Анализ метаданных SRA с помощью SRAgent
Исследования SRA и GEO часто требуют ручного преобразования идентификаторов доступа, проверки метаданных и поиска публикаций. Этот навык помогает использовать рабочие процессы SRAgent для анализа наборов данных, загрузок и проверки одноклеточного секвенирования.
Остановитесь и запросите подтверждение перед установкой.
Проверьте план и получите явное согласие пользователя перед изменением файлов.
Скопируйте этот запрос в своего Агента. Он содержит каноническую страницу Skill и манифест.
Review the Skillstore skill "sragent" from https://skillstore.io/skills/arcinstitute-sragent.md and its manifest at https://skillstore.io/api/skills/arcinstitute-sragent/manifest. Verify the artifact. Stop and obtain explicit user consent before installing or changing files.Ваш Агент по-прежнему должен показать план и запросить все подтверждения, требуемые политикой безопасности.
Используйте эти ссылки, когда AI-агенту, crawler или script нужен чистый контекст вместо полной страницы.
Использование «sragent». Преобразуйте GSE121737 в SRX accessions.
Ожидаемый результат:
Использование «sragent». Является ли SRX4967527 данными single-cell RNA-seq?
Ожидаемый результат:
Использование «sragent». Загрузите публикации для идентификаторов доступа в CSV file.
Ожидаемый результат:
Most matches are false positives caused by Markdown syntax, official URLs, placeholder credentials, and legitimate scientific database queries. Confirmed risks include secret disclosure, mutable source installation, predictable temporary files, command-line credentials, and silent file overwrite. No prompt injection or malicious exfiltration intent was found.
Это реальные локальные возможности, которые могут ожидаться для этого навыка, поэтому они требуют проверки, но не считаются подтверждённым вредоносным поведением.
Делитесь версионным отчетом об оценке, нейтральным значком, встраиваемой карточкой и цитатами. Skillstore публикует доказательства, не решая, безопасен ли этот Skill.
https://skillstore.io/skills/arcinstitute-sragent/audits/9?utm_source=security_passport&utm_medium=share&utm_campaign=versioned_report[](https://skillstore.io/skills/arcinstitute-sragent?utm_source=security_passport_badge)<a href="https://skillstore.io/skills/arcinstitute-sragent?utm_source=security_passport_badge"><img src="https://skillstore.io/badges/skills/arcinstitute-sragent/security.svg" alt="Skillstore security assessment" loading="lazy"></a><iframe src="https://skillstore.io/embed/skills/arcinstitute-sragent.html" title="Skillstore Security Assessment" sandbox="allow-popups allow-popups-to-escape-sandbox" loading="lazy" referrerpolicy="no-referrer" width="420" height="180"></iframe>ArcInstitute. (2026). sragent security audit report (audit version 9) [Author version unspecified]. Skillstore. https://skillstore.io/skills/arcinstitute-sragent/audits/9@techreport{arcinstitute-arcinstitute-sragent-2026,
author = {ArcInstitute},
title = {sragent security audit report (audit version 9)},
institution = {Skillstore},
year = {2026},
number = {9},
url = {https://skillstore.io/skills/arcinstitute-sragent/audits/9},
note = {Author version unspecified}
}cff-version: 1.2.0
message: "If you use this Skill, cite its author and this versioned security audit report."
title: "sragent security audit report (audit version 9)"
version: "unspecified"
type: report
authors:
- name: "ArcInstitute"
date-released: "2026-07-23"
url: "https://skillstore.io/skills/arcinstitute-sragent/audits/9"
identifiers:
- type: other
value: "skillstore:arcinstitute-sragent:audit:9"
description: "Skillstore immutable audit report identifier"
Преобразуйте идентификаторы GSE, SRP, PRJNA, SRX и SRR перед более глубоким анализом.
Проверьте организм, платформу, подготовку библиотеки и технологию одноклеточного секвенирования для экспериментов секвенирования.
Находите связанные публикации, извлекайте информацию DOI и загружайте доступные рукописи для списков идентификаторов доступа.
Преобразуйте GSE121737 в SRX accessions и объясните связь между идентификаторами.
Суммируйте SRX4967527 с указанием организма, платформы секвенирования, стратегии библиотеки и вероятного типа анализа.
Найдите публикации, связанные с PRJNA498286, и сообщите PubMed IDs, статус DOI и доступные загрузки рукописей.
Для всех SRX accessions из GSE196830 создайте таблицу метаданных с технологией, организмом, ссылками на публикации и статусом загрузки.
Автор
ArcInstituteЛицензия
MIT
Ревизия Skillstore
r2
Примечание о версии
Автор не указал версию.
Ссылка
89edfdc710d0846129dcee6a929477b04f08052c
Актуальность поддержки
24.07.2026
Использование
7 загрузок · 524 просмотров
Структура файлов
Запрос данных NCBI Gene
от davila7
Поиск генов часто требует повторных вызовов NCBI API и тщательной фильтрации по организмам. Этот навык предоставляет скрипты и рабочие процессы для поиска, получения и пакетной обработки аннотаций генов.
Анализ биоинформатических данных с помощью BioServices
от davila7
Биоинформатическая работа часто требует повторяющихся запросов к разрозненным публичным базам данных. Этот навык помогает Claude, Codex и Claude Code работать с процессами BioServices для белков, путей, соединений и идентификаторов.
Анализ данных DrugBank для исследований
от davila7
Исследования с DrugBank часто требуют аккуратного разбора XML, доступа к версионированным данным и структурированных фармакологических запросов. Этот навык предоставляет специализированные рекомендации и вспомогательные шаблоны для анализа DrugBank в Claude, Codex и Claude Code.
Запрос биоинформатических данных KEGG
от davila7
Биоинформатическая работа часто требует сопоставлений путей, генов, соединений и лекарственных препаратов из KEGG. Этот навык помогает Claude, Codex и Claude Code выполнять запросы к KEGG REST APIs и интерпретировать результаты.
Анализ взаимодействий белков с помощью STRING
от davila7
Исследование взаимодействий белков требует выполнения нескольких операций STRING API и тщательного выбора параметров. Этот навык сопоставляет идентификаторы, получает сети, выполняет анализ обогащения и создает изображения сетей.
Анализ путей Reactome
от davila7
Анализ путей требует точных endpoints Reactome и допустимых форматов данных. Этот навык помогает Claude, Codex и Claude Code выполнять запросы, обогащение и интерпретацию результатов.