약물 발견에는 대규모 화합물 라이브러리에서 약물 유사 특성을 가진 분자를 필터링해야 합니다. 이 스킬은 Rule of Five, Veber, PAINS 필터를 포함한 확립된 약물화학 규칙을 적용하여 분자를 효율적으로 우선순위화하고 구조적 경고를 식별합니다.
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테스트해 보기
"medchem" 사용 중입니다. 이 SMILES 목록을 약물 유사성으로 필터링하세요: CC(=O)OC1=CC=CC=C1C(=O)O, c1ccccc1, CCN
예상 결과:
- Aspirin: Rule of Five 통과
- Benzene: Ro5 통과 but H-결합 공여자/수락자 요구사항 실패
- Ethylamine: Rule of Five 통과
- 요약: 3개 분자 중 2개가 약물 유사성 기준 통과
"medchem" 사용 중입니다. 이 분자들의 PAINS 패턴 확인
예상 결과:
- 첫 번째 분자에서 PAINS 패턴 미검출
- 두 번째 분자에 로다닌 부분구조 포함 (PAINS 경고)
- 세 번째 분자 카테콜 패턴 플래그 지정됨
보안 감사
안전All 288 static findings are false positives. The static analyzer misidentified markdown code fences (backticks) as shell execution, Python file operations as Node.js fs, medicinal chemistry terminology (MD5, DES) as cryptographic weaknesses, and molecule validation as reconnaissance. This is a legitimate drug discovery library with no malicious code.
위험 요인
📁 파일 시스템 액세스 (1)
🌐 네트워크 접근 (1)
품질 점수
만들 수 있는 것
리드 화합물 우선순위화
합성을 위한 약물 유사 후보를 식별하기 위해 가상 스크리닝 결과를 필터링합니다.
화합물 품질 평가
확립된 약물화학 규칙에 따라 합성된 화합물을 평가합니다.
라이브러리 설계
최적의 물리화학적 특성을 가진 집중형 화합물 라이브러리를 설계합니다.
이 프롬프트를 사용해 보세요
이 SMILES 목록에 Rule of Five를 적용하고 통과하는 화합물을 식별하세요.
이 분자들의 PAINS 패턴 및 일반적인 구조적 경고를 확인하세요. 발견된 경고를 보고하세요.
리드 유사 기준과 Lilly 디머리트 필터를 적용하여 최적화할 화합물의 우선순위를 결정하세요.
Rule of Five, NIBR 필터, 복잡도 메트릭을 포함한 여러 필터를 내 화합물 라이브러리에 적용하세요.
모범 사례
- 종합적 평가를 위해 여러 필터 유형을 결합하세요
- 대규모 화합물 라이브러리에 대해 병렬 처리를 사용하세요
- 재현성을 위해 필터링 결정 사항을 문서화하세요
피하기
- 규칙 통과/실패만 기반으로 화합물을 맹목적으로 수용하거나 거부
- 속성 기반 규칙만 사용하여 구조적 경고 무시
- 발견 파이프라인 초기에 엄격한 필터 적용