gget
Запрос геномных баз данных и анализ последовательностей
또한 다음에서 사용할 수 있습니다: K-Dense-AI
Нужен быстрый доступ к информации о генах, белковых структурах или данным об экспрессии? Этот навык обеспечивает унифицированный доступ к более чем 20 биоинформатическим базам данных через единый интерфейс. Ищите гены, извлекайте последовательности, прогнозируйте структуры и анализируйте связи с заболеваниями без переключения инструментов.
스킬 ZIP 다운로드
Claude에서 업로드
설정 → 기능 → 스킬 → 스킬 업로드로 이동
토글을 켜고 사용 시작
테스트해 보기
"gget" 사용 중입니다. Find information about TP53 including its sequence, protein structure, and disease associations
예상 결과:
- • Gene: TP53 (ENSG00000141510)
- • Description: Tumor protein p53 - a tumor suppressor protein
- • UniProt ID: P04637
- • Tissue expression: Highest in testis, esophagus, and tongue
- • Top disease associations: Malignant neoplasm of colon, Lung adenocarcinoma (scores > 0.9)
- • Associated drugs: Doxorubicin, Cisplatin, Nutlin-3 (various trial phases)
- • PDB structures: 1TUP, 1TSR, 2ACO (and 12 more)
- • Nucleotide sequence: 1179 bp coding sequence available
보안 감사
안전Documentation wrapper for established open-source bioinformatics library. All patterns flagged are legitimate tool functionality: CLI command examples in docs, URLs to public genomic databases, and optional OpenAI API integration. No malicious behavior detected. gget is an academic tool from UC Berkeley's Pachter lab.
위험 요인
⚙️ 외부 명령어 (1)
🌐 네트워크 접근 (1)
📁 파일 시스템 액세스 (1)
품질 점수
만들 수 있는 것
Поиск информации о гене
Быстро находить сведения о генах, последовательностях и функциональных аннотациях из унифицированных поисков
Обогащающий анализ путей
Выполнять функциональное обогащение списков генов с использованием нескольких онтологических баз данных
Приоритизация мишеней
Идентифицировать гены, связанные с заболеваниями, и существующие лекарства, воздействующие на них
이 프롬프트를 사용해 보세요
Найти информацию о гене [GENE_NAME] у человека, включая его последовательность, функцию и связи с заболеваниями
Сравнить белковые последовательности [GENE_A] и [GENE_B] с использованием выравнивания MUSCLE и идентифицировать консервативные регионы
Получить данные об экспрессии в тканях для [GENE_NAME] и найти гены со схожими паттернами экспрессии
Идентифицировать лекарства, связанные с [GENE_NAME], и его связи с заболеваниями из OpenTargets
모범 사례
- Указывайте вид (homo_sapiens, mus_musculus) для точного сопоставления генов
- Используйте идентификаторы Ensembl для точных запросов, когда символы генов неоднозначны
- Сохраняйте результаты с флагами вывода для воспроизводимости в рабочих процессах
- Регулярно обновляйте gget в соответствии с изменением структур баз данных
피하기
- Использование символов генов без указания вида, когда символы могут перекрываться
- Запрос более 1000 идентификаторов Ensembl за один раз (может вызвать ошибки сервера)
- Пропуск обработки ошибок в автоматизированных конвейерах анализа
- Игнорирование спецификаций версий баз данных для воспроизводимости