技能 zinc-database
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zinc-database

内容修订 r1 安全 ⚙️ 外部命令🌐 网络访问

搜索 ZINC 化合物

药物发现团队需要快速访问可购买化合物和可用于对接的结构。此技能指导 Claude、Codex 和 Claude Code 完成 ZINC 搜索、API 查询以及结构下载工作流。

支持: Claude Codex Code(CC)
📊 73 合格

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智能体请求
Review the Skillstore skill "zinc-database" from https://skillstore.io/skills/k-dense-ai-zinc-database.md and its manifest at https://skillstore.io/api/skills/k-dense-ai-zinc-database/manifest. Verify the artifact. You may proceed after verification, subject to the environment's own policy.

你的智能体仍应展示其计划，并按安全策略请求必要确认。

Agent 可读资源

当 AI Agent、爬虫或脚本需要干净上下文，而不是读取完整页面时，请使用这些链接。

Markdown 详情 GET /skills/k-dense-ai-zinc-database.md 已签名 manifest GET /api/skills/k-dense-ai-zinc-database/manifest 已签名 lockfile GET /api/skills/k-dense-ai-zinc-database/lockfile

测试它

正在使用“zinc-database”。 查找 ZINC ID 的详细信息。

预期结果:

响应会说明 ZINC ID 端点，建议请求 SMILES 和 catalog 字段，并描述如何解读返回的表格。

正在使用“zinc-database”。 查找某个 SMILES 结构的类似物。

预期结果:

响应会建议精确搜索和相似性搜索，解释距离参数，并列出有助于对可购买类似物进行排序的字段。

正在使用“zinc-database”。 从 tranche 准备对接库。

预期结果:

响应会识别 ZINC22 文件仓库路径，说明可用的结构格式，并建议从小型 tranche 样本开始。

安全审计

安全
v8 • 2026/7/9 打开版本化报告

The static findings are false positives from scientific documentation for public ZINC and CartBlanche22 data access. The subprocess examples use curl to reach documented endpoints, Markdown backticks were misread as execution, and .db2 files are DOCK compound library files rather than sensitive SQLite databases. No prompt injection, exfiltration intent, or malicious control behavior was found.

3
已扫描文件
1,290
分析行数
0
复核项
0
已忽略误报

风险因素

⚙️ 外部命令 (50)
EVALUATION_OUTPUT.json:18 EVALUATION_OUTPUT.json:21 EVALUATION_OUTPUT.json:24 references/api_reference.md:400 references/api_reference.md:529 references/api_reference.md:653 SKILL.md:280 SKILL.md:286 SKILL.md:294 SKILL.md:50 SKILL.md:63-65 SKILL.md:65-68 SKILL.md:68-70 SKILL.md:70-72 SKILL.md:72 SKILL.md:81-83 SKILL.md:83-86 SKILL.md:86-87 SKILL.md:87-88 SKILL.md:88-89 SKILL.md:89-92 SKILL.md:92-94 SKILL.md:94-97 SKILL.md:97-99 SKILL.md:99-108 SKILL.md:108-110 SKILL.md:110-124 SKILL.md:124-126 SKILL.md:126-129 SKILL.md:129-130 SKILL.md:130-131 SKILL.md:131-134 SKILL.md:134-136 SKILL.md:136-145 SKILL.md:145-148 SKILL.md:148-151 SKILL.md:151-160 SKILL.md:160-167 SKILL.md:167-169 SKILL.md:169-172 SKILL.md:172-174 SKILL.md:174-177 SKILL.md:177-183 SKILL.md:183-190 SKILL.md:190-197 SKILL.md:197-200 SKILL.md:200-202 SKILL.md:202-214 SKILL.md:214-216 SKILL.md:216-222
🌐 网络访问 (50)
references/api_reference.md:36 references/api_reference.md:43 references/api_reference.md:48 references/api_reference.md:54 references/api_reference.md:79 references/api_reference.md:86 references/api_reference.md:91 references/api_reference.md:96 references/api_reference.md:103 references/api_reference.md:124 references/api_reference.md:129 references/api_reference.md:145 references/api_reference.md:152 references/api_reference.md:157 references/api_reference.md:162 references/api_reference.md:167 references/api_reference.md:206 references/api_reference.md:211 references/api_reference.md:283 references/api_reference.md:293 references/api_reference.md:316 references/api_reference.md:323 references/api_reference.md:324 references/api_reference.md:325 references/api_reference.md:335 references/api_reference.md:383 references/api_reference.md:388 references/api_reference.md:392 references/api_reference.md:558 references/api_reference.md:571 SKILL.md:43 SKILL.md:44 SKILL.md:50 SKILL.md:60 SKILL.md:64 SKILL.md:69 SKILL.md:78 SKILL.md:82 SKILL.md:93 SKILL.md:98 SKILL.md:105 SKILL.md:109 SKILL.md:121 SKILL.md:125 SKILL.md:135 SKILL.md:147 SKILL.md:173 SKILL.md:201 SKILL.md:215 SKILL.md:234
最新一次完成的静态与语义审计未检测到已确认的安全发现。这并不能证明该 Skill 没有副作用。
审计者: claude 查看审计历史 →
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HTML 徽章

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嵌入卡片

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学术引用 (APA · BibTeX · CFF)

APA 引用

K-Dense-AI. (2026). zinc-database security audit report (audit version 8) [Author version unspecified]. Skillstore. https://skillstore.io/skills/k-dense-ai-zinc-database/audits/8

BibTeX 引用

@techreport{k-dense-ai-k-dense-ai-zinc-database-2026, author = {K-Dense-AI}, title = {zinc-database security audit report (audit version 8)}, institution = {Skillstore}, year = {2026}, number = {8}, url = {https://skillstore.io/skills/k-dense-ai-zinc-database/audits/8}, note = {Author version unspecified} }

CITATION.cff

cff-version: 1.2.0 message: "If you use this Skill, cite its author and this versioned security audit report." title: "zinc-database security audit report (audit version 8)" version: "unspecified" type: report authors: - name: "K-Dense-AI" date-released: "2026-07-09" url: "https://skillstore.io/skills/k-dense-ai-zinc-database/audits/8" identifiers: - type: other value: "skillstore:k-dense-ai-zinc-database:audit:8" description: "Skillstore immutable audit report identifier"

比较变体

2 个可安装变体

每位作者的技能都保持为独立的可安装项。推荐变体按 Skillstore 证据排序。

为什么此变体排名第一

Skillstore 评分最高
davila7 推荐

davila7-zinc-database

Skillstore 评分 74
证据置信度 高
Skillstore 使用量 13
已更新

2026-09-09

K-Dense-AI 当前

k-dense-ai-zinc-database

Skillstore 评分 73
证据置信度 高
Skillstore 使用量 11
已更新

2026-09-09

Skillstore 评分

评分依据 证据置信度: 高
41
架构
75
可维护性
87
内容
70
社区
83
规范符合性

你能构建什么

查找可购买类似物

在已知 SMILES 结构附近搜索，并收集带有供应商信息的相关化合物。

准备对接库

识别分子对接实验所需的 tranche 文件和结构格式。

构建筛选数据集

检索随机或经过筛选的 ZINC 化合物集合，用于基准测试和虚拟筛选流水线。

试试这些提示

查询一个化合物 
Use the ZINC database skill to show me how to look up ZINC000000000001 and return its SMILES and supplier catalogs.
查找相似化合物 
Use the ZINC database skill to plan a similarity search for this SMILES: c1ccccc1. Include useful output fields and distance settings.
筛选一个筛选集合 
Use the ZINC database skill to design a workflow for collecting 1,000 lead-like purchasable compounds with ZINC IDs, SMILES, tranches, and catalogs.
准备对接输入 
Use the ZINC database skill to explain how to locate docking-ready 3D structure files for a chosen tranche and prepare them for a DOCK6 workflow.

最佳实践

  • 在进行广泛相似性搜索或随机采样之前，先从精确的 ZINC ID 或 SMILES 搜索开始。
  • 只请求分析所需的字段，以减少响应大小和处理时间。
  • 在为对接工作流检索大型 tranche 文件之前，先使用小型测试下载。

避免

  • 不要在没有延迟或重试退避的情况下快速重复调用 API。
  • 不要在未检查返回的 catalog 数据前，假定供应商可用性是最新的。
  • 在确认目标格式和存储需求之前，不要下载完整的 tranche 目录。

常见问题

ZINC 用于什么？
ZINC 用于搜索可购买化合物，支持虚拟筛选、药物发现和分子对接研究。
此技能可以按 SMILES 搜索吗？
可以。它记录了使用 SMILES strings 和距离参数进行精确搜索和相似性搜索的方法。
此技能提供 3D 结构吗？
它会指导用户访问托管可用于对接格式的 ZINC 文件仓库，例如 MOL2、SDF 和 DB2.GZ。
它需要 API key 吗？
文档中的公共 ZINC 和 CartBlanche22 示例不需要 API key。
我可以用它做供应商检查吗？
可以。它解释了供应商代码搜索和 catalog 字段，这些有助于验证可购买化合物的可用性。
下载文件时应注意什么？
从小文件开始，确认 tranche 和格式，并在批量访问期间遵守服务器速率限制。

开发者详情

作者

K-Dense-AI

许可证

Unknown

Skillstore 修订

r1

版本提示

作者未声明版本。

仓库

https://github.com/K-Dense-AI/claude-scientific-skills/tree/main/scientific-skills/zinc-database

引用

1ffa7643651792ccb4bd3b15d924d2c97edff755

维护新鲜度

2026/7/18

使用量

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文件结构

📁 references/

📄 api_reference.md

📄 EVALUATION_OUTPUT.json

📄 SKILL.md

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