Ejecutar análisis de biogeografía con BioGeoBEARS
Los flujos de trabajo de biogeografía filogenética pueden ser difíciles de formatear y reproducir. Esta skill valida las entradas, prepara scripts de BioGeoBEARS y guía la comparación de modelos en R.
Copia esta solicitud en tu Agente. Incluye la página canónica del Skill y el manifiesto.
Review the Skillstore skill "biogeobears" from https://skillstore.io/skills/brunoasm-biogeobears.md and its manifest at https://skillstore.io/api/skills/brunoasm-biogeobears/manifest. Verify the artifact. You may proceed after verification, subject to the environment's own policy.Tu Agente debe seguir mostrando su plan y solicitar cualquier confirmación exigida por la política de seguridad.
Usa estos enlaces cuando un agente de IA, crawler o script necesite contexto limpio en vez de leer la página completa.
Usando "biogeobears". Un investigador proporciona un árbol enraizado y una tabla de distribución de especies por región.
Resultado esperado:
Usando "biogeobears". Un usuario pregunta qué modelo explica mejor las distribuciones de aves insulares.
Resultado esperado:
All 110 static findings were adjudicated as false positives. Most detections are Markdown or RMarkdown backticks and intentional relative paths within the generated analysis directory. The explicit file write uses a user-selected output path, with no hidden network access, reconnaissance, or untrusted command evaluation.
Comparte el informe de evaluación versionado, la insignia neutral, la tarjeta insertable y las citas. Skillstore presenta evidencias sin decidir si este Skill es seguro.
https://skillstore.io/skills/brunoasm-biogeobears/audits/8?utm_source=security_passport&utm_medium=share&utm_campaign=versioned_report[](https://skillstore.io/skills/brunoasm-biogeobears?utm_source=security_passport_badge)<a href="https://skillstore.io/skills/brunoasm-biogeobears?utm_source=security_passport_badge"><img src="https://skillstore.io/badges/skills/brunoasm-biogeobears/security.svg" alt="Skillstore security assessment" loading="lazy"></a><iframe src="https://skillstore.io/embed/skills/brunoasm-biogeobears.html" title="Skillstore Security Assessment" sandbox="allow-popups allow-popups-to-escape-sandbox" loading="lazy" referrerpolicy="no-referrer" width="420" height="180"></iframe>brunoasm. (2026). biogeobears security audit report (audit version 8) [Author version unspecified]. Skillstore. https://skillstore.io/skills/brunoasm-biogeobears/audits/8@techreport{brunoasm-brunoasm-biogeobears-2026,
author = {brunoasm},
title = {biogeobears security audit report (audit version 8)},
institution = {Skillstore},
year = {2026},
number = {8},
url = {https://skillstore.io/skills/brunoasm-biogeobears/audits/8},
note = {Author version unspecified}
}cff-version: 1.2.0
message: "If you use this Skill, cite its author and this versioned security audit report."
title: "biogeobears security audit report (audit version 8)"
version: "unspecified"
type: report
authors:
- name: "brunoasm"
date-released: "2026-07-23"
url: "https://skillstore.io/skills/brunoasm-biogeobears/audits/8"
identifiers:
- type: other
value: "skillstore:brunoasm-biogeobears:audit:8"
description: "Skillstore immutable audit report identifier"
Configura entradas validadas, scripts y documentación para un análisis de biogeografía filogenética.
Crea una estructura de carpetas clara y pasos de análisis guiados para estudiantes que aprenden biogeografía histórica.
Encuentra discrepancias entre el árbol y la geografía antes de ejecutar trabajos largos de optimización de BioGeoBEARS.
Ayúdame a preparar un análisis de BioGeoBEARS. Mi archivo de árbol es [tree path], mi archivo de distribución es [data path] y tengo [number] áreas.
Valida mi archivo de geografía contra este árbol filogenético. Reformátalo para BioGeoBEARS si es necesario y explica cualquier discrepancia de especies.
Recomienda modelos de BioGeoBEARS y el tamaño máximo de rango para [taxon group] en [area list]. Explica las compensaciones antes de generar scripts.
Crea un flujo de trabajo reproducible de BioGeoBEARS con validación, comparación de modelos, gráficos de rangos ancestrales, notas README y orientación de interpretación para publicación.
Autor
brunoasmLicencia
MIT
Revisión de Skillstore
r2
Aviso de versión
El autor no declaró una versión.
Ref.
a39a91716eadede5f4cdefd78178fed4e837a128
Actualidad del mantenimiento
25/7/2026
Uso
18 descargas · 271 vistas
Estructura de archivos
Piensa profundamente antes de responder
El acuerdo rápido puede ocultar suposiciones débiles y falta de contexto. Esta skill guía a Claude, Codex y Claude Code mediante un análisis estructurado antes de recomendar un camino.
Generar flujos de trabajo de filogenómica con BUSCO
La filogenómica a partir de ensamblajes genómicos requiere muchas herramientas, scripts de planificador y controles de calidad. Esta habilidad guía la extracción de ortólogos con BUSCO o compleasm, el alineamiento, el recorte, la inferencia de árboles y la redacción de métodos.
Extraer datos estructurados de PDFs
Las colecciones de PDFs científicos son difíciles de convertir en conjuntos de datos listos para el análisis. Esta skill guía flujos de trabajo de organización de metadatos, extracción basada en esquemas, validación y exportación.
Analizar árboles filogenéticos con ETE
por davila7
El análisis filogenético suele requerir herramientas especializadas para analizar árboles, consultar taxonomías y generar figuras. Esta skill guía a Claude, Codex y Claude Code a través de flujos de trabajo de ETE para el análisis y la visualización.
Analiza datos biológicos con scikit-bio
por davila7
El trabajo en bioinformática a menudo requiere flujos de trabajo correctos para secuencias, árboles, diversidad y ordenación. Esta skill guía a Claude, Codex y Claude Code a través de las APIs de scikit-bio.
Research Supply-Chain Investment Bottlenecks
por muxuuu
Broad investment themes often hide the scarce components that control growth. This skill maps value chains, grades evidence, and ranks research priorities with clear risks.
Preparar Envíos a Revistas y Conferencias Académicas
por K-Dense-AI
Los envíos académicos suelen fallar porque las reglas de formato varían según la revista o conferencia. Esta skill proporciona plantillas, requisitos y ejemplos para una preparación más rápida.
Crear figuras listas para revistas Nature
por Yuan1z0825
Los investigadores necesitan figuras que comuniquen la evidencia con claridad y cumplan las reglas de exportación de las revistas. Esta skill convierte conjuntos de datos, borradores e ideas de figuras en flujos de trabajo estructurados en Python o R para visualizaciones listas para enviar.
Ejecuta flujos de trabajo de acoplamiento molecular con DiffDock
por davila7
La configuración del acoplamiento molecular suele fallar porque es difícil alinear las entradas, los parámetros y las puntuaciones de confianza. Esta skill guía los flujos de trabajo de DiffDock desde la preparación hasta la revisión de resultados.