hmdb-database
Buscar datos de metabolitos en la Human Metabolome Database
متاح أيضًا من: K-Dense-AI
Los investigadores necesitan acceso rápido a información sobre metabolitos para estudios de metabolómica. Esta habilidad proporciona orientación para buscar en la Human Metabolome Database y encontrar propiedades químicas, biomarcadores y datos espectrales para la identificación e investigación de metabolitos.
تنزيل ZIP المهارة
رفع في Claude
اذهب إلى Settings → Capabilities → Skills → Upload skill
فعّل وابدأ الاستخدام
اختبرها
استخدام "hmdb-database". Encuentra información sobre glucosa en HMDB
النتيجة المتوقعة:
- Name: D-Glucose
- Formula: C6H12O6
- Molecular Weight: 180.156 g/mol
- SMILES: C(C1C(C(C(C(O1)O)O)O)O)O
- Found in: Blood, urine, CSF, saliva
- Pathways: Glycolysis, Glycogenesis, Gluconeogenesis
- Associated enzymes: Hexokinase, Glucose-6-phosphatase
- Concentration in blood: 4.0-5.9 mM (fasting)
استخدام "hmdb-database". Encuentra biomarcadores para diabetes
النتيجة المتوقعة:
- Search HMDB for disease-associated metabolites
- Review concentration ranges in normal vs. disease states
- Identify metabolites with strong differential abundance
- Cross-reference with clinical literature
التدقيق الأمني
آمنAll 128 static findings are FALSE POSITIVES. This skill contains only Markdown documentation about the Human Metabolome Database with no executable code, network operations, filesystem access, or environment variable access. The scanner misinterpreted Markdown code formatting as shell commands, chemical notation (InChI/SMILES) as cryptographic algorithms, and legitimate URLs as security risks.
عوامل الخطر
⚡ يحتوي على سكربتات
🌐 الوصول إلى الشبكة
📁 الوصول إلى نظام الملفات
🔑 متغيرات البيئة
⚙️ الأوامر الخارجية
درجة الجودة
ماذا يمكنك بناءه
Identificación de metabolitos
Identificar compuestos desconocidos en experimentos de metabolómica usando coincidencia espectral y comparación de propiedades químicas.
Descubrimiento de biomarcadores
Buscar metabolitos asociados a enfermedades y sus rangos de concentración normales en fluidos biológicos.
Análisis de rutas metabólicas
Mapear metabolitos a rutas metabólicas y encontrar enzimas asociadas para investigación bioquímica.
جرّب هذه الموجهات
Encuentra detalles sobre [metabolite name] en HMDB incluyendo fórmula química, peso molecular y ubicación biológica.
Busca en HMDB metabolitos que sean biomarcadores para [disease name]. Incluye datos de concentración y significancia clínica.
Encuentra datos espectrales de NMR o MS para [metabolite] en HMDB. Incluye condiciones experimentales y picos de referencia.
Muestra las rutas metabólicas asociadas con [metabolite] en HMDB incluyendo nombres de enzimas e IDs de rutas SMPDB.
أفضل الممارسات
- Verificar identificaciones de metabolitos usando múltiples tipos de datos como espectros, estructura y peso molecular
- Citar HMDB y números de acceso específicos en publicaciones para reproducibilidad
- Descargar conjuntos de datos completos para análisis a gran escala en lugar de consultas web repetidas
تجنب
- Aceptar coincidencias de un solo punto de datos sin verificar con evidencia adicional
- Usar datos de HMDB sin verificar indicadores de calidad de datos o el estado experimental versus predicho
- Olvidar anotar la versión de HMDB utilizada en la investigación para una documentación adecuada