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약물 유사성 규칙에 따른 분자 필터링

또한 다음에서 사용할 수 있습니다: davila7

약물 발견에는 대규모 화합물 라이브러리에서 약물 유사 특성을 가진 분자를 필터링해야 합니다. 이 스킬은 Rule of Five, Veber, PAINS 필터를 포함한 확립된 약물화학 규칙을 적용하여 분자를 효율적으로 우선순위화하고 구조적 경고를 식별합니다.

지원: Claude Codex Code(CC)
🥉 75 브론즈
1

스킬 ZIP 다운로드

2

Claude에서 업로드

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3

토글을 켜고 사용 시작

테스트해 보기

"medchem" 사용 중입니다. 이 SMILES 목록을 약물 유사성으로 필터링하세요: CC(=O)OC1=CC=CC=C1C(=O)O, c1ccccc1, CCN

예상 결과:

  • Aspirin: Rule of Five 통과
  • Benzene: Ro5 통과 but H-결합 공여자/수락자 요구사항 실패
  • Ethylamine: Rule of Five 통과
  • 요약: 3개 분자 중 2개가 약물 유사성 기준 통과

"medchem" 사용 중입니다. 이 분자들의 PAINS 패턴 확인

예상 결과:

  • 첫 번째 분자에서 PAINS 패턴 미검출
  • 두 번째 분자에 로다닌 부분구조 포함 (PAINS 경고)
  • 세 번째 분자 카테콜 패턴 플래그 지정됨

보안 감사

안전
v4 • 1/17/2026

All 288 static findings are false positives. The static analyzer misidentified markdown code fences (backticks) as shell execution, Python file operations as Node.js fs, medicinal chemistry terminology (MD5, DES) as cryptographic weaknesses, and molecule validation as reconnaissance. This is a legitimate drug discovery library with no malicious code.

5
스캔된 파일
3,480
분석된 줄 수
3
발견 사항
4
총 감사 수

위험 요인

감사자: claude 감사 이력 보기 →

품질 점수

64
아키텍처
100
유지보수성
85
콘텐츠
20
커뮤니티
100
보안
83
사양 준수

만들 수 있는 것

리드 화합물 우선순위화

합성을 위한 약물 유사 후보를 식별하기 위해 가상 스크리닝 결과를 필터링합니다.

화합물 품질 평가

확립된 약물화학 규칙에 따라 합성된 화합물을 평가합니다.

라이브러리 설계

최적의 물리화학적 특성을 가진 집중형 화합물 라이브러리를 설계합니다.

이 프롬프트를 사용해 보세요

기본 필터링
이 SMILES 목록에 Rule of Five를 적용하고 통과하는 화합물을 식별하세요.
구조적 경고
이 분자들의 PAINS 패턴 및 일반적인 구조적 경고를 확인하세요. 발견된 경고를 보고하세요.
리드 최적화
리드 유사 기준과 Lilly 디머리트 필터를 적용하여 최적화할 화합물의 우선순위를 결정하세요.
종합 분석
Rule of Five, NIBR 필터, 복잡도 메트릭을 포함한 여러 필터를 내 화합물 라이브러리에 적용하세요.

모범 사례

  • 종합적 평가를 위해 여러 필터 유형을 결합하세요
  • 대규모 화합물 라이브러리에 대해 병렬 처리를 사용하세요
  • 재현성을 위해 필터링 결정 사항을 문서화하세요

피하기

  • 규칙 통과/실패만 기반으로 화합물을 맹목적으로 수용하거나 거부
  • 속성 기반 규칙만 사용하여 구조적 경고 무시
  • 발견 파이프라인 초기에 엄격한 필터 적용

자주 묻는 질문

Rule of Five란 무엇입니까?
Lipinski의 Rule of Five는 MW ≤ 500, LogP ≤ 5, HBD ≤ 5, HBA ≤ 10 기반으로 경구 생체이용률을 예측합니다.
PAINS 필터란 무엇입니까?
PAINS(Pan Assay Interference) 필터는 비특이적 메커니즘을 통해 활성을 보이는 분자입니다.
공유 결합 억제제 설계에 사용할 수 있습니까?
네, 이 스킬은 공유 결합 억제제 설계에 유용한 마이클 수용체 및 기타 반응성기를 식별할 수 있습니다.
어떤 파일 형식이 지원합니까?
지원되는 입력 형식에는 CSV, TSV, SDF, SMILES가 포함된 일반 텍스트 파일이 있습니다.
RDKit이 필요합니까?
네, medchem은 분자 작업을 위해 RDKit에 의존합니다. pip install medchem으로 설치하세요.
결과는 어떻게 구성되어 있습니까?
결과에는 각 규칙의 통과/실패 상태, 상세한 위반 정보, 디머리트 점수가 포함됩니다.

개발자 세부 정보

작성자

K-Dense-AI

라이선스

Apache-2.0 license

참조

main

파일 구조