zinc-database
Pesquisar compostos no banco de dados ZINC
Également disponible depuis: K-Dense-AI
Encontrar compostos comercializáveis para descoberta de medicamentos é demorado e requer conhecimento especializado em bancos de dados. Esta skill fornece documentação completa para acessar o banco de dados ZINC com mais de 230 milhões de compostos, permitindo triagem virtual eficiente, pesquisas de similaridade e downloads de estruturas 3D para estudos de encaixe molecular.
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Utilisation de "zinc-database". Encontre 10 compostos líderes aleatórios do ZINC
Résultat attendu:
- Recuperou 10 compostos semelhantes a líderes do ZINC22
- Faixa de peso molecular: 250-350 Da, LogP 3,5 ou inferior
- Resultados incluem IDs ZINC e strings SMILES
- Cada composto inclui código de tranche para filtragem de propriedades
- Catálogos de fornecedores listados para informações de compra
Utilisation de "zinc-database". Pesquise compostos semelhantes ao ibuprofeno
Résultat attendu:
- Encontrou 50 compostos semelhantes ao SMILES do ibuprofeno
- Limiar de distância de Tanimoto definido como 3
- Resultados classificados por similaridade com IDs ZINC e estruturas
- Disponibilidade de fornecedores mostrada para cada composto
- Códigos de tranche permitem filtragem adicional de propriedades
Audit de sécurité
SûrDocumentation-only skill providing access instructions for the ZINC database. All 364 static findings are false positives. The scanner misidentified scientific terminology (curl commands, tranche codes, database formats) as security threats. This is legitimate educational content about a public academic database maintained by UCSF.
Facteurs de risque
⚡ Contient des scripts (2)
🌐 Accès réseau (2)
Score de qualité
Ce que vous pouvez construire
Preparar bibliotecas de encaixe
Baixar compostos semelhantes a fármacos em massa para campanhas de triagem virtual com software de encaixe molecular.
Encontrar análogos comercializáveis
Pesquisar análogos comercialmente disponíveis de compostos conhecidos para acelerar a otimização de líderes.
Explorar espaço químico
Amostrar bibliotecas químicas diversas para identificar novos compostos líderes para alvos terapêuticos.
Essayez ces prompts
Encontre informações sobre o composto ZINC000000000001 no banco de dados ZINC. Inclua SMILES, informações de fornecedores e propriedades moleculares.
Pesquise no ZINC compostos semelhantes à aspirina (SMILES: CC(=O)OC1=CC=CC=C1C(=O)O) com distância de Tanimoto de 3. Retorne os primeiros 20 resultados com IDs ZINC e SMILES.
Gere uma lista de 5000 compostos semelhantes a fármacos do ZINC22. Filtre para MW entre 350-500, LogP inferior a 5 e 0 doadores de ligação H. Inclua IDs ZINC e códigos de tranche.
Encontre análogos comercializáveis de um composto líder com SMILES CCN(CC)CCNC(=O)C1=CC=C(C=C1)N(CC)CC. Use pesquisa de similaridade com distância 4. Retorne IDs ZINC, SMILES e catálogos de fornecedores.
Bonnes pratiques
- Comece com pesquisas SMILES exatas antes de expandir para pesquisas de similaridade para resultados mais precisos
- Use filtragem por tranches (contagem de H, LogP, MW) para reduzir o espaço de pesquisa antes da análise detalhada
- Armazene em cache compostos acessados frequentemente localmente para minimizar chamadas de API e respeitar limites de taxa
Éviter
- Fazer solicitações rápidas consecutivas sem atrasos - isso pode acionar limitação de taxa
- Solicitar todos os campos de saída quando apenas dados específicos são necessários - aumenta o tamanho da resposta
- Usar pesquisas de similaridade muito amplas sem filtros de propriedade - retorna resultados excessivos