metabolomics-workbench-database
Consultar la base de datos Metabolomics Workbench
También disponible en: davila7
Busca y recupera datos de metabolómica de la base de datos NIH Metabolomics Workbench que contiene más de 4,200 estudios. Accede a estructuras de metabolitos, metadatos de estudios, nomenclatura RefMet y realiza búsquedas de espectrometría de masas.
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Activa y empieza a usar
Pruébalo
Usando "metabolomics-workbench-database". Find all studies containing tyrosine
Resultado esperado:
- Se encontraron 47 estudios que contienen tirosina:
- ST000001 - Análisis metabolómico integral del metabolismo de aminoácidos
- ST000015 - Vías metabólicas de la tirosina en tejido hepático
- ST000042 - Perfilado de aminoácidos séricos en trastornos metabólicos
- Resumen del estudio: Metabolomics Workbench contiene 47 estudios que miden tirosina en diversos tejidos, especies y estados de enfermedad.
Usando "metabolomics-workbench-database". Search for compounds with m/z 180.06 using M+H adduct
Resultado esperado:
- Principales coincidencias para m/z 180.06 (M+H, tolerancia 0.5 Da):
- Registry 11: Glucosa (C6H12O6) - masa exacta 179.058
- Registry 156: Fructosa (C6H12O6) - masa exacta 179.058
- Registry 203: Manosa (C6H12O6) - masa exacta 179.058
- Nota: Estos monosacáridos comparten la misma fórmula molecular
Auditoría de seguridad
SeguroAll 344 static findings are FALSE POSITIVES. The analyzer misidentified markdown documentation code blocks as shell commands, mass spectrometry ion adduct notation (M+H, M-H) as weak cryptographic algorithms, and legitimate database API calls as suspicious network activity. This is a documentation-only skill for the NIH Metabolomics Workbench - a legitimate scientific research database. No executable code exists.
Factores de riesgo
🌐 Acceso a red (2)
⚙️ Comandos externos (2)
📁 Acceso al sistema de archivos (1)
Puntuación de calidad
Lo que puedes crear
Encontrar estudios para un metabolito
Busca todos los estudios de metabolómica que contengan mediciones de un metabolito específico como glucosa o citrato.
Identificar compuestos a partir de datos MS
Introduce valores m/z de espectrometría de masas para identificar posibles candidatos de metabolitos que coincidan con tus datos.
Filtrar estudios por enfermedad
Encuentra estudios de metabolómica para enfermedades específicas como diabetes o cáncer usando plataformas analíticas específicas.
Prueba estos prompts
Find all studies in the Metabolomics Workbench that contain measurements of [metabolite_name]. Return study IDs and brief descriptions.
Search the Metabolomics Workbench for compounds matching m/z [value] with [M+H] adduct and 0.5 Da tolerance. List the top matches.
Use RefMet to standardize the metabolite name [common_name]. Return the standardized name and classification hierarchy.
Find human blood metabolomics studies on [disease_name] using [LCMS or GCMS or NMR] analytical method.
Mejores prácticas
- Usa RefMet para estandarizar nombres de metabolitos antes de buscar estudios para obtener resultados consistentes
- Establece una tolerancia de masa adecuada según la resolución de tu instrumento (0.5 Da para baja resolución, 0.01 Da para MS de alta resolución)
- Cache Ref making many queries toMet database locally when reduce API calls
Evitar
- Buscar metabolitos sin usar la estandarización RefMet puede pasar por alto estudios relevantes
- Usar una tolerancia de masa excesiva devuelve demasiadas coincidencias falsas positivas
- Hacer solicitudes secuenciales rápidas sin demoras puede activar límites de tasa