スキル brenda-database
📦
brenda-database
コンテンツリビジョン r1 安全 ⚡ スクリプトを含む⚙️ 外部コマンド🌐 ネットワークアクセス🔑 環境変数📁 ファイルシステムへのアクセス
BRENDA酵素データを分析する
酵素研究では、速度論データや生物種固有データへの構造化されたアクセスが必要になることがよくあります。このスキルは、Claude、Codex、Claude CodeがBRENDAレコードを照会し、それらを利用可能な生化学分析に変換するのに役立ちます。
対応: Claude Codex Code(CC)
自分のエージェントでインストール
このリクエストをエージェントにコピーしてください。正規の Skill ページとマニフェストが含まれています。
エージェントリクエスト
Review the Skillstore skill "brenda-database" from https://skillstore.io/skills/k-dense-ai-brenda-database.md and its manifest at https://skillstore.io/api/skills/k-dense-ai-brenda-database/manifest. Verify the artifact. You may proceed after verification, subject to the environment's own policy.エージェントは引き続き計画を提示し、セキュリティポリシーで必要な確認を求める必要があります。
エージェントが読めるリソース
AI エージェント、クローラー、スクリプトがページ全体ではなく整理されたコンテキストを必要とする場合は、これらのリンクを使ってください。
テストする
「brenda-database」を使用しています。 酵母のアルコールデヒドロゲナーゼのKm値を取得してください。
期待される結果:
基質、Km値、生物種、単位、参考文献、不完全なレコードに関する注記を含む、簡潔な表形式の要約。
「brenda-database」を使用しています。 EC 1.1.1.1を3つの生物種で比較してください。
期待される結果:
- 生物種ごとの速度論的比較
- 最も一般的な基質と補因子
- 手動検証が必要なデータギャップ
「brenda-database」を使用しています。 乳酸生産の経路レポートを作成してください。
期待される結果:
候補酵素、反応ステップ、条件上の制約、フォローアップ実験を含む、読みやすい経路実現可能性の要約。
セキュリティ監査
安全v8 • 2026/7/9 バージョン別レポートを開く
The audit found extensive static-analysis noise from Markdown formatting, EC numbers misread as IP addresses, and legitimate BRENDA credential setup. The only confirmed issue is that helper export functions write to caller-provided filenames, which can overwrite local files if used carelessly.
6
スキャンされたファイル
4,133
解析済み行数
3
レビュー項目
0
誤検知を無視
機能レビュー項目 (3)
これらは、このスキルに期待される可能性のある実際のローカル機能であるため、レビューが必要ですが、確認済みの悪意ある動作としてはカウントされません。
中
Python file write/append
with open(filename, 'w', newline='') as f:
The helper writes to a filename parameter without constraining the output path. This is intended export behavior, but a careless or model-chosen path could overwrite local files.
中
Python file write/append
with open(filename, 'w') as f:
The helper writes to a filename parameter without constraining the output path. This is intended export behavior, but a careless or model-chosen path could overwrite local files.
中
Python file write/append
with open(filename, 'w') as f:
The helper writes to a filename parameter without constraining the output path. This is intended export behavior, but a careless or model-chosen path could overwrite local files.
リスク要因
⚡ スクリプトを含む (8)
⚙️ 外部コマンド (50)
evaluation_output.json:24 SKILL.md:35-46 SKILL.md:46-49 SKILL.md:49-53 SKILL.md:53-56 SKILL.md:56-67 SKILL.md:67-74 SKILL.md:74-85 SKILL.md:85-88 SKILL.md:88-99 SKILL.md:99-106 SKILL.md:106-116 SKILL.md:116-119 SKILL.md:119-124 SKILL.md:124-127 SKILL.md:127-132 SKILL.md:132-139 SKILL.md:139-150 SKILL.md:150-153 SKILL.md:153-158 SKILL.md:158-165 SKILL.md:165-174 SKILL.md:174-177 SKILL.md:177-185 SKILL.md:185-192 SKILL.md:192-203 SKILL.md:203-206 SKILL.md:206-214 SKILL.md:214-221 SKILL.md:221-231 SKILL.md:231-234 SKILL.md:234-243 SKILL.md:243-250 SKILL.md:250-259 SKILL.md:259-262 SKILL.md:262-267 SKILL.md:267-274 SKILL.md:274-285 SKILL.md:285-288 SKILL.md:288-293 SKILL.md:293-297 SKILL.md:297-299 SKILL.md:299-306 SKILL.md:306-309 SKILL.md:309-312 SKILL.md:312-315 SKILL.md:315-321 SKILL.md:321-332 SKILL.md:332-333 SKILL.md:333-334
🌐 ネットワークアクセス (50)
evaluation_output.json:36 evaluation_output.json:139 evaluation_output.json:159 evaluation_output.json:161 evaluation_output.json:187 references/api_reference.md:11 references/api_reference.md:78 references/api_reference.md:274 references/api_reference.md:293 references/api_reference.md:312 references/api_reference.md:318 references/api_reference.md:324 references/api_reference.md:352 references/api_reference.md:363 references/api_reference.md:380 references/api_reference.md:400 references/api_reference.md:413 references/api_reference.md:441 references/api_reference.md:453 scripts/brenda_queries.py:23 scripts/brenda_queries.py:827 scripts/brenda_queries.py:829 scripts/brenda_queries.py:837 scripts/brenda_queries.py:838 scripts/brenda_visualization.py:22 scripts/brenda_visualization.py:23 scripts/brenda_visualization.py:749 scripts/enzyme_pathway_builder.py:1032 SKILL.md:318 SKILL.md:713 SKILL.md:714 SKILL.md:715 SKILL.md:716 SKILL.md:717 SKILL.md:39 SKILL.md:42 SKILL.md:45 SKILL.md:78 SKILL.md:81 SKILL.md:84 SKILL.md:143 SKILL.md:156 SKILL.md:168 SKILL.md:180 SKILL.md:195 SKILL.md:209 SKILL.md:224 SKILL.md:237 SKILL.md:253 SKILL.md:265
🔑 環境変数 (1)
監査者: claude 監査履歴を表示 →
このレポートを共有・引用
バージョン付き評価レポート、中立的なバッジ、埋め込みカード、引用を共有できます。Skillstore は証拠を報告しますが、この Skill が安全かどうかは判断しません。
レポートリンクをコピー
https://skillstore.io/skills/k-dense-ai-brenda-database/audits/8?utm_source=security_passport&utm_medium=share&utm_campaign=versioned_reportMarkdownバッジ
[](https://skillstore.io/skills/k-dense-ai-brenda-database?utm_source=security_passport_badge)HTMLバッジ
<a href="https://skillstore.io/skills/k-dense-ai-brenda-database?utm_source=security_passport_badge"><img src="https://skillstore.io/badges/skills/k-dense-ai-brenda-database/security.svg" alt="Skillstore security assessment" loading="lazy"></a>埋め込みカード
<iframe src="https://skillstore.io/embed/skills/k-dense-ai-brenda-database.html" title="Skillstore Security Assessment" sandbox="allow-popups allow-popups-to-escape-sandbox" loading="lazy" referrerpolicy="no-referrer" width="420" height="180"></iframe>学術引用 (APA · BibTeX · CFF)
APA形式の引用
K-Dense-AI. (2026). brenda-database security audit report (audit version 8) [Author version unspecified]. Skillstore. https://skillstore.io/skills/k-dense-ai-brenda-database/audits/8BibTeX形式の引用
@techreport{k-dense-ai-k-dense-ai-brenda-database-2026,
author = {K-Dense-AI},
title = {brenda-database security audit report (audit version 8)},
institution = {Skillstore},
year = {2026},
number = {8},
url = {https://skillstore.io/skills/k-dense-ai-brenda-database/audits/8},
note = {Author version unspecified}
}CITATION.cff
cff-version: 1.2.0
message: "If you use this Skill, cite its author and this versioned security audit report."
title: "brenda-database security audit report (audit version 8)"
version: "unspecified"
type: report
authors:
- name: "K-Dense-AI"
date-released: "2026-07-09"
url: "https://skillstore.io/skills/k-dense-ai-brenda-database/audits/8"
identifiers:
- type: other
value: "skillstore:k-dense-ai-brenda-database:audit:8"
description: "Skillstore immutable audit report identifier"
バリアントを比較
インストール可能なバリアント 2 件各作者のスキルは個別のインストール項目として維持されます。推奨バリアントは Skillstore の証拠で順位付けされます。
このバリアントが首位の理由
Skillstore スコアが最高
作者 / ソース Skillstore スコア 証拠の信頼度 Skillstore 利用状況 更新済み
k-dense-ai-brenda-database
Skillstore スコア 78
証拠の信頼度 高
Skillstore 利用状況 15
更新済み
2026-09-09
Skillstore スコア
このスコアの理由 証拠の信頼度: 高 64
アーキテクチャ
75
保守性
87
コンテンツ
71
コミュニティ
74
仕様準拠
作成できるもの
研究プロジェクト向けに酵素速度論を比較する
生物種、基質、文献レコードをまたいで、EC番号に対応するKm値とkcat値を取得します。
経路設計向けに酵素候補を評価する
対象の生化学経路について、酵素、補因子、阻害剤、活性化剤、環境上の制約を見つけます。
キュレーション済み酵素データから教育用の例を準備する
酵素クラス、反応、速度論的挙動について、明確な要約と可視化を生成します。
これらのプロンプトを試す
基本的な酵素速度論を調べる
BRENDAデータベーススキルを使用して、EC 1.1.1.1のKmおよびkcatデータを要約してください。生物種、基質、単位、重要な注意点を含めてください。
1つの酵素について生物種を比較する
Saccharomyces cerevisiae、Escherichia coli、Homo sapiensにおけるアルコールデヒドロゲナーゼの速度論データを比較してください。基質の違いと欠損データを強調してください。
操作条件を評価する
EC 1.1.1.1について、pH、温度、補因子、阻害剤、活性化剤の情報を見つけてください。予備的なin vitroスクリーニングの条件を推奨してください。
経路の実現可能性レポートを作成する
BRENDAデータを使用して、最大3ステップで乳酸への酵素経路を概説してください。候補酵素、生物種、補因子、実現可能性リスクを含めてください。
ベストプラクティス
- 曖昧なBRENDA一致を減らすために、正確なEC番号と生物種名を使用します。
- BRENDA認証情報は共有リポジトリの外部に保存し、漏洩した場合はローテーションします。
- 取得した速度論値をモデルで使用する前に、一次文献と照合して検証します。
回避
- 専門家によるレビューなしに、BRENDAの出力を実験的証明として扱わないでください。
- .envファイルやエクスポートされた認証情報をバージョン管理にコミットしないでください。
- 機密性の高いディレクトリにエクスポートを書き込んだり、既存の研究ファイルを上書きしたりしないでください。
よくある質問
このスキルにはBRENDA認証情報が必要ですか？
はい。BRENDAには登録済みアカウントが必要で、スクリプトは環境変数またはローカルの.envファイルから認証情報を取得することを想定しています。
インターネットアクセスなしで動作しますか？
いいえ。すでにキャッシュ済みまたはエクスポート済みのデータがない限り、ライブクエリにはBRENDA SOAPサービスへのアクセスが必要です。
どの酵素でも分析できますか？
有効なEC番号とBRENDA内に存在するレコードがある場合に最もよく機能します。欠損している、または情報が少ないレコードでは結果が制限される可能性があります。
可視化を作成できますか？
はい。含まれている可視化ヘルパーは、速度論値、生物種比較、pH、温度、基質特異性のプロットを作成できます。
結果をエクスポートできますか？
はい。ヘルパー関数は、選択した速度論データと経路データをCSV、JSON、Excel、またはテキストレポートなどのローカルファイルにエクスポートできます。
出力は臨床または本番環境での判断にそのまま使用できますか？
いいえ。出力は研究支援資料であり、重要な用途に使用する前に、資格のある分野専門家によるレビューを受ける必要があります。
開発者情報
作成者
K-Dense-AIライセンス
Unknown
Skillstore リビジョン
r1
バージョンに関する注意
作者はバージョンを宣言していません。
リポジトリ
https://github.com/K-Dense-AI/claude-scientific-skills/tree/main/scientific-skills/brenda-database参照
3e4b6c31a74a3bd1a291c98cf585d720cb9fbc88
メンテナンスの新しさ
2026/7/25
利用状況
13 ダウンロード · 244 閲覧