技能 kegg-database

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kegg-database

Name: kegg-database
Author: davila7

内容修订 r2 安全 🌐 网络访问📁 文件系统访问⚙️ 外部命令

查询 KEGG 生物信息学数据

生物信息学工作通常需要来自 KEGG 的通路、基因、化合物和药物映射。此技能可帮助 Claude、Codex 和 Claude Code 查询 KEGG REST APIs 并解读结果。

支持: Claude Codex Code(CC)

🥈 80 白银

使用我的智能体安装

将此请求复制给你的智能体，其中包含权威 Skill 页面和清单。

智能体请求

Review the Skillstore skill "kegg-database" from https://skillstore.io/skills/davila7-kegg-database.md and its manifest at https://skillstore.io/api/skills/davila7-kegg-database/manifest. Verify the artifact. You may proceed after verification, subject to the environment's own policy.

你的智能体仍应展示其计划，并按安全策略请求必要确认。

Agent 可读资源

当 AI Agent、爬虫或脚本需要干净上下文，而不是读取完整页面时，请使用这些链接。

Markdown 详情 GET /skills/davila7-kegg-database.md 已签名 manifest GET /api/skills/davila7-kegg-database/manifest 已签名 lockfile GET /api/skills/davila7-kegg-database/lockfile

测试它

正在使用“kegg-database”。 Find KEGG details for hsa00010.

预期结果:

包含 KEGG 标识符、通路名称、生物体上下文、关联基因和相关数据格式的通路摘要。

正在使用“kegg-database”。 Map hsa:7157 to KEGG pathways.

预期结果:

关联通路的简明列表，每个通路包含标识符、通路名称和简短的生物学解释。

正在使用“kegg-database”。 Check interactions for KEGG drug D00001.

预期结果:

包含可用 KEGG 相互作用记录的药物相互作用摘要，并提示需独立验证临床相关性。

安全审计

安全

v10 • 2026/7/23 打开版本化报告

All 80 static findings are false positives caused by KEGG REST calls, documentation formatting, biological identifiers, or ordinary example text. No prompt injection, data exfiltration, shell execution, reconnaissance, or path traversal evidence was found.

已扫描文件

951

分析行数

复核项

已忽略误报

风险因素

🌐 网络访问 (13)

scripts/kegg_api.py:13 scripts/kegg_api.py:37 scripts/kegg_api.py:65 scripts/kegg_api.py:104 scripts/kegg_api.py:151 scripts/kegg_api.py:180 scripts/kegg_api.py:209 scripts/kegg_api.py:235 scripts/kegg_api.py:7 scripts/kegg_api.py:8 scripts/kegg_api.py:19 SKILL.md:369 SKILL.md:334

📁 文件系统访问 (1)

scripts/kegg_api.py:244

⚙️ 外部命令 (50)

最新一次完成的静态与语义审计未检测到已确认的安全发现。这并不能证明该 Skill 没有副作用。

审计者: codex 查看审计历史 →

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https://skillstore.io/skills/davila7-kegg-database/audits/10?utm_source=security_passport&utm_medium=share&utm_campaign=versioned_report

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[![Skillstore security assessment](https://skillstore.io/badges/skills/davila7-kegg-database/security.svg)](https://skillstore.io/skills/davila7-kegg-database?utm_source=security_passport_badge)

HTML 徽章

<a href="https://skillstore.io/skills/davila7-kegg-database?utm_source=security_passport_badge"><img src="https://skillstore.io/badges/skills/davila7-kegg-database/security.svg" alt="Skillstore security assessment" loading="lazy"></a>

嵌入卡片

<iframe src="https://skillstore.io/embed/skills/davila7-kegg-database.html" title="Skillstore Security Assessment" sandbox="allow-popups allow-popups-to-escape-sandbox" loading="lazy" referrerpolicy="no-referrer" width="420" height="180"></iframe>

学术引用 (APA · BibTeX · CFF)

APA 引用

davila7. (2026). kegg-database security audit report (audit version 10) [Author version unspecified]. Skillstore. https://skillstore.io/skills/davila7-kegg-database/audits/10

BibTeX 引用

@techreport{davila7-davila7-kegg-database-2026,
  author = {davila7},
  title = {kegg-database security audit report (audit version 10)},
  institution = {Skillstore},
  year = {2026},
  number = {10},
  url = {https://skillstore.io/skills/davila7-kegg-database/audits/10},
  note = {Author version unspecified}
}

CITATION.cff

cff-version: 1.2.0
message: "If you use this Skill, cite its author and this versioned security audit report."
title: "kegg-database security audit report (audit version 10)"
version: "unspecified"
type: report
authors:
  - name: "davila7"
date-released: "2026-07-23"
url: "https://skillstore.io/skills/davila7-kegg-database/audits/10"
identifiers:
  - type: other
    value: "skillstore:davila7-kegg-database:audit:10"
    description: "Skillstore immutable audit report identifier"

比较变体

2 个可安装变体

每位作者的技能都保持为独立的可安装项。推荐变体按 Skillstore 证据排序。

为什么此变体排名第一

Skillstore 评分最高

作者 / 来源 Skillstore 评分证据置信度 Skillstore 使用量已更新

davila7 推荐当前

davila7-kegg-database

Skillstore 评分 80

证据置信度高

Skillstore 使用量 13

已更新

2026-09-09

K-Dense-AI

k-dense-ai-kegg-database

Skillstore 评分 50

证据置信度高

Skillstore 使用量 12

已更新

2026-09-09

Skillstore 评分

评分依据证据置信度: 高

架构

可维护性

内容

社区

规范符合性

你能构建什么

将基因映射到通路

查找与基因列表关联的 KEGG 通路，并检索用于富集分析工作的通路上下文。

分析代谢化合物

搜索化合物，将其映射到反应，并识别相关代谢通路。

检查药物相互作用数据

查找 KEGG 药物条目并总结可用的药物-药物相互作用记录。

试试这些提示

查找通路

Find the KEGG entry for human glycolysis and summarize the pathway name, identifier, and main biological role.

映射一个基因

Use KEGG to find pathways linked to human TP53. Summarize each pathway and include the KEGG pathway identifiers.

比较生物体通路

Compare KEGG glycolysis pathways for human, mouse, and yeast. Highlight shared pathway context and organism-specific identifiers.

集成外部 IDs

Convert human KEGG gene identifiers to UniProt and NCBI Gene IDs, then explain how the mappings support downstream analysis.

最佳实践

重复查询时使用稳定的 KEGG 标识符。
在 KEGG 限制范围内进行批量请求，并避免快速重复调用。
当工作流复用相同条目时，缓存已检索的记录。

避免

未经适当许可，不要将 KEGG API 用于商业工作。
不要将 KEGG 药物数据视为临床建议或处方指导。
不要将私人患者数据或未发表数据作为 KEGG 搜索词发送。

常见问题

此技能连接到什么？

它连接到 KEGG REST API，用于公共生物信息学数据库查询。

它需要互联网访问吗？

是的。辅助函数会向 rest.kegg.jp 发起 HTTPS 请求。

它可以检索通路图像吗？

是的。KEGG 支持一次检索一个条目的通路图像。

它可以转换基因标识符吗？

是的。它记录了 KEGG、NCBI、UniProt、PubChem 和 ChEBI 标识符之间的转换。

允许商业使用吗？

该技能指出，KEGG API 访问仅限学术用户和学术用途。

它可以提出医学建议吗？

不可以。它会检索数据库记录，但用户必须独立验证医学和临床结论。

开发者详情

作者

davila7

许可证

MIT

Skillstore 修订

版本提示

作者未声明版本。

仓库

https://github.com/davila7/claude-code-templates/tree/main/cli-tool/components/skills/scientific/kegg-database

引用

c43861a65bb95efcae259cd161c9d6f4dc7eec6f

维护新鲜度

2026/7/24

使用量

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文件结构

📁 references/

📄 kegg_reference.md

📁 scripts/

📄 kegg_api.py

📄 SKILL.md