brenda-database
BRENDA 데이터베이스에서 효소 데이터 조회
또한 다음에서 사용할 수 있습니다: davila7
세계 최대의 효소 데이터베이스에서 포괄적인 효소 동력학 데이터에 접근하세요. Km 값, 반응 방정식, 유기체별 매개변수 및 기질 특이성 데이터를 생화학 연구와 대사 공학을 위해 찾아보세요.
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"brenda-database" 사용 중입니다. Get Km values for alcohol dehydrogenase (EC 1.1.1.1) for human and yeast
예상 결과:
- Alcohol Dehydrogenase (EC 1.1.1.1) Kinetic Data:
- Homo sapiens:
- - Average Km: 0.34 mM (ethanol)
- - Optimal pH: 8.0-9.0
- - Temperature: 25C (data points: 15)
- Saccharomyces cerevisiae:
- - Average Km: 1.2 mM (ethanol)
- - Optimal pH: 7.0-8.0
- - Temperature: 30C (data points: 8)
- Cofactors: NAD+ required for both organisms
보안 감사
낮은 위험The brenda-database skill is a legitimate scientific tool for accessing enzyme data from the BRENDA database. All 436 static findings are false positives triggered by documentation formatting (backtick characters for code blocks), legitimate BRENDA API authentication (SHA-256 password hashing), and biochemical terminology (NAD+, ATP as cofactors, not C2 commands). The codebase performs authorized SOAP API queries to a public scientific database and exports research data. No malicious behavior, data exfiltration, or unauthorized access patterns were found.
위험 요인
🌐 네트워크 접근 (1)
📁 파일 시스템 액세스 (1)
⚡ 스크립트 포함 (1)
품질 점수
만들 수 있는 것
효소 동력학 분석
효소 동작을 특성화하고 유기체 간 비교를 위해 Km 및 kcat 값을 조회합니다.
경로 설계
특정 반응에 대한 효소를 찾고 대사 경로 구성을 위한 조건을 최적화합니다.
문헌 데이터 추출
계산 모델링 및 분석을 위해 게시된 BRENDA 데이터에서 효소 매개변수를 추출합니다.
이 프롬프트를 사용해 보세요
BRENDA에서 알코올 탈수소효소(EC 1.1.1.1)의 Km 값을 가져오세요.
EC 1.1.1.1의 Km 값을 Escherichia coli와 Homo sapiens에서 찾아보세요.
포도당을 포함하는 모든 반응과 해당 효소 EC 번호를 찾아보세요.
피루브산에서 젖산산을 생산하기 위한 효소 경로와 필요한 모든 보조 인자를 찾아보세요.
모범 사례
- 보안을 위해 환경 변수에 BRENDA 인증 정보 저장
- API 호출 사이에 속도 제한을 피하기 위해 지연 시간(0.5-1초) 추가
- 데이터 양을 줄이고 응답 시간을 개선하기 위해 특정 EC 번호 및 유기체 필터 사용
피하기
- 동시에 API 요청을 지연 없이 보내면 속도 제한 발생
- 결과를 제한하지 않고 와일드카드를 사용하여 광범위 검색 시 방대한 데이터셋 반환
- 반복 쿼리에 결과를 캐시하지 않으면 API 할당량을浪费하고 성능 저하
자주 묻는 질문
BRENDA 계정이 필요합니까?
EC 번호란 무엇입니까?
Km은 무엇을 의미합니까?
몇 번의 요청을 할 수 있습니까?
어떤 데이터 형식이 지원됩니까?
유기체로 검색할 수 있습니까?
개발자 세부 정보
작성자
K-Dense-AI라이선스
MIT
리포지토리
https://github.com/K-Dense-AI/claude-scientific-skills/tree/main/scientific-skills/brenda-database참조
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