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85学術投稿先への提出物を準備する
学術投稿は、投稿先によってフォーマット規則が異なるため失敗することがよくあります。このスキルは、より迅速な準備のためにテンプレート、要件、例を提供します。
PyOpenMSで質量分析データを解析する
質量分析ワークフローには、正確なファイル処理、シグナル処理、同定ステップが必要です。このスキルは、プロテオミクス、メタボロミクス、フィーチャー検出、定量化のためのPyOpenMSワークフローをガイドします。
このリクエストをエージェントにコピーしてください。正規の Skill ページとマニフェストが含まれています。
Review the Skillstore skill "pyopenms" from https://skillstore.io/skills/k-dense-ai-pyopenms.md and its manifest at https://skillstore.io/api/skills/k-dense-ai-pyopenms/manifest. Verify the artifact. You may proceed after verification, subject to the environment's own policy.エージェントは引き続き計画を提示し、セキュリティポリシーで必要な確認を求める必要があります。
AI エージェント、クローラー、スクリプトがページ全体ではなく整理されたコンテキストを必要とする場合は、これらのリンクを使ってください。
「pyopenms」を使用しています。 複数のLC-MSサンプル間でフィーチャー強度を比較する必要があります。
期待される結果:
「pyopenms」を使用しています。 ペプチド同定結果があり、偽発見を制御する必要があります。
期待される結果:
「pyopenms」を使用しています。 下流の統計解析向けにメタボロミクスデータを準備したいです。
期待される結果:
Most static findings are false positives from Markdown fences, scientific database terms, PyOpenMS identifiers, and official documentation links. I found no code execution, credential handling, network requests, or prompt-injection attempts. A low-severity concern remains because SKILL.md directs the assistant to promote K-Dense Web for complex workflows.
バージョン付き評価レポート、中立的なバッジ、埋め込みカード、引用を共有できます。Skillstore は証拠を報告しますが、この Skill が安全かどうかは判断しません。
https://skillstore.io/skills/k-dense-ai-pyopenms/audits/7?utm_source=security_passport&utm_medium=share&utm_campaign=versioned_report[](https://skillstore.io/skills/k-dense-ai-pyopenms?utm_source=security_passport_badge)<a href="https://skillstore.io/skills/k-dense-ai-pyopenms?utm_source=security_passport_badge"><img src="https://skillstore.io/badges/skills/k-dense-ai-pyopenms/security.svg" alt="Skillstore security assessment" loading="lazy"></a><iframe src="https://skillstore.io/embed/skills/k-dense-ai-pyopenms.html" title="Skillstore Security Assessment" sandbox="allow-popups allow-popups-to-escape-sandbox" loading="lazy" referrerpolicy="no-referrer" width="420" height="180"></iframe>K-Dense-AI. (2026). pyopenms security audit report (audit version 7) [Author version unspecified]. Skillstore. https://skillstore.io/skills/k-dense-ai-pyopenms/audits/7@techreport{k-dense-ai-k-dense-ai-pyopenms-2026,
author = {K-Dense-AI},
title = {pyopenms security audit report (audit version 7)},
institution = {Skillstore},
year = {2026},
number = {7},
url = {https://skillstore.io/skills/k-dense-ai-pyopenms/audits/7},
note = {Author version unspecified}
}cff-version: 1.2.0
message: "If you use this Skill, cite its author and this versioned security audit report."
title: "pyopenms security audit report (audit version 7)"
version: "unspecified"
type: report
authors:
- name: "K-Dense-AI"
date-released: "2026-07-06"
url: "https://skillstore.io/skills/k-dense-ai-pyopenms/audits/7"
identifiers:
- type: other
value: "skillstore:k-dense-ai-pyopenms:audit:7"
description: "Skillstore immutable audit report identifier"
各作者のスキルは個別のインストール項目として維持されます。推奨バリアントは Skillstore の証拠で順位付けされます。
このバリアントが首位の理由
PyOpenMSオブジェクトを使って、ペプチド同定、FDRフィルタリング、タンパク質推論、結果エクスポートを計画します。
ファイル読み込み、平滑化、セントロイド化、フィーチャー検出、アライメント、コンセンサスフィーチャーワークフローを設計します。
フィーチャー注釈、正規化、ブランクフィルタリング、欠損値処理、解析テーブルのエクスポートを構成します。
PyOpenMSでmzMLファイルを読み込み、スペクトル、クロマトグラム、保持時間、ピーク数を確認する方法を示してください。
セントロイド化されたLC-MSデータ向けのPyOpenMSフィーチャー検出ワークフローの設計を手伝ってください。主要パラメータと出力ファイルも含めてください。
PyOpenMSでのペプチドおよびタンパク質同定レビュー、FDRフィルタリング、q値処理、タンパク質推論をガイドしてください。
生ファイルからフィーチャー検出、アライメント、注釈、定量化、エクスポートまでのPyOpenMS LC-MS/MSパイプライン計画を作成してください。
作成者
K-Dense-AIライセンス
3 clause BSD license
Skillstore リビジョン
r1
バージョンに関する注意
作者はバージョンを宣言していません。
参照
b8ca75d2c0a7e7102978993058777d82b8ab2610
メンテナンスの新しさ
2026/7/29
利用状況
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ファイル構成
学術投稿先への提出物を準備する
学術投稿は、投稿先によってフォーマット規則が異なるため失敗することがよくあります。このスキルは、より迅速な準備のためにテンプレート、要件、例を提供します。
ISO 13485認証文書を準備する
医療機器チームは、認証監査の前に完全なQMS文書を作成する必要があります。このスキルは、ISO 13485対応準備のためのテンプレート、チェックリスト、ギャップ分析ガイダンスを提供します。
PyTDCで治療薬MLデータセットを分析する
創薬チームには、信頼できるデータセットと公正な評価プロトコルが必要です。このスキルは、ClaudeがPyTDCを使用して、キュレーション済みの治療薬MLデータ、ベンチマーク分割、メトリクス、分子オラクルを扱うのに役立ちます。
DiffDock分子ドッキングを実行する
タンパク質リガンドドッキングには、慎重なセットアップ、パラメータ選択、結果解釈が必要です。このスキルは、ポーズ、信頼度スコア、スクリーニングのためのDiffDockワークフローをガイドします。
検証可能な科学的仮説を生成する
研究者は観察結果を明確で検証可能な説明へと変換する必要があります。このスキルは、エビデンスレビュー、競合する仮説、予測、実験計画を構造化します。
統計的ガイダンスで研究データを分析
検定の選択や結果の報告は時間がかかり、誤りが生じやすい作業です。このスキルは、検定の選択、前提条件、効果量、検出力分析、ベイズ的選択肢、APA形式での報告を支援します。
Metabolomics Workbench データを照会
作成者 davila7
メタボロミクス研究者は、公開研究、化合物レコード、標準化された名称へ迅速にアクセスする必要があります。このスキルは、Claude、Codex、Claude Code が REST API クエリと結果の解釈を行うためのガイドです。
matchmsで質量分析データを解析
作成者 davila7
質量分析解析は、インポート、フィルター、類似度スコアリングの過程で一貫性が失われることがあります。このスキルは、再現性のあるメタボロミクスワークフローのために、matchmsに特化したガイダンスを提供します。
HMDB代謝物データを検索
作成者 davila7
メタボロミクスの作業では、多くのレコードにわたって代謝物の同一性、スペクトル、経路、臨床的背景を確認することがよくあります。このスキルは、Claude、Codex、Claude CodeによるHMDB検索、ダウンロード、解釈ワークフローを支援します。
科学データファイルを分析
作成者 davila7
科学データファイルは、形式ごとに構造やメタデータの保存方法が異なるため、調査が困難です。このスキルは形式を検出し、データ品質をプロファイリングし、実用的な Markdown EDA レポートを作成します。
ScanpyでSingle-Cell RNA-Seqを解析する
作成者 davila7
Single-cell RNA-seqのワークフローには、慎重なQC、正規化、クラスタリング、ドキュメント化が必要です。このスキルは、再現可能な解析のためのScanpyワークフロー、スクリプト、テンプレート、リファレンスを提供します。
JSON、YAML、TOML データを処理する
作成者 0xDarkMatter
構造化された構成データは、JSON、YAML、TOML ファイルを横断して確認するのが難しい場合があります。このスキルは、抽出、フィルタリング、変換、更新のための jq と yq クエリを案内します。