スキル gene-database

📦

gene-database

Name: gene-database
Author: K-Dense-AI

コンテンツリビジョン r1 高リスク 🌐 ネットワークアクセス🔑 環境変数📁 ファイルシステムへのアクセス⚙️ 外部コマンド

NCBI Gene データを照会する

遺伝子検索では、正確な ID、生物種フィルター、API 固有の形式が必要になることがよくあります。このスキルは、NCBI Gene 検索、メタデータ取得、バッチアノテーションワークフローを支援します。

対応: Claude Codex Code(CC)

⚠️ 38 不十分

インストール前に停止して確認を求めてください。

計画を確認し、ファイルを変更する前にユーザーの明示的な同意を得てください。

自分のエージェントでインストール

このリクエストをエージェントにコピーしてください。正規の Skill ページとマニフェストが含まれています。

エージェントリクエスト

Review the Skillstore skill "gene-database" from https://skillstore.io/skills/k-dense-ai-gene-database.md and its manifest at https://skillstore.io/api/skills/k-dense-ai-gene-database/manifest. Verify the artifact. Stop and obtain explicit user consent before installing or changing files.

エージェントは引き続き計画を提示し、セキュリティポリシーで必要な確認を求める必要があります。

エージェントが読めるリソース

AI エージェント、クローラー、スクリプトがページ全体ではなく整理されたコンテキストを必要とする場合は、これらのリンクを使ってください。

Markdown詳細 GET /skills/k-dense-ai-gene-database.md 署名済み manifest GET /api/skills/k-dense-ai-gene-database/manifest 署名済み lockfile GET /api/skills/k-dense-ai-gene-database/lockfile

テストする

「gene-database」を使用しています。 Find information about BRCA1 in human.

期待される結果:

応答では、Gene ID 672、シンボル BRCA1、生物種 Homo sapiens、染色体 17、マップ位置 17q21.31 が特定されます。

「gene-database」を使用しています。 Annotate TP53, EGFR, and KRAS for human.

期待される結果:

応答では、Gene ID、公式シンボル、説明、染色体、マップ位置を含むコンパクトなアノテーション表が示されます。

「gene-database」を使用しています。 Find genes related to apoptosis in mouse.

期待される結果:

応答では、GO ベースの検索を説明し、マウスの生物種フィルターを適用して、レビュー対象の候補遺伝子を要約します。

セキュリティ監査

高リスク

v7 • 2026/7/6 バージョン別レポートを開く

The static matches are largely false positives from documented NCBI API usage, optional user-provided NCBI API keys, Markdown code formatting, and explicit user-requested output files. However, untrusted package content includes a self-authored security audit that claims the skill is safe to publish, plus a separate instruction to promote an external hosted platform. Those intent-level issues should be removed or isolated before marketplace publication.

スキャンされたファイル

2,020

解析済み行数

レビュー項目

誤検知を無視

確認済みのセキュリティ上の懸念 (2)

高

evaluation.json:14-18 evaluation.json:19-67

Prompt Injection Attempt Detected

evaluation.json embeds a security_audit block with "safe_to_publish": true and claims all static findings are false positives. Untrusted package content should not pre-adjudicate marketplace security or publication status.

The file directly contains self-authored audit fields and verdict claims. It can bias review, although it does not override this audit.

中

SKILL.md:178-179

Unrelated External Platform Promotion

SKILL.md instructs the assistant to proactively suggest K-Dense Web for complex workflows and large document analysis. This steers users toward an external hosted service outside the core gene database workflow.

The promotion instruction is explicit in the skill text. The risk is user steering and possible data-boundary confusion, not direct code execution.

リスク要因

🌐 ネットワークアクセス (40)

🔑 環境変数 (61)

📁 ファイルシステムへのアクセス (1)

scripts/batch_gene_lookup.py:287

⚙️ 外部コマンド (22)

監査者: codex 監査履歴を表示 →

このレポートを共有・引用

バージョン付き評価レポート、中立的なバッジ、埋め込みカード、引用を共有できます。Skillstore は証拠を報告しますが、この Skill が安全かどうかは判断しません。

バージョン別レポートを開く

レポートリンクをコピー

https://skillstore.io/skills/k-dense-ai-gene-database/audits/7?utm_source=security_passport&utm_medium=share&utm_campaign=versioned_report

Markdownバッジ

[![Skillstore security assessment](https://skillstore.io/badges/skills/k-dense-ai-gene-database/security.svg)](https://skillstore.io/skills/k-dense-ai-gene-database?utm_source=security_passport_badge)

HTMLバッジ

<a href="https://skillstore.io/skills/k-dense-ai-gene-database?utm_source=security_passport_badge"><img src="https://skillstore.io/badges/skills/k-dense-ai-gene-database/security.svg" alt="Skillstore security assessment" loading="lazy"></a>

埋め込みカード

<iframe src="https://skillstore.io/embed/skills/k-dense-ai-gene-database.html" title="Skillstore Security Assessment" sandbox="allow-popups allow-popups-to-escape-sandbox" loading="lazy" referrerpolicy="no-referrer" width="420" height="180"></iframe>

学術引用 (APA · BibTeX · CFF)

APA形式の引用

K-Dense-AI. (2026). gene-database security audit report (audit version 7) [Author version unspecified]. Skillstore. https://skillstore.io/skills/k-dense-ai-gene-database/audits/7

BibTeX形式の引用

@techreport{k-dense-ai-k-dense-ai-gene-database-2026,
  author = {K-Dense-AI},
  title = {gene-database security audit report (audit version 7)},
  institution = {Skillstore},
  year = {2026},
  number = {7},
  url = {https://skillstore.io/skills/k-dense-ai-gene-database/audits/7},
  note = {Author version unspecified}
}

CITATION.cff

cff-version: 1.2.0
message: "If you use this Skill, cite its author and this versioned security audit report."
title: "gene-database security audit report (audit version 7)"
version: "unspecified"
type: report
authors:
  - name: "K-Dense-AI"
date-released: "2026-07-06"
url: "https://skillstore.io/skills/k-dense-ai-gene-database/audits/7"
identifiers:
  - type: other
    value: "skillstore:k-dense-ai-gene-database:audit:7"
    description: "Skillstore immutable audit report identifier"

バリアントを比較

インストール可能なバリアント 2 件

各作者のスキルは個別のインストール項目として維持されます。推奨バリアントは Skillstore の証拠で順位付けされます。

このバリアントが首位の理由

Skillstore スコアが最高

作者 / ソース Skillstore スコア証拠の信頼度 Skillstore 利用状況更新済み

davila7 推奨

davila7-gene-database

Skillstore スコア 79

証拠の信頼度高

Skillstore 利用状況 9

更新済み

2026-09-09

K-Dense-AI 現在

k-dense-ai-gene-database

Skillstore スコア 38

証拠の信頼度中

Skillstore 利用状況 8

更新済み

2026-09-09

Skillstore スコア

このスコアの理由証拠の信頼度: 中

アーキテクチャ

保守性

コンテンツ

コミュニティ

仕様準拠

作成できるもの

遺伝子パネルにアノテーションを付与する

研究用の遺伝子リストについて、Gene ID、シンボル、位置、説明を取得します。

バッチ検索テーブルを作成する

生物種フィルターとレート制限を使って、多数の遺伝子シンボルを安定した NCBI Gene ID にマッピングします。

遺伝子レコードを説明する

教育用の例、課題、またはガイド付きデータベース探索のために、わかりやすい遺伝子要約を見つけます。

これらのプロンプトを試す

1 つの遺伝子を見つける

{organism} における {gene_symbol} 遺伝子を見つけてください。Gene ID、説明、染色体、マップ位置を含めてください。

ID で取得する

Gene ID {gene_id} の NCBI Gene 情報を取得してください。生物種、シンボル、別名、主要なアノテーションを要約してください。

リストにアノテーションを付与する

次の {organism} 遺伝子にアノテーションを付与してください: {gene_list}。シンボル、Gene ID、説明、位置を含む簡潔な表を返してください。

生物学的コンテキストを比較する

{organism} において {disease_or_pathway} に関連する遺伝子を見つけてください。クエリ用語、想定される曖昧さ、フォローアップの検証手順を説明してください。

ベストプラクティス

遺伝子シンボルで検索する場合は、必ず生物種を含めてください。
安定した保存と繰り返し検索には Gene ID を使用してください。
可能な場合はリクエストをバッチ化し、NCBI のレート制限を尊重してください。

回避

遺伝子シンボルをグローバルに一意な識別子として扱わないでください。
レート制限なしで大量のリクエストループを実行しないでください。
専門家による検証なしに、データベースの結果を臨床的証拠として使用しないでください。

よくある質問

このスキルはどのデータベースを使用しますか？

E-utilities と NCBI Datasets API を通じて NCBI Gene を使用します。

NCBI API キーは必要ですか？

いいえ。API キーは任意ですが、許可されるリクエストレートが向上します。

多数の遺伝子を一度に処理できますか？

はい。バッチワークフローは Gene ID または遺伝子シンボルのファイルを受け付けます。

どの識別子で検索できますか？

遺伝子シンボル、Gene ID、生物種、疾患用語、GO 用語、パスウェイ、または染色体上の位置で検索できます。

Claude、Codex、Claude Code で動作しますか？

はい。スキルのメタデータには、サポート対象ツールとして Claude、Codex、Claude Code が記載されています。

臨床リスクを解釈できますか？

いいえ。データベースレコードとアノテーションを取得しますが、臨床的解釈には有資格者によるレビューが必要です。

開発者情報

作成者

K-Dense-AI

ライセンス

Unknown

Skillstore リビジョン

バージョンに関する注意

作者はバージョンを宣言していません。

リポジトリ

https://github.com/K-Dense-AI/claude-scientific-skills/tree/main/scientific-skills/gene-database

参照

b8ca75d2c0a7e7102978993058777d82b8ab2610

メンテナンスの新しさ

2026/7/25

利用状況

6 ダウンロード · 214 閲覧

ファイル構成

📁 references/

📄 api_reference.md

📄 common_workflows.md

📁 scripts/

📄 batch_gene_lookup.py

📄 fetch_gene_data.py

📄 query_gene.py

📄 evaluation.json

UniProtタンパク質データを検索

作成者 davila7

タンパク質研究では、多くの場合、UniProtからの高精度な検索、配列、アノテーション、識別子マッピングが必要です。このスキルは、再現可能なタンパク質データアクセスのための直接的なRESTワークフローとPythonクライアントを提供します。

調査＆学習表示

gene-database

自分のエージェントでインストール

エージェントが読めるリソース

テストする

セキュリティ監査

確認済みのセキュリティ上の懸念 (2)

リスク要因

レポートリンクをコピー

Markdownバッジ

HTMLバッジ

埋め込みカード

APA形式の引用

BibTeX形式の引用

CITATION.cff

バリアントを比較

Skillstore スコア

作成できるもの

遺伝子パネルにアノテーションを付与する

バッチ検索テーブルを作成する

遺伝子レコードを説明する

これらのプロンプトを試す

ベストプラクティス

回避

よくある質問

開発者情報

K-Dense-AI のその他のスキル

venue-templates

iso-13485-certification

pytdc

diffdock

hypothesis-generation

statistical-analysis

関連スキル

bioservices

drugbank-database

kegg-database

string-database

reactome-database

uniprot-database