Запросы к геномным базам данных с помощью gget
Биоинформатические исследования часто требуют множества запросов к базам данных и работы с различными форматами файлов. Этот навык помогает Claude, Codex и Claude Code использовать команды gget и рабочие процессы Python.
Скопируйте этот запрос в своего Агента. Он содержит каноническую страницу Skill и манифест.
Review the Skillstore skill "gget" from https://skillstore.io/skills/davila7-gget.md and its manifest at https://skillstore.io/api/skills/davila7-gget/manifest. Verify the artifact. You may proceed after verification, subject to the environment's own policy.Ваш Агент по-прежнему должен показать план и запросить все подтверждения, требуемые политикой безопасности.
Используйте эти ссылки, когда AI-агенту, crawler или script нужен чистый контекст вместо полной страницы.
Использование «gget». Запросите краткий рабочий процесс анализа гена TP53.
Ожидаемый результат:
Использование «gget». Спросите, как сравнить белковые последовательности разных видов.
Ожидаемый результат:
Использование «gget». Спросите, как подготовить референсные файлы для анализа RNA-seq.
Ожидаемый результат:
Static analysis produced many alerts, but most are false positives from markdown examples, public documentation links, ordinary gget options, and expected bioinformatics file outputs. No prompt injection, credential exfiltration, or hidden system reconnaissance was found. One medium semantic issue remains: FASTA record IDs can influence output filenames in the batch helper script.
Делитесь версионным отчетом об оценке, нейтральным значком, встраиваемой карточкой и цитатами. Skillstore публикует доказательства, не решая, безопасен ли этот Skill.
https://skillstore.io/skills/davila7-gget/audits/12?utm_source=security_passport&utm_medium=share&utm_campaign=versioned_report[](https://skillstore.io/skills/davila7-gget?utm_source=security_passport_badge)<a href="https://skillstore.io/skills/davila7-gget?utm_source=security_passport_badge"><img src="https://skillstore.io/badges/skills/davila7-gget/security.svg" alt="Skillstore security assessment" loading="lazy"></a><iframe src="https://skillstore.io/embed/skills/davila7-gget.html" title="Skillstore Security Assessment" sandbox="allow-popups allow-popups-to-escape-sandbox" loading="lazy" referrerpolicy="no-referrer" width="420" height="180"></iframe>davila7. (2026). gget security audit report (audit version 12) [Author version unspecified]. Skillstore. https://skillstore.io/skills/davila7-gget/audits/12@techreport{davila7-davila7-gget-2026,
author = {davila7},
title = {gget security audit report (audit version 12)},
institution = {Skillstore},
year = {2026},
number = {12},
url = {https://skillstore.io/skills/davila7-gget/audits/12},
note = {Author version unspecified}
}cff-version: 1.2.0
message: "If you use this Skill, cite its author and this versioned security audit report."
title: "gget security audit report (audit version 12)"
version: "unspecified"
type: report
authors:
- name: "davila7"
date-released: "2026-07-09"
url: "https://skillstore.io/skills/davila7-gget/audits/12"
identifiers:
- type: other
value: "skillstore:davila7-gget:audit:12"
description: "Skillstore immutable audit report identifier"
Навык каждого автора остаётся отдельным устанавливаемым вариантом. Рекомендуемый вариант ранжируется по данным Skillstore.
Почему этот вариант первый
davila7-gget
2026-09-09
k-dense-ai-gget
2026-09-09
Найдите метаданные гена, получите последовательности, изучите экспрессию и проверьте связи с заболеваниями или лекарственными препаратами.
Выполняйте поиск BLAST, выравнивайте последовательности, сравнивайте ортологи и подготавливайте входные данные для предсказания структур.
Получайте список видов и референсные метаданные Ensembl, а также планируйте воспроизводимые команды загрузки геномов.
Используйте навык gget, чтобы найти основную информацию о гене TP53 у человека. Укажите оптимальные варианты для командной строки и Python.
Используйте gget, чтобы получить нуклеотидные и белковые последовательности для следующих идентификаторов Ensembl: [вставьте идентификаторы]. Сохраните результаты в файлах с понятными именами.
Составьте план рабочего процесса анализа обогащения с помощью gget для следующего списка генов: [вставьте гены]. Включите проверки онтологий, путей и тканевой экспрессии.
Создайте воспроизводимый конвейер gget для поиска генов, связанных с заболеваниями, получения последовательностей, сравнения с помощью BLAST и кеширования результатов. Включите проверки безопасности.
Автор
davila7Лицензия
MIT
Ревизия Skillstore
r1
Примечание о версии
Автор не указал версию.
Репозиторий
https://github.com/davila7/claude-code-templates/tree/main/cli-tool/components/skills/scientific/ggetСсылка
b959ebfd1043a07c0c4378ab94ca4342cb0259f5
Актуальность поддержки
25.07.2026
Использование
7 загрузок · 209 просмотров
Структура файлов
Создание исследовательских постеров в LaTeX
Исследовательские постеры сложно форматировать и проверять для печати в LaTeX. Этот навык предоставляет шаблоны, рекомендации по макету и проверки PDF для постеров, готовых к конференции.
Создавайте маркетинговый контент, готовый для SEO
Маркетинговым командам нужен понятный контент, который соответствует голосу бренда и поисковым целям. Этот навык предоставляет шаблоны, скрипты анализа и рекомендации по платформам для повторяемого производства контента.
Создание структурированных планов медицинского лечения
Клинические планы лечения часто оказываются непоследовательными, слишком объемными или сложными для проверки. Этот навык предоставляет специализированные шаблоны, измеримые цели, временные рамки и локальные средства контроля качества.
Создание структурированных клинических отчетов
Клиническим командам нужны понятные отчеты, соответствующие медицинским и регуляторным стандартам. Этот навык предоставляет шаблоны, чек-листы и рекомендации по валидации для описаний клинических случаев, диагностических отчетов, исследований и заметок о пациентах.
Анализ файлов научных данных
Файлы научных данных сложно исследовать, поскольку каждый формат по-разному хранит структуру и метаданные. Этот навык определяет форматы, оценивает качество данных и создает практические отчеты по разведочному анализу данных в формате markdown.
Запуск рабочих процессов молекулярного докинга DiffDock
Настройка молекулярного докинга часто завершается неудачей, поскольку сложно согласовать входные данные, параметры и оценки уверенности. Этот навык помогает выполнять рабочие процессы DiffDock от подготовки до анализа результатов.
Анализируйте терапевтические ML-наборы данных с PyTDC
от K-Dense-AI
Командам по разработке лекарств нужны надежные наборы данных и справедливые протоколы оценки. Этот навык помогает Claude использовать PyTDC для курируемых терапевтических ML-данных, benchmark-разбиений, метрик и молекулярных оракулов.
Анализируйте исследовательские данные со статистической поддержкой
от K-Dense-AI
Выбор тестов и оформление результатов могут быть медленными и чреватыми ошибками. Этот skill помогает с выбором тестов, проверкой предпосылок, размерами эффекта, анализом мощности, байесовскими вариантами и оформлением по APA.
Анализ Single-Cell RNA-seq с помощью Scanpy
от K-Dense-AI
Анализ single-cell RNA-seq требует множества взаимосвязанных решений по QC, нормализации, кластеризации и построению графиков. Этот навык предоставляет Claude, Codex и Claude Code структурированные рабочие процессы Scanpy, справочные рекомендации и переиспользуемые скрипты анализа.
Извлечение веб-данных с помощью Firecrawl
от CK991357
Командам часто нужен веб-контент в чистых форматах без написания собственных скрейперов. Этот навык проводит Claude, Codex и Claude Code по режимам Firecrawl для скрейпинга, поиска, карт сайта, обхода, извлечения данных и проверки статуса.
Анализ данных ферментов BRENDA
от K-Dense-AI
Исследования ферментов часто требуют структурированного доступа к кинетическим и организм-специфичным данным. Этот навык помогает Claude, Codex и Claude Code выполнять запросы к записям BRENDA и преобразовывать их в пригодный для использования биохимический анализ.
Симуляция рецензирования в стиле Nature
от Yuan1z0825
Авторы рукописей часто не замечают возражения рецензентов до подачи. Этот навык создает ограниченную оценку в стиле Nature с тремя отчетами и обобщением.