技能 dnanexus-integration

📦

dnanexus-integration

Name: dnanexus-integration
Author: davila7

内容修订 r2 中风险 ⚙️ 外部命令🔑 环境变量🌐 网络访问

构建 DNAnexus 基因组学工作流

基因组学团队常常需要 DNAnexus 代码模式，而不想查找多份参考资料。此技能为 Claude、Codex 和 Claude Code 提供 app、data、workflow 和 dxpy 指南。

支持: Claude Codex Code(CC)

⚠️ 50 差

使用我的智能体安装

将此请求复制给你的智能体，其中包含权威 Skill 页面和清单。

智能体请求

Review the Skillstore skill "dnanexus-integration" from https://skillstore.io/skills/davila7-dnanexus-integration.md and its manifest at https://skillstore.io/api/skills/davila7-dnanexus-integration/manifest. Verify the artifact. You may proceed after verification, subject to the environment's own policy.

你的智能体仍应展示其计划，并按安全策略请求必要确认。

Agent 可读资源

当 AI Agent、爬虫或脚本需要干净上下文，而不是读取完整页面时，请使用这些链接。

Markdown 详情 GET /skills/davila7-dnanexus-integration.md 已签名 manifest GET /api/skills/davila7-dnanexus-integration/manifest 已签名 lockfile GET /api/skills/davila7-dnanexus-integration/lockfile

测试它

正在使用“dnanexus-integration”。为质量过滤配对 FASTQ 文件创建一个 DNAnexus applet。

预期结果:

一份简洁的 applet 设计，包括输入和输出名称、文件类别以及资源假设。
一份开发检查清单，涵盖本地测试、平台测试、日志记录和结果验证。
一份权限审查，只请求所需的网络和项目访问权限。

正在使用“dnanexus-integration”。规划跨多个项目的 RNA-seq 输出数据组织。

预期结果:

针对原始数据、中间文件、最终结果和报告的 folder 与元数据策略。
面向 dxpy 的操作计划，涵盖搜索、复制、打标签和 record 更新。
针对访问级别、可审计性和意外数据暴露的审查检查清单。

正在使用“dnanexus-integration”。将三个 applets 转换为一个受监控的 DNAnexus workflow。

预期结果:

包含作业依赖、预期输出和重试点的步骤顺序。
针对作业状态、日志、失败和最终输出收集的监控计划。

安全审计

中风险

v9 • 2026/7/23 打开版本化报告

All 45 static alerts are false positives caused by inert documentation, Markdown formatting, placeholders, and legitimate DNAnexus examples. No prompt injection or malicious data-exfiltration intent was found. Three medium-risk documentation issues remain concerning permissions, destructive cloud operations, and bearer token handling.

已扫描文件

2,610

分析行数

复核项

已忽略误报

已确认安全问题 (3)

中

references/configuration.md:442-452

Overbroad DNAnexus Access Example

The configuration example combines unrestricted internet, project write, cross-project read, and developer access. Copying it can grant unnecessary privileges.

The permissions are explicitly combined in one copyable example. Each listed permission expands the app's authority beyond a minimal default.

中

references/data-operations.md:275-285 references/data-operations.md:319-330 references/job-execution.md:310-320

Sensitive Cloud Operations Lack Confirmation Guidance

The references show user invitations, permanent file deletion, and job termination without requiring target checks or explicit confirmation. Mistakes can alter access or lose work.

The cited examples directly perform privileged or destructive remote actions. No adjacent instruction requires impact review or user confirmation.

中

references/python-sdk.md:28-44

Bearer Token Placement in Examples

Authentication examples place token placeholders directly in Python and a shell export. Replacing them with real tokens can expose secrets through source or shell history.

The examples visibly assign a bearer token literal in code and a shell command. Placeholders reduce immediate exposure but encourage unsafe substitution.

审计者: codex 查看审计历史 →

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HTML 徽章

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嵌入卡片

<iframe src="https://skillstore.io/embed/skills/davila7-dnanexus-integration.html" title="Skillstore Security Assessment" sandbox="allow-popups allow-popups-to-escape-sandbox" loading="lazy" referrerpolicy="no-referrer" width="420" height="180"></iframe>

学术引用 (APA · BibTeX · CFF)

APA 引用

davila7. (2026). dnanexus-integration security audit report (audit version 9) [Author version unspecified]. Skillstore. https://skillstore.io/skills/davila7-dnanexus-integration/audits/9

BibTeX 引用

@techreport{davila7-davila7-dnanexus-integration-2026,
  author = {davila7},
  title = {dnanexus-integration security audit report (audit version 9)},
  institution = {Skillstore},
  year = {2026},
  number = {9},
  url = {https://skillstore.io/skills/davila7-dnanexus-integration/audits/9},
  note = {Author version unspecified}
}

CITATION.cff

cff-version: 1.2.0
message: "If you use this Skill, cite its author and this versioned security audit report."
title: "dnanexus-integration security audit report (audit version 9)"
version: "unspecified"
type: report
authors:
  - name: "davila7"
date-released: "2026-07-23"
url: "https://skillstore.io/skills/davila7-dnanexus-integration/audits/9"
identifiers:
  - type: other
    value: "skillstore:davila7-dnanexus-integration:audit:9"
    description: "Skillstore immutable audit report identifier"

比较变体

2 个可安装变体

每位作者的技能都保持为独立的可安装项。推荐变体按 Skillstore 证据排序。

为什么此变体排名第一

Skillstore 评分最高

作者 / 来源 Skillstore 评分证据置信度 Skillstore 使用量已更新

K-Dense-AI 推荐

k-dense-ai-dnanexus-integration

Skillstore 评分 71

证据置信度高

Skillstore 使用量 9

已更新

2026-09-09

davila7 当前

davila7-dnanexus-integration

Skillstore 评分 50

证据置信度高

Skillstore 使用量 8

已更新

2026-09-09

Skillstore 评分

评分依据证据置信度: 高

架构

可维护性

内容

社区

规范符合性

你能构建什么

创建基因组学 Applet

为 FASTQ 比对设计一个 DNAnexus applet，包括类型化输入、输出、资源和部署步骤。

组织 Project 数据

使用 dxpy data operations 规划文件上传、records、元数据、folders 和 project transfers。

自动化 Workflow 运行

构建一个多步骤 DNAnexus workflow 计划，包括作业监控和输出处理。

试试这些提示

启动 DNAnexus Applet

帮助我为 [analysis goal] 创建一个 DNAnexus applet。包括输入、输出、资源选择和一个简单的测试计划。

规划 Data Operations

为 [project] 设计一个 DNAnexus 数据管理工作流。包括上传、元数据、folders、搜索和安全复制步骤。

构建多步骤 Workflow

为 [pipeline] 创建一个 DNAnexus workflow 计划。包括作业依赖、输出链接、监控和故障处理。

审查生产配置

审查我的 DNAnexus app 生产设计。检查 dxapp 设置、依赖项、权限、成本、日志记录和安全风险。

最佳实践

使用最小权限 DNAnexus 权限，并且仅在需要时请求广泛的网络访问权限。
在受保护数据上运行生成的命令之前，先验证命令、object IDs 和 project paths。
在扩展到完整队列或生产工作流之前，先使用小型代表性文件测试 applets。

避免

不要在生成的代码中硬编码 DNAnexus tokens、project secrets 或受保护样本标识符。
不要未经审查就将占位 project IDs、applet IDs 或文件名复制到生产环境。
当更窄的 app 访问设置已足够时，不要授予 all-project 或 developer 权限。

常见问题

此技能会自动连接到 DNAnexus 吗？

不会。它提供指南和示例，但用户必须自行运行经过身份验证的 DNAnexus 命令。

它能帮助编写 dxpy 脚本吗？

可以。它涵盖文件、records、projects、jobs、workflows 和错误处理的常见 dxpy 模式。

它适用于受保护的基因组数据吗？

它可以支持受保护数据工作流，但用户必须遵循其组织策略并审查生成的访问设置。

涵盖哪些 DNAnexus 领域？

它涵盖 app 开发、data operations、作业执行、dxpy 用法和 app 配置。

它能替代官方 DNAnexus 文档吗？

不会。它总结实用模式，并应根据官方文档检查当前平台细节。

它能估算云成本吗？

它可以建议注重成本的设置，但最终成本估算需要 DNAnexus 定价和特定工作负载测量。

开发者详情

作者

davila7

许可证

MIT

Skillstore 修订

版本提示

作者未声明版本。

仓库

https://github.com/davila7/claude-code-templates/tree/main/cli-tool/components/skills/scientific/dnanexus-integration

引用

c43861a65bb95efcae259cd161c9d6f4dc7eec6f

维护新鲜度

2026/7/24

使用量

5 次下载 · 556 次浏览

文件结构

📁 references/

📄 app-development.md

📄 configuration.md

📄 data-operations.md

📄 job-execution.md

📄 python-sdk.md

使用 Scanpy 分析单细胞 RNA-seq

由 K-Dense-AI

单细胞 RNA-seq 分析需要在 QC、归一化、聚类和绘图等环节做出许多相互关联的决策。此技能为 Claude、Codex 和 Claude Code 提供结构化的 Scanpy 工作流、参考指南和可复用的分析脚本。

数据与分析查看

dnanexus-integration

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已确认安全问题 (3)

风险因素

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BibTeX 引用

CITATION.cff

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你能构建什么

创建基因组学 Applet

组织 Project 数据

自动化 Workflow 运行

试试这些提示

最佳实践

避免

常见问题

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