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latex-posters
87建立 LaTeX 研究海報
研究海報在 LaTeX 中很難排版，也很難為列印進行校對。此技能提供範本、版面配置指引，以及適用於會議就緒海報的 PDF 檢查。
設計與創意 查看
技能 cobrapy
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cobrapy
內容修訂 r2 安全 ⚡ 包含腳本⚙️ 外部命令🌐 網路存取
使用 COBRApy 分析代謝模型
代謝建模工作流程可能很難從零散的 COBRApy 範例中拼湊出來。此技能為 Claude、Codex 和 Claude Code 提供常見分析的聚焦指引。
支援: Claude Codex Code(CC)
使用我的智慧代理安裝
將此請求複製給你的智慧代理，其中包含權威 Skill 頁面和清單。
智能體請求
Review the Skillstore skill "cobrapy" from https://skillstore.io/skills/davila7-cobrapy.md and its manifest at https://skillstore.io/api/skills/davila7-cobrapy/manifest. Verify the artifact. You may proceed after verification, subject to the environment's own policy.你的智慧代理仍應顯示其計畫，並依安全政策請求必要確認。
Agent 可讀資源
當 AI Agent、爬蟲或腳本需要乾淨脈絡、而不是讀取完整頁面時，請使用這些連結。
測試它
正在使用「cobrapy」。 使用者詢問如何在 E. coli 模型上執行 FBA。
預期結果:
回應會概述模型載入、最佳化、狀態檢查、目標值解讀和通量表審查。
正在使用「cobrapy」。 使用者詢問生產菌株設計指引。
預期結果:
- 工作流程會比較基準生長、目標代謝物生產、knockout 候選項和培養基約束。
- 結果包含關於生長約束、求解器效能和驗證的注意事項。
正在使用「cobrapy」。 使用者有一個不可行模型。
預期結果:
回應會列出培養基組成、反應邊界、交換反應、質量平衡和求解器狀態的檢查項目。
安全審計
安全v9 • 2026/7/23 開啟版本化報告
All 71 static findings are false positives caused by Python imports, Markdown code fences, COBRA model identifiers, and a documentation link. No command execution, dynamic loading, credential access, system reconnaissance, prompt injection, or malicious intent was found.
3
已掃描檔案
1,708
分析行數
0
複核項目
0
已忽略的誤報
風險因素
⚡ 包含腳本 (4)
⚙️ 外部命令 (50)
SKILL.md:19-32 SKILL.md:32-35 SKILL.md:35-40 SKILL.md:40-45 SKILL.md:45-61 SKILL.md:61-66 SKILL.md:66-82 SKILL.md:82-85 SKILL.md:85-88 SKILL.md:88-91 SKILL.md:91-94 SKILL.md:94-99 SKILL.md:99-116 SKILL.md:116-121 SKILL.md:121-145 SKILL.md:145-150 SKILL.md:150-172 SKILL.md:172-177 SKILL.md:177-192 SKILL.md:192-197 SKILL.md:197-218 SKILL.md:218-223 SKILL.md:223-237 SKILL.md:237-242 SKILL.md:242-282 SKILL.md:282-288 SKILL.md:288-300 SKILL.md:300-304 SKILL.md:304-320 SKILL.md:320-324 SKILL.md:324-341 SKILL.md:341-345 SKILL.md:345-366 SKILL.md:366-371 SKILL.md:371-390 SKILL.md:390-395 SKILL.md:395-396 SKILL.md:396-405 SKILL.md:405-409 SKILL.md:409-410 SKILL.md:410-411 SKILL.md:411-415 SKILL.md:415-424 SKILL.md:424-428 SKILL.md:428-430 SKILL.md:430-435 SKILL.md:435-436 SKILL.md:436-447 SKILL.md:447-454 SKILL.md:454-455
🌐 網路存取 (1)
最近一次完成的靜態與語意稽核未偵測到已確認的安全發現。這並不能證明該 Skill 沒有副作用。
審計單位: codex 檢視審計紀錄 →
分享與引用此報告
分享版本化評估報告、中性徽章、嵌入卡片與引用。Skillstore 只報告證據，不判斷該 Skill 是否安全。
複製報告連結
https://skillstore.io/skills/davila7-cobrapy/audits/9?utm_source=security_passport&utm_medium=share&utm_campaign=versioned_reportMarkdown 徽章
[](https://skillstore.io/skills/davila7-cobrapy?utm_source=security_passport_badge)HTML 徽章
<a href="https://skillstore.io/skills/davila7-cobrapy?utm_source=security_passport_badge"><img src="https://skillstore.io/badges/skills/davila7-cobrapy/security.svg" alt="Skillstore security assessment" loading="lazy"></a>嵌入卡片
<iframe src="https://skillstore.io/embed/skills/davila7-cobrapy.html" title="Skillstore Security Assessment" sandbox="allow-popups allow-popups-to-escape-sandbox" loading="lazy" referrerpolicy="no-referrer" width="420" height="180"></iframe>學術引用 (APA · BibTeX · CFF)
APA 引用
davila7. (2026). cobrapy security audit report (audit version 9) [Author version unspecified]. Skillstore. https://skillstore.io/skills/davila7-cobrapy/audits/9BibTeX 引用
@techreport{davila7-davila7-cobrapy-2026,
author = {davila7},
title = {cobrapy security audit report (audit version 9)},
institution = {Skillstore},
year = {2026},
number = {9},
url = {https://skillstore.io/skills/davila7-cobrapy/audits/9},
note = {Author version unspecified}
}CITATION.cff
cff-version: 1.2.0
message: "If you use this Skill, cite its author and this versioned security audit report."
title: "cobrapy security audit report (audit version 9)"
version: "unspecified"
type: report
authors:
- name: "davila7"
date-released: "2026-07-23"
url: "https://skillstore.io/skills/davila7-cobrapy/audits/9"
identifiers:
- type: other
value: "skillstore:davila7-cobrapy:audit:9"
description: "Skillstore immutable audit report identifier"
比較變體
2 個可安裝變體每位作者的技能都保留為獨立的可安裝項目。推薦變體依 Skillstore 證據排序。
為何此變體排名第一
Skillstore 使用量較高
作者 / 來源 Skillstore 評分 證據置信度 Skillstore 使用量 已更新
Skillstore 評分
評分依據 證據置信度: 高 41
架構
85
可維護性
87
內容
70
社群
83
規範符合度
你可以打造什麼
執行生長模擬
載入基因組尺度模型，執行 FBA，並檢視目標條件下的活躍路徑。
設計生產菌株
比較目標代謝物的生產包絡線、knockouts 和培養基變更。
教授 COBRApy 工作流程
使用精簡範例說明模型結構、通量約束和驗證步驟。
試試這些提示
載入並最佳化模型
協助我從 SBML 載入 COBRApy 模型、執行 FBA，並逐步說明生長結果。
比較通量範圍
引導我針對選定反應進行 FVA，包括 fraction_of_optimum 選擇，以及如何解讀寬廣範圍。
篩選基因 Knockouts
為我的模型規劃單一基因刪除研究。包含結果解讀、必需基因閾值和常見驗證檢查。
設計生產工作流程
建立進階 COBRApy 工作流程，用於目標代謝物生產。包含培養基約束、生產包絡線、knockout 排名和 loopless FVA。
最佳實務
- 針對暫時性的目標、邊界或 knockout 變更使用 context managers。
- 在解讀目標值或通量之前，先檢查最佳化狀態。
- 在得出生物學結論之前，先驗證模型和樣本。
避免
- 不要假設可行解代表生物學上正確。
- 不要在未重新指定完整培養基字典的情況下覆寫模型培養基。
- 不要在未規劃求解器和 CPU 使用量的情況下執行大型刪除或取樣工作。
常見問題
此技能會自動執行 COBRApy 嗎？
否。它會引導可在你的 Python 環境中使用的分析模式和範例工作流程。
涵蓋哪些檔案格式？
它涵蓋 SBML、JSON 和 YAML 模型載入與儲存模式。
它能協助基因 knockout 研究嗎？
可以。它會說明單一和雙重刪除工作流程及結果解讀。
它支援代謝工程設計嗎？
可以。它涵蓋生產包絡線、培養基約束、gapfilling 和 knockout 優先排序。
哪些工具可以使用此技能？
它標示可用於 Claude、Codex 和 Claude Code。
是否需要外部求解器？
部分工作流程可以使用預設求解器，但大型或 MILP 任務可能需要已設定的更快速求解器。
開發者詳細資訊
作者
davila7授權
MIT
Skillstore 修訂
r2
版本提示
作者未聲明版本。
引用
c43861a65bb95efcae259cd161c9d6f4dc7eec6f
維護新鮮度
2026/7/26
使用量
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