254 Skills
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hypogenic

Sicher 70

使用AI生成科学假设

von davila7

手动假设生成速度慢,且受限于人类创造力。Hypogenic使用LLM自动执行系统化假设生成和测试,将数据驱动的模式与文献洞察相结合,加速科学发现。

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hmdb-database

Sicher 68

搜索人类代谢组数据库获取代谢物数据

von davila7

研究人员需要快速获取代谢物信息以进行代谢组学研究。此技能提供搜索人类代谢组数据库的指导,帮助查找化学性质、生物标志物和光谱数据,用于代谢物鉴定和研究。

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histolab

Sicher 71

处理全幅病理切片图像

von davila7

数字病理学工作流程需要处理千兆像素级的全幅切片图像以进行计算分析。此技能为组织病理学研究中的切片提取、组织区域检测和深度学习管道数据集准备提供全面指导。

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gwas-database

Sicher 69

查询GWAS目录获取遗传关联

von davila7

查找疾病的遗传关联需要导航复杂的基因组数据库。本技能提供清晰的指导,查询NHGRI-EBI GWAS目录以检索SNP-性状关联、p值和汇总统计数据用于研究。

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gtars

Sicher 71

分析基因组区间和覆盖度轨迹

von davila7

基因组区间分析需要专门的工具来处理 BED 文件、检测重叠区域和生成覆盖度轨迹。Gtars 提供高性能的 Rust 实现和 Python 绑定,适用于计算基因组学和机器学习工作流程。

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gget

Sicher 75

查询基因组数据库和分析序列

von davila7

需要快速获取基因信息、蛋白质结构或表达数据?此技能通过单一界面提供对20多个生物信息学数据库的统一访问。搜索基因、检索序列、预测结构并分析疾病关联,无需切换工具。

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geo-database

Sicher 68

从 NCBI GEO 搜索和下载基因表达数据

von davila7

查找和处理基因表达数据集需要浏览复杂的数据库结构和文件格式。此技能提供即用型代码模式,用于搜索、下载和分析 GEO 微阵列和 RNA-seq 数据。

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geniml

Sicher 71

使用机器学习分析基因组区域

von davila7

处理用于机器学习任务的基因组区间数据需要专门的工具。Geniml 提供了无监督方法来学习基因组区域、单细胞和元数据标签的嵌入表示,用于相似性搜索、聚类和下游分析。

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gene-database

Niedriges Risiko 73

查询 NCBI 基因数据库

von davila7

搜索和检索 NCBI 基因数据库中的基因信息。获取基因符号、RefSeq 序列、GO 注释、染色体位置和表型关联,用于研究和分析。

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esm

Sicher 71

使用 ESM 生成和设计蛋白质

von davila7

蛋白质工程需要专门的 AI 模型来分析序列-结构-功能关系。ESM 提供最先进的蛋白质语言模型,用于生成新序列、预测结构以及通过多模态 AI 设计功能蛋白质。

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ensembl-database

Sicher 75

查询 Ensembl 基因组数据库(覆盖 250+ 物种)

von davila7

基因组研究人员需要跨物种访问基因序列、变体和比较数据。该技能通过查询 Ensembl 数据库 REST API 来检索超过 250 种脊椎动物的基因信息、DNA 序列、变体预测、直系同源基因以及调控特征。

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ena-database

Sicher 70

搜索 ENA 核苷酸档案库

von davila7

查找和下载核苷酸序列需要理解复杂的 API 语法和多种端点模式。本技能为查询欧洲核苷酸档案库提供全面的文档,以便通过登录号检索 DNA/RNA 序列、基因组组装和原始测序读段。

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denario

Sicher 73

自动化科学研究工作流程

von davila7

Denario 自动化从数据分析到发表的完整研究流程。它使用 AI 代理生成假设、制定方法论、执行实验并生成期刊格式的论文。

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cosmic-database

Sicher 75

从COSMIC数据库下载癌症突变数据

von davila7

癌症研究人员需要以编程方式访问世界上最大的体细胞突变数据库。此技能支持经过身份验证的COSMIC癌症基因组学数据下载,包括突变、基因注释和临床变异,用于研究和精准肿瘤学。

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clinicaltrials-database

Niedriges Risiko 72

搜索 ClinicalTrials.gov 研究项目

von davila7

为患者、研究或药物开发寻找临床试验需要导航复杂的注册表。此技能提供了一个 Python 接口来查询官方 ClinicalTrials.gov 数据库。按病症、药物、地点或赞助商搜索招募中的试验,检索详细的研究信息,并导出数据以供分析。

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citation-management

Sicher 80

使用 BibTeX 管理学术引用

von davila7

手动管理引用既耗时又容易出错。此技能可自动搜索学术数据库、从 DOI 和 PMID 中提取元数据、验证引用并生成可直接发表的 BibTeX 条目。

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chembl-database

Niedriges Risiko 73

查询 ChEMBL 生物活性分子数据库

von davila7

查找药物发现数据需要搜索多个数据库并理解复杂的 API 查询。此技能提供了即用型函数,用于查询 ChEMBL 数据库中超过 200 万个生物活性化合物、1900 万项生物活性测量数据以及已批准的药物信息。

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cellxgene-census

Sicher 69

查询6100万+单细胞基因组学数据集

von davila7

研究人员需要高效访问用于基因组学研究的群体规模单细胞数据。此技能提供由AI驱动的CZ CELLxGENE Census访问功能,包含优化的查询模式以及用于下游分析的集成指南。

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brenda-database

Niedriges Risiko 71

查询 BRENDA 酶数据库获取动力学数据

von davila7

从文献中查找酶动力学参数需要大量的搜索工作。此技能通过简单的界面直接访问 BRENDA 数据库,用于检索 Km 值、反应方程式和特定生物体的酶数据,服务于生物化学研究。

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bioservices

Niedriges Risiko 75

访问生物信息学数据库

von davila7

研究人员需要从多个数据库检索生物数据。此技能提供对40多个生物信息学服务的统一访问,包括 UniProt、KEGG、ChEMBL 和 Reactome,用于查询蛋白质序列、通路、化合物和相互作用。

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