uniprot-database
Поиск в базе данных белков UniProt
こちらからも入手できます: K-Dense-AI
Нужно найти белковые последовательности и аннотации из UniProt? Выполняйте запросы к белковым базам данных по названию, гену, акцессору или организму. Получайте последовательности, сопоставляйте идентификаторы и обращайтесь к функциональным аннотациям через REST API.
スキルZIPをダウンロード
Claudeでアップロード
設定 → 機能 → スキル → スキルをアップロードへ移動
オンにして利用開始
テストする
「uniprot-database」を使用しています。 Search for human hemoglobin proteins with reviewed status
期待される結果:
- Found 3 reviewed human hemoglobin proteins:
- • P68871 - HBB (Hemoglobin subunit beta) - Length: 147 aa
- • P69905 - HBA1 (Hemoglobin subunit alpha 1) - Length: 142 aa
- • P69902 - HBA2 (Hemoglobin subunit alpha 2) - Length: 142 aa
「uniprot-database」を使用しています。 Get FASTA sequence for human insulin
期待される結果:
- Retrieved sequence for P01308 (INS_HUMAN):
- >sp|P01308|INS_HUMAN Insulin precursor - Homo sapiens (Human)
- MALWMRLLPLLALLALWGPDPAAAFVNQHLCGSHLVEALYLVCGERGFFYTPKT...
セキュリティ監査
安全Legitimate bioinformatics tool providing read-only access to the authoritative UniProt protein database via HTTPS. All static analysis findings are false positives: markdown code fences were misidentified as shell commands, HTTPS URLs as weak crypto, and legitimate API calls as reconnaissance. The actual code contains no malicious patterns.
リスク要因
⚡ スクリプトを含む (1)
🌐 ネットワークアクセス (1)
品質スコア
作れるもの
Исследование функции белка
Найдите белковые последовательности, функциональные аннотации, термины GO и перекрёстные ссылки для проектов генного анализа.
Пакетное получение последовательностей
Загружайте большие наборы белковых данных в формате FASTA для филогенетики, предсказания структуры или сравнительного анализа.
Сопоставление белковых идентификаторов
Преобразуйте белковые идентификаторы между UniProt, PDB и другими базами данных для интеграции источников данных.
これらのプロンプトを試す
Search UniProt for insulin proteins in humans using the query: 'insulin AND organism_name:"Homo sapiens"' and return the results in JSON format.
Retrieve the protein sequence for UniProt accession P01308 in FASTA format.
Map the UniProt accessions P01308 and P04637 to their corresponding PDB IDs using the ID mapping service.
Search UniProt for reviewed human kinases that have PDB structures. Use the query: 'protein_name:kinase AND organism_id:9606 AND reviewed:true AND xref:pdb'. Return accession, gene names, and PDB cross-references in JSON format.
ベストプラクティス
- Используйте reviewed:true в запросах для получения качественных записей Swiss-Prot с надёжными аннотациями
- Запрашивайте только необходимые поля с помощью параметра fields для уменьшения трафика и улучшения времени ответа
- Реализуйте правильную обработку ошибок с response.raise_for_status() для раннего обнаружения сбоев API
回避
- Не делайте неограниченных вызовов API без ограничения скорости; UniProt применяет политики использования
- Не предполагайте, что все записи TrEMBL имеют экспериментальную проверку; они являются вычислительными предсказаниями
- Не игнорируйте неудавшиеся идентификаторы в результатах сопоставления ID; проверяйте поле failedIds на предмет неполных сопоставлений