl-database" from https://skillstore.io/skills/davila7-ensembl-database.md and its manifest at https://skillstore.io/api/skills/davila7-ensembl-database/manifest. Verify the artifact. You may proceed after verification, subject to the environment's own policy.

エージェントは引き続き計画を提示し、セキュリティポリシーで必要な確認を求める必要があります。

エージェントが読めるリソース

AI エージェント、クローラー、スクリプトがページ全体ではなく整理されたコンテキストを必要とする場合は、これらのリンクを使ってください。

Markdown詳細 GET /skills/davila7-ensembl-database.md 署名済み manifest GET /api/skills/davila7-ensembl-database/manifest 署名済み lockfile GET /api/skills/davila7-ensembl-database/lockfile

テストする

「ensembl-database」を使用しています。 Look up BRCA2 in human.

期待される結果:

Ensembl識別子、染色体上の位置、鎖、転写産物数、関連するデータベースのクロスリファレンスを含む遺伝子サマリー。

「ensembl-database」を使用しています。 Find orthologs for a human Ensembl gene ID in mouse.

期待される結果:

一致するオルソログ、種名、信頼度に関する注記、下流解析に有用なフィールドを一覧化した比較サマリー。

「ensembl-database」を使用しています。 Check a variant by rsID.

期待される結果:

位置、アレル、集団頻度の利用可能性、解釈上の注意点を含むバリアントサマリー。

セキュリティ監査

安全

v14 • 2026/7/9 バージョン別レポートを開く

All static findings were adjudicated as false positives. The skill intentionally documents and performs requests to official Ensembl REST API endpoints for genomic research, and the external command detections are Markdown code fences or inline examples rather than executable behavior.

スキャンされたファイル

1,081

解析済み行数

レビュー項目

誤検知を無視

リスク要因

🌐 ネットワークアクセス (31)

⚙️ 外部コマンド (31)

最新の完了済み静的・セマンティック監査では、確認済みのセキュリティ検出事項は見つかりませんでした。これは、スキルに副作用がないことを証明するものではありません。

監査者: claude 監査履歴を表示 →

このレポートを共有・引用

バージョン付き評価レポート、中立的なバッジ、埋め込みカード、引用を共有できます。Skillstore は証拠を報告しますが、この Skill が安全かどうかは判断しません。

バージョン別レポートを開く

レポートリンクをコピー

https://skillstore.io/skills/davila7-ensembl-database/audits/14?utm_source=security_passport&utm_medium=share&utm_campaign=versioned_report

Markdownバッジ

[![Skillstore security assessment](https://skillstore.io/badges/skills/davila7-ensembl-database/security.svg)](https://skillstore.io/skills/davila7-ensembl-database?utm_source=security_passport_badge)

HTMLバッジ

<a href="https://skillstore.io/skills/davila7-ensembl-database?utm_source=security_passport_badge"><img src="https://skillstore.io/badges/skills/davila7-ensembl-database/security.svg" alt="Skillstore security assessment" loading="lazy"></a>

埋め込みカード

<iframe src="https://skillstore.io/embed/skills/davila7-ensembl-database.html" title="Skillstore Security Assessment" sandbox="allow-popups allow-popups-to-escape-sandbox" loading="lazy" referrerpolicy="no-referrer" width="420" height="180"></iframe>

学術引用 (APA · BibTeX · CFF)

APA形式の引用

davila7. (2026). ensembl-database security audit report (audit version 14) [Author version unspecified]. Skillstore. https://skillstore.io/skills/davila7-ensembl-database/audits/14

BibTeX形式の引用

@techreport{davila7-davila7-ensembl-database-2026,
  author = {davila7},
  title = {ensembl-database security audit report (audit version 14)},
  institution = {Skillstore},
  year = {2026},
  number = {14},
  url = {https://skillstore.io/skills/davila7-ensembl-database/audits/14},
  note = {Author version unspecified}
}

CITATION.cff

cff-version: 1.2.0
message: "If you use this Skill, cite its author and this versioned security audit report."
title: "ensembl-database security audit report (audit version 14)"
version: "unspecified"
type: report
authors:
  - name: "davila7"
date-released: "2026-07-09"
url: "https://skillstore.io/skills/davila7-ensembl-database/audits/14"
identifiers:
  - type: other
    value: "skillstore:davila7-ensembl-database:audit:14"
    description: "Skillstore immutable audit report identifier"

バリアントを比較

インストール可能なバリアント 2 件

各作者のスキルは個別のインストール項目として維持されます。推奨バリアントは Skillstore の証拠で順位付けされます。

このバリアントが首位の理由

Skillstore スコアが最高

作者 / ソース Skillstore スコア証拠の信頼度 Skillstore 利用状況更新済み

davila7 推奨現在

davila7-ensembl-database

Skillstore スコア 80

証拠の信頼度高

Skillstore 利用状況 9

更新済み

2026-09-09

K-Dense-AI

k-dense-ai-ensembl-database

Skillstore スコア 75

証拠の信頼度高

Skillstore 利用状況 10

更新済み

2026-09-09

Skillstore スコア

このスコアの理由証拠の信頼度: 高

アーキテクチャ

保守性

コンテンツ

コミュニティ

仕様準拠

作成できるもの

遺伝子リストに注釈を付ける

研究用テーブルのために、遺伝子シンボルをEnsembl識別子、座標、転写産物、クロスリファレンスに変換します。

バリアントの影響をレビューする

研究サマリーまたは社内レポートを作成する前に、バリアントレコードとVEP予測を確認します。

種間で遺伝子を比較する

モデル生物をまたぐ比較ゲノミクスプロジェクトのために、オルソログとアセンブリ詳細を見つけます。

これらのプロンプトを試す

1つの遺伝子を検索する

Use the Ensembl database skill to look up BRCA2 in human. Summarize the Ensembl ID, location, transcripts, and key cross references.

配列を取得する

Use Ensembl to retrieve the genomic sequence for ENSG00000139618. Return a concise summary and note the response format used.

バリアントの影響を解析する

Query Ensembl for rs699 in human and summarize population data, known consequences, and any VEP-related interpretation boundaries.

比較ワークフローを構築する

Design an Ensembl workflow for comparing human BRCA2 orthologs in mouse and zebrafish. Include endpoints, rate-limit handling, and output fields.

ベストプラクティス

クエリを実行する前に、種名とゲノムアセンブリを確認します。
大規模な遺伝子リストまたはバリアントリストには、バッチエンドポイントとキャッシュを使用します。
Ensemblのレート制限を尊重し、推奨された遅延時間の後にのみリトライします。

回避

承認なしに機微な、または識別可能なゲノムデータを送信しないでください。
Ensemblのレスポンスを臨床診断として扱わないでください。
バッチ処理、キャッシュ、またはレート制限なしに、大規模な反復クエリを実行しないでください。

よくある質問

このスキルはどのデータソースを使用しますか？

公開Ensembl REST APIと同梱のエンドポイントドキュメントを使用します。

APIキーは必要ですか？

スキル内にAPIキーは示されていません。匿名のEnsemblアクセスにはレート制限があります。

DNA配列またはタンパク質配列を取得できますか？

はい。このスキルはゲノム配列、転写産物配列、タンパク質配列の取得を扱います。

バリアントを解析できますか？

はい。Ensemblエンドポイントを通じて、バリアント検索とVariant Effect Predictorワークフローをサポートします。

臨床判断に適していますか？

いいえ。診断または治療の意思決定には、検証済みの臨床システムと有資格者によるレビューを使用してください。

どのツールでこのスキルを使用できますか？

レポートにはClaude、Codex、Claude Codeとの互換性が記載されています。

開発者情報

作成者

davila7

ライセンス

MIT

Skillstore リビジョン

バージョンに関する注意

作者はバージョンを宣言していません。

リポジトリ

https://github.com/davila7/claude-code-templates/tree/main/cli-tool/components/skills/scientific/ensembl-database

参照

b959ebfd1043a07c0c4378ab94ca4342cb0259f5

メンテナンスの新しさ

2026/7/25

利用状況

6 ダウンロード · 220 閲覧

ファイル構成

📁 references/

📄 api_endpoints.md

📁 scripts/

📄 ensembl_query.py

より優れたRESTおよびGraphQL APIを設計する

作成者 supercent-io

APIチームには、実装が始まる前に一貫した契約が必要です。このスキルは、リソース設計、リクエスト形式、エラー、バージョニング、ドキュメント作成を支援します。

コーディング＆開発表示

ensembl-database

自分のエージェントでインストール

エージェントが読めるリソース

テストする

セキュリティ監査

リスク要因

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HTMLバッジ

埋め込みカード

APA形式の引用

BibTeX形式の引用

CITATION.cff

バリアントを比較

Skillstore スコア

作成できるもの

遺伝子リストに注釈を付ける

バリアントの影響をレビューする

種間で遺伝子を比較する

これらのプロンプトを試す

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