hmdb-database
HMDB代謝物データを検索
メタボロミクスの作業では、多くのレコードにわたって代謝物の同一性、スペクトル、経路、臨床的背景を確認することがよくあります。このスキルは、Claude、Codex、Claude CodeによるHMDB検索、ダウンロード、解釈ワークフローを支援します。
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Review the Skillstore skill "hmdb-database" from https://skillstore.io/skills/davila7-hmdb-database.md and its manifest at https://skillstore.io/api/skills/davila7-hmdb-database/manifest. Verify the artifact. You may proceed after verification, subject to the environment's own policy.エージェントは引き続き計画を提示し、セキュリティポリシーで必要な確認を求める必要があります。
エージェントが読めるリソース
AI エージェント、クローラー、スクリプトがページ全体ではなく整理されたコンテキストを必要とする場合は、これらのリンクを使ってください。
テストする
「hmdb-database」を使用しています。 Look up HMDB context for glucose.
期待される結果:
識別子、化学式、分子量、一般的な生体液、経路リンク、推奨される検証チェックを含む簡潔な代謝物概要。
「hmdb-database」を使用しています。 Plan an HMDB download for pathway analysis.
期待される結果:
- 完全な代謝物レコードにはXMLを推奨。
- 表形式の分析にはCSVまたはTSVを推奨。
- バージョン追跡メモと引用リマインダー。
「hmdb-database」を使用しています。 Compare two possible MS matches.
期待される結果:
質量の適合性、スペクトル証拠、試料の妥当性、経路の文脈、不確実性を扱う構造化された比較。
セキュリティ監査
安全All nine static findings are false positives caused by biomedical terminology, Markdown code spans, and links to official HMDB resources. No prompt injection, data exfiltration intent, or unsafe autonomous behavior was found.
リスク要因
⚙️ 外部コマンド (3)
🌐 ネットワークアクセス (2)
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<a href="https://skillstore.io/skills/davila7-hmdb-database?utm_source=security_passport_badge"><img src="https://skillstore.io/badges/skills/davila7-hmdb-database/security.svg" alt="Skillstore security assessment" loading="lazy"></a>埋め込みカード
<iframe src="https://skillstore.io/embed/skills/davila7-hmdb-database.html" title="Skillstore Security Assessment" sandbox="allow-popups allow-popups-to-escape-sandbox" loading="lazy" referrerpolicy="no-referrer" width="420" height="180"></iframe>学術引用 (APA · BibTeX · CFF)
APA形式の引用
davila7. (2026). hmdb-database security audit report (audit version 9) [Author version unspecified]. Skillstore. https://skillstore.io/skills/davila7-hmdb-database/audits/9BibTeX形式の引用
@techreport{davila7-davila7-hmdb-database-2026,
author = {davila7},
title = {hmdb-database security audit report (audit version 9)},
institution = {Skillstore},
year = {2026},
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url = {https://skillstore.io/skills/davila7-hmdb-database/audits/9},
note = {Author version unspecified}
}CITATION.cff
cff-version: 1.2.0
message: "If you use this Skill, cite its author and this versioned security audit report."
title: "hmdb-database security audit report (audit version 9)"
version: "unspecified"
type: report
authors:
- name: "davila7"
date-released: "2026-07-23"
url: "https://skillstore.io/skills/davila7-hmdb-database/audits/9"
identifiers:
- type: other
value: "skillstore:davila7-hmdb-database:audit:9"
description: "Skillstore immutable audit report identifier"
バリアントを比較
インストール可能なバリアント 2 件各作者のスキルは個別のインストール項目として維持されます。推奨バリアントは Skillstore の証拠で順位付けされます。
このバリアントが首位の理由
Skillstore スコア
このスコアの理由 証拠の信頼度: 高作成できるもの
候補代謝物を同定
観測されたスペクトル、分子量、または構造の詳細をHMDBフィールドと照合し、有力な候補をレビューします。
疾患バイオマーカーをレビュー
疾患に関連する代謝物を見つけ、生体液ごとの正常または異常な濃度範囲を比較します。
ローカルデータ統合を計画
ローカル解析データベースまたはパイプライン用に、HMDBのダウンロード形式とフィールドを選択します。
これらのプロンプトを試す
Use the HMDB database skill to help me look up lactate. Summarize identifiers, formula, molecular weight, biofluids, and main pathway context.
Use the HMDB database skill to compare candidate metabolites for an observed mass of [mass]. Include search strategy, expected fields to inspect, and validation checks.
Use the HMDB database skill to review metabolites associated with [disease]. Focus on biofluid concentrations, citations, pathways, and limits of interpretation.
Use the HMDB database skill to design a local HMDB integration workflow. Recommend download formats, key fields, version tracking, citation practices, and quality checks.
ベストプラクティス
- 研究ノートや出版物では、HMDB識別子とデータベースのバージョン詳細を使用してください。
- 代謝物候補は、単一のスペクトルまたは質量一致だけでなく、複数の証拠タイプで検証してください。
- 大規模解析では、手動のWebクエリを繰り返すのではなく、一括ダウンロードを使用してください。
回避
- 予測スペクトルを実験的確認と同等に扱わないでください。
- 試料タイプと文脈を確認せずにHMDBの濃度範囲を使用しないでください。
- 適切なダウンロードや承認済みアクセスが利用可能な場合に、Webスクレイピングに依存しないでください。
よくある質問
このスキルはHMDB APIへの直接アクセスを提供しますか？
代謝物同定に役立ちますか？
バイオマーカー研究を支援できますか？
どのHMDBファイル形式について説明していますか？
HMDBの商用利用は対象ですか？
専門家のレビューを代替しますか？
開発者情報
作成者
davila7ライセンス
MIT
Skillstore リビジョン
r2
バージョンに関する注意
作者はバージョンを宣言していません。
参照
c43861a65bb95efcae259cd161c9d6f4dc7eec6f
メンテナンスの新しさ
2026/7/24
利用状況
6 ダウンロード · 206 閲覧
ファイル構成