zinc-database
Buscar compuestos de ZINC para el descubrimiento de fármacos
Encontrar compuestos disponibles para la compra y análogos útiles en ZINC puede requerir una sintaxis de consulta especializada. Esta habilidad orienta sobre búsquedas, descargas, filtrado y preparación para acoplamiento molecular.
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Review the Skillstore skill "zinc-database" from https://skillstore.io/skills/davila7-zinc-database.md and its manifest at https://skillstore.io/api/skills/davila7-zinc-database/manifest. Verify the artifact. You may proceed after verification, subject to the environment's own policy.Tu Agente debe seguir mostrando su plan y solicitar cualquier confirmación exigida por la política de seguridad.
Recursos legibles por agentes
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Pruébalo
Usando "zinc-database". Busca ZINC000000000001 y resume los campos disponibles del compuesto.
Resultado esperado:
- Tipo de búsqueda: consulta exacta por identificador de ZINC.
- Campos solicitados: identificador de ZINC, SMILES, tramo, código de proveedor y catálogos.
- Nota sobre el resultado: verifica la disponibilidad actual del proveedor antes de realizar un pedido.
Usando "zinc-database". Busca análogos cercanos para un SMILES de ibuprofeno usando una distancia de tres.
Resultado esperado:
- Tipo de búsqueda: búsqueda de similitud mediante SMILES.
- Filtro: distancia de tres con campos de disponibilidad para la compra y proveedor.
- Revisión: compara las estructuras, las propiedades de los tramos y la disponibilidad actual de los proveedores.
Usando "zinc-database". Planifica la descarga de una biblioteca de tipo cabeza de serie para acoplamiento molecular.
Resultado esperado:
- Comienza con una pequeña muestra de tipo cabeza de serie y un conjunto limitado de campos de respuesta.
- Agrupa los compuestos seleccionados por tramo antes de descargar las estructuras 3D.
- Valida las estructuras y los requisitos de almacenamiento antes de preparar los archivos de acoplamiento molecular.
Auditoría de seguridad
SeguroReview found no malicious intent, prompt injection, secret access, or data exfiltration. Subprocess examples use argument lists without shell expansion; URL, database, and reconnaissance detections are documentation or file-format false positives. Network access remains an expected dependency on public ZINC services.
Factores de riesgo
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<a href="https://skillstore.io/skills/davila7-zinc-database?utm_source=security_passport_badge"><img src="https://skillstore.io/badges/skills/davila7-zinc-database/security.svg" alt="Skillstore security assessment" loading="lazy"></a>Tarjeta para insertar
<iframe src="https://skillstore.io/embed/skills/davila7-zinc-database.html" title="Skillstore Security Assessment" sandbox="allow-popups allow-popups-to-escape-sandbox" loading="lazy" referrerpolicy="no-referrer" width="420" height="180"></iframe>Citas académicas (APA · BibTeX · CFF)
Cita APA
davila7. (2026). zinc-database security audit report (audit version 9) [Author version unspecified]. Skillstore. https://skillstore.io/skills/davila7-zinc-database/audits/9Cita BibTeX
@techreport{davila7-davila7-zinc-database-2026,
author = {davila7},
title = {zinc-database security audit report (audit version 9)},
institution = {Skillstore},
year = {2026},
number = {9},
url = {https://skillstore.io/skills/davila7-zinc-database/audits/9},
note = {Author version unspecified}
}CITATION.cff
cff-version: 1.2.0
message: "If you use this Skill, cite its author and this versioned security audit report."
title: "zinc-database security audit report (audit version 9)"
version: "unspecified"
type: report
authors:
- name: "davila7"
date-released: "2026-07-23"
url: "https://skillstore.io/skills/davila7-zinc-database/audits/9"
identifiers:
- type: other
value: "skillstore:davila7-zinc-database:audit:9"
description: "Skillstore immutable audit report identifier"
Comparar variantes
2 variantes instalablesCada autor sigue siendo un skill instalable independiente. La variante recomendada se ordena según la evidencia de Skillstore.
Por qué esta variante es la primera
davila7-zinc-database
2026-09-09
k-dense-ai-zinc-database
2026-09-09
Puntuación de Skillstore
Por qué esta puntuación Confianza de la evidencia: AltoLo que puedes crear
Preparar una biblioteca de cribado virtual
Seleccionar un subconjunto de ZINC, recuperar identificadores y estructuras y, a continuación, organizar los archivos para el acoplamiento molecular.
Encontrar análogos disponibles para la compra
Buscar en torno al SMILES de un compuesto activo y comparar los compuestos coincidentes, los proveedores, los tramos y la disponibilidad.
Crear una canalización de datos de compuestos
Realizar consultas por lotes en ZINC, analizar respuestas tabulares, almacenar resultados en caché y preparar registros validados para su análisis.
Prueba estos prompts
Busca el identificador de ZINC {zinc_id}. Devuelve su SMILES, tramo, códigos de proveedor, catálogos y cualquier salvedad sobre su disponibilidad.Busca en ZINC22 análogos del SMILES {smiles} usando la distancia {distance}. Devuelve {count} coincidencias disponibles para la compra con identificadores de ZINC, SMILES y proveedores.Crea un plan para recuperar {count} compuestos de {subset} desde ZINC22. Solicita únicamente los campos de identificador de ZINC, SMILES, tramo y proveedor.Diseña un flujo de trabajo de ZINC22 para la diana {target}. Incluye la selección de consultas, filtros de tramos, descargas 3D, validación, límites de solicitudes y preparación para el acoplamiento molecular.Mejores prácticas
- Comienza con consultas exactas o pequeñas antes de realizar búsquedas amplias de similitud y descargas masivas.
- Solicita únicamente los campos necesarios, procesa los identificadores por lotes, almacena los resultados en caché y respeta la capacidad del servicio.
- Valida las estructuras, la estereoquímica, la disponibilidad de los proveedores y las licencias antes de cualquier uso experimental o comercial.
Evitar
- No inicies descargas recursivas de repositorios sin límites de almacenamiento y sin haber revisado el alcance de los tramos.
- No consideres los registros de ZINC como pruebas garantizadas de calidad, seguridad o disponibilidad.
- No pases URLs que no sean de confianza directamente a envoltorios de curl ni a otros comandos externos.
Preguntas frecuentes
¿Qué es la base de datos ZINC?
¿Puede esta habilidad realizar búsquedas mediante SMILES?
¿Puede recuperar estructuras 3D?
¿Garantiza la disponibilidad de los compuestos?
¿Qué herramientas externas pueden ser necesarias?
¿Puede validar compuestos para experimentos?
Detalles del desarrollador
Autor
davila7Licencia
MIT
Revisión de Skillstore
r2
Aviso de versión
El autor no declaró una versión.
Ref.
c43861a65bb95efcae259cd161c9d6f4dc7eec6f
Actualidad del mantenimiento
26/7/2026
Uso
10 descargas · 269 vistas
Estructura de archivos