Fähigkeiten biorxiv-database
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biorxiv-database

Sicher 🌐 Netzwerkzugriff📁 Dateisystemzugriff

bioRxiv-Preprints nach Schlüsselwörtern, Autoren und Daten durchsuchen

Auch verfügbar von: davila7

Forscher verschwenden Stunden damit, bioRxiv manuell nach relevanten Preprints zu durchsuchen. Diese Fähigkeit automatisiert die Literaturrecherche mit präziser Filterung nach Schlüsselwörtern, Autoren, Datumsbereichen und wissenschaftlichen Kategorien.

Unterstützt: Claude Codex Code(CC)
🥉 76 Bronze
1

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2

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3

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Teste es

Verwendung von "biorxiv-database". Suche nach COVID-19-Impfstoffarbeiten aus dem Jahr 2021

Erwartetes Ergebnis:

  • 342 Arbeiten gefunden, die Ihren Kriterien entsprechen
  • Top-Ergebnis: 'mRNA-Impfstoffwirksamkeit gegen Varianten' von Smith et al.
  • DOI: 10.1101/2021.03.15.123456
  • Veröffentlicht: 15. März 2021
  • Abstract: Wir analysierten die Impfstoffwirksamkeit...
  • PDF zum Download verfügbar

Verwendung von "biorxiv-database". Finde Neurowissenschaftenarbeiten vom Autor 'Yong' aus dem Jahr 2024

Erwartetes Ergebnis:

  • 8 Arbeiten gefunden
  • Aktuell: 'Kartierung neuronaler Schaltkreise in vivo' von Yong et al.
  • Datum: 2024-08-20
  • Kategorie: Neurowissenschaften
  • PDF bereit zum Herunterladen

Sicherheitsaudit

Sicher
v4 • 1/17/2026

The static analyzer flagged 248 issues, but all are false positives. Markdown documentation backticks were misidentified as shell command execution. The Python script is a straightforward bioRxiv API client that makes legitimate requests to https://api.biorxiv.org, saves results to files, and optionally supports API key authentication. No malicious intent, data exfiltration, or suspicious behavior patterns found.

4
Gescannte Dateien
1,425
Analysierte Zeilen
2
befunde
4
Gesamtzahl Audits

Risikofaktoren

🌐 Netzwerkzugriff (1)
scripts/biorxiv_search.py:23
📁 Dateisystemzugriff (1)
scripts/biorxiv_search.py:255
Auditiert von: claude Audit-Verlauf anzeigen →

Qualitätsbewertung

64
Architektur
100
Wartbarkeit
87
Inhalt
21
Community
100
Sicherheit
91
Spezifikationskonformität

Was du bauen kannst

Literaturübersicht für Thesis

Durchsuchen Sie aktuelle Preprints in Ihrem Fachgebiet, laden Sie relevante Arbeiten herunter und verfolgen Sie Zitationen für umfassende Literaturübersichten.

Konkurrenzforschung überwachen

Verfolgen Sie Veröffentlichungen bestimmter Autoren oder Labors, um über konkurrierende Forschung in Ihrem Fachgebiet auf dem Laufenden zu bleiben.

Trendanalyse in den Lebenswissenschaften

Analysieren Sie Veröffentlichungsmuster im Zeitverlauf, um aufkommende Forschungstrends und Hotspots zu identifizieren.

Probiere diese Prompts

Grundlegende Schlüsselwörtersuche 
Suche bioRxiv nach Preprints über CRISPR-Genom编辑, die in den letzten 30 Tagen veröffentlicht wurden, und speichere die Ergebnisse in crispr_recent.json
Autorenverfolgung 
Finde alle Preprints vom Autor 'Zhang F' aus den Jahren 2023-2024 und lade die PDFs herunter
Kategoriefilterung 
Suche nach maschinellen Lernarbeiten in der Neurowissenschaftenkategorie aus den letzten 6 Monaten, einschließlich Abstracts
Systematische Übersicht 
Suche bioRxiv nach Arbeiten mit den Schlüsselwörtern: 'single-cell RNA-seq', 'spatial transcriptomics', 'multi-omics', veröffentlicht zwischen 2022-2024, filtere nach der Bioinformatik-Kategorie und exportiere vollständige Metadaten

Bewährte Verfahren

  • Verwenden Sie Kategoriefilter, um Ergebnisse einzugrenzen und die Suchpräzision zu verbessern
  • Implementieren Sie Caching, um wiederholte API-Aufrufe für dieselben Anfragen zu vermeiden
  • Respektieren Sie Rate-Limits, indem Sie Verzögerungen zwischen Massenoperationen einfügen

Vermeiden

  • Vermeiden Sie das Suchen ohne Datumsbereiche - dies bringt zu viele Ergebnisse
  • Stellen Sie keine gleichzeitigen Anfragen - dies verstößt gegen bioRxiv's Rate-Limits
  • DOIs niemals fest in Skripten kodieren - verwenden Sie Suchergebnisse immer dynamisch

Häufig gestellte Fragen

Sucht dies auch medRxiv-Preprints?
Nein, diese Fähigkeit sucht nur bioRxiv nach Lebenswissenschaften-Preprints. MedRxiv erfordert separaten API-Zugang.
Wie viele Arbeiten kann ich auf einmal herunterladen?
Die API gibt bis zu 100 Arbeiten pro Suche zurück. Laden Sie PDFs einzeln mit 0,5s Verzögerungen zwischen Anfragen herunter.
Kann ich nach Volltextinhalten suchen?
Suchen durchsuchen nur Titel, Abstracts und Autorennamen. Volltextsuche erfordert das separate Herunterladen von PDFs.
Welche Datumsformate werden akzeptiert?
Verwenden Sie das Format JJJJ-MM-TT (z.B. 2024-01-15). Sie können auch --days-back für relative Daten verwenden.
Sind veröffentlichte Arbeiten enthalten?
Ergebnisse umfassen alle bioRxiv-Preprints unabhängig vom Veröffentlichungsstatus. Überprüfen Sie das 'published'-Feld für Zeitschriftinformationen.
Wie zitiere ich gefundene Arbeiten mit diesem Tool?
Jedes Ergebnis enthält DOI, Autoren, Titel und Datum. Verwenden Sie die DOI, um richtige Zitationen in Ihrem Referenzmanager zu generieren.

Entwicklerdetails

Lizenz

MIT

Repository

https://github.com/K-Dense-AI/claude-scientific-skills/tree/main/scientific-skills/biorxiv-database

Ref

main

Dateistruktur

📁 references/

📄 api_reference.md

📁 scripts/

📄 biorxiv_search.py

📄 SKILL.md