스킬 biogeobears

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biogeobears

Name: biogeobears
Author: brunoasm

콘텐츠 리비전 r2 안전 📁 파일 시스템 접근⚙️ 외부 명령어🌐 네트워크 접근

BioGeoBEARS 생물지리학 분석 실행

계통발생 생물지리학 워크플로는 형식을 맞추고 재현하기 어려울 수 있습니다. 이 스킬은 입력을 검증하고, BioGeoBEARS 스크립트를 준비하며, R에서 모델 비교를 안내합니다.

지원: Claude Codex Code(CC)

🥇 83 골드

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내 에이전트로 설치

이 요청을 에이전트에 복사하세요. 공식 Skill 페이지와 매니페스트가 포함되어 있습니다.

에이전트 요청

Review the Skillstore skill "biogeobears" from https://skillstore.io/skills/brunoasm-biogeobears.md and its manifest at https://skillstore.io/api/skills/brunoasm-biogeobears/manifest. Verify the artifact. You may proceed after verification, subject to the environment's own policy.

에이전트는 계속해서 계획을 표시하고 보안 정책에서 요구하는 확인을 요청해야 합니다.

에이전트가 읽기 쉬운 리소스

AI 에이전트, 크롤러, 스크립트가 전체 페이지 대신 정리된 컨텍스트만 필요할 때 이 링크를 사용하세요.

Markdown 상세 GET /skills/brunoasm-biogeobears.md 서명된 manifest GET /api/skills/brunoasm-biogeobears/manifest 서명된 lockfile GET /api/skills/brunoasm-biogeobears/lockfile

테스트해 보기

"biogeobears" 사용 중입니다. 연구자가 루팅된 트리와 종별 지역 분포 테이블을 제공합니다.

예상 결과:

이 스킬은 종 이름과 지리 인코딩을 검증합니다.
입력, RMarkdown 분석, 결과 경로, README가 포함된 프로젝트 폴더를 준비합니다.
분석을 실행하고 HTML 보고서를 검토하는 방법을 설명합니다.

"biogeobears" 사용 중입니다. 사용자가 섬 조류 분포를 가장 잘 설명하는 모델이 무엇인지 묻습니다.

예상 결과:

이 스킬은 DEC, DIVALIKE, BAYAREALIKE 및 +J 변형 비교를 추천합니다.
AIC, AICc 및 우도비 검정을 사용하여 모델 비교 표를 준비합니다.
분산, 멸종, 창시자 사건 추정치를 해석하는 방법을 설명합니다.

보안 감사

안전

v8 • 2026. 7. 23. 버전별 보고서 열기

All 110 static findings were adjudicated as false positives. Most detections are Markdown or RMarkdown backticks and intentional relative paths within the generated analysis directory. The explicit file write uses a user-selected output path, with no hidden network access, reconnaissance, or untrusted command evaluation.

스캔된 파일

1,868

분석된 줄 수

검토 항목

오탐 무시됨

위험 요인

📁 파일 시스템 접근 (12)

README.md:222 scripts/validate_geography_file.py:180 SKILL.md:181 SKILL.md:182 SKILL.md:185 SKILL.md:187 SKILL.md:199 SKILL.md:200 SKILL.md:203 SKILL.md:204 SKILL.md:243 SKILL.md:332

⚙️ 외부 명령어 (50)

🌐 네트워크 접근 (1)

SKILL.md:557

가장 최근에 완료된 정적·의미론적 감사에서 확인된 보안 발견 사항이 감지되지 않았습니다. 이는 스킬에 부작용이 없음을 증명하지 않습니다.

감사자: codex 감사 이력 보기 →

이 보고서 공유 및 인용

버전이 지정된 평가 보고서, 중립 배지, 임베드 카드 및 인용을 공유하세요. Skillstore는 근거를 보고하지만 이 Skill의 안전 여부를 판단하지 않습니다.

버전별 보고서 열기

보고서 링크 복사

https://skillstore.io/skills/brunoasm-biogeobears/audits/8?utm_source=security_passport&utm_medium=share&utm_campaign=versioned_report

Markdown 배지

[![Skillstore security assessment](https://skillstore.io/badges/skills/brunoasm-biogeobears/security.svg)](https://skillstore.io/skills/brunoasm-biogeobears?utm_source=security_passport_badge)

HTML 배지

<a href="https://skillstore.io/skills/brunoasm-biogeobears?utm_source=security_passport_badge"><img src="https://skillstore.io/badges/skills/brunoasm-biogeobears/security.svg" alt="Skillstore security assessment" loading="lazy"></a>

임베드 카드

<iframe src="https://skillstore.io/embed/skills/brunoasm-biogeobears.html" title="Skillstore Security Assessment" sandbox="allow-popups allow-popups-to-escape-sandbox" loading="lazy" referrerpolicy="no-referrer" width="420" height="180"></iframe>

학술 인용 (APA · BibTeX · CFF)

APA 인용

brunoasm. (2026). biogeobears security audit report (audit version 8) [Author version unspecified]. Skillstore. https://skillstore.io/skills/brunoasm-biogeobears/audits/8

BibTeX 인용

@techreport{brunoasm-brunoasm-biogeobears-2026,
  author = {brunoasm},
  title = {biogeobears security audit report (audit version 8)},
  institution = {Skillstore},
  year = {2026},
  number = {8},
  url = {https://skillstore.io/skills/brunoasm-biogeobears/audits/8},
  note = {Author version unspecified}
}

CITATION.cff

cff-version: 1.2.0
message: "If you use this Skill, cite its author and this versioned security audit report."
title: "biogeobears security audit report (audit version 8)"
version: "unspecified"
type: report
authors:
  - name: "brunoasm"
date-released: "2026-07-23"
url: "https://skillstore.io/skills/brunoasm-biogeobears/audits/8"
identifiers:
  - type: other
    value: "skillstore:brunoasm-biogeobears:audit:8"
    description: "Skillstore immutable audit report identifier"

Skillstore 점수

이 점수의 이유 증거 신뢰도: 높음

아키텍처

유지보수성

콘텐츠

커뮤니티

사양 준수

만들 수 있는 것

조상 분포 범위 연구 준비

계통발생 생물지리학 분석을 위해 검증된 입력, 스크립트, 문서를 설정합니다.

재현 가능한 BioGeoBEARS 워크플로 교육

역사 생물지리학을 배우는 학생들을 위해 명확한 폴더 구조와 안내형 분석 단계를 만듭니다.

모델 적합 전 데이터 확인

장시간 BioGeoBEARS 최적화 작업을 실행하기 전에 트리와 지리 데이터의 불일치를 찾습니다.

이 프롬프트를 사용해 보세요

기본 분석 시작

BioGeoBEARS 분석을 준비하도록 도와주세요. 제 트리 파일은 [tree path]이고, 분포 파일은 [data path]이며, 영역은 [number]개입니다.

지리 데이터 검증

이 계통발생 트리에 대해 제 지리 파일을 검증해 주세요. 필요하면 BioGeoBEARS용으로 재구성하고, 종 불일치를 설명해 주세요.

모델 및 매개변수 선택

[area list] 전반의 [taxon group]에 대해 BioGeoBEARS 모델과 최대 분포 범위 크기를 추천해 주세요. 스크립트를 생성하기 전에 트레이드오프를 설명해 주세요.

출판용 워크플로 구축

검증, 모델 비교, 조상 분포 범위 플롯, README 노트, 출판을 위한 해석 지침이 포함된 재현 가능한 BioGeoBEARS 워크플로를 만들어 주세요.

모범 사례

최종 분석 스크립트를 생성하기 전에 트리와 지리 파일을 검증하세요.
원본 입력 파일은 재구성된 BioGeoBEARS 입력과 분리하여 보관하세요.
모델 간 AIC 가중치가 비슷할 때는 모델 불확실성을 보고하세요.

피하기

종 이름과 트리 루팅을 확인하기 전에 모든 모델을 실행하지 마세요.
계산상 편리하다는 이유만으로 최대 분포 범위 크기를 선택하지 마세요.
도메인 검토 없이 최상의 AIC 모델을 생물학적으로 올바른 것으로 간주하지 마세요.

자주 묻는 질문

이 스킬에는 어떤 입력이 필요한가요?

루팅된 Newick 트리와 종 이름 및 영역별 존재 또는 부재가 포함된 지리 테이블이 필요합니다.

BioGeoBEARS를 자체적으로 실행할 수 있나요?

스크립트와 지침을 준비합니다. 사용자는 여전히 R, BioGeoBEARS 및 필수 패키지를 설치해야 합니다.

어떤 모델을 설정할 수 있나요?

DEC, DEC+J, DIVALIKE, DIVALIKE+J, BAYAREALIKE 및 BAYAREALIKE+J 워크플로를 지원합니다.

종 이름을 검증하나요?

예. 번들된 Python 검증 도구가 지리 데이터의 종 이름을 트리 말단 레이블과 비교할 수 있습니다.

결과는 어떻게 표시되나요?

RMarkdown 템플릿은 모델 표, 매개변수 요약, 조상 분포 범위 플롯, HTML 보고서를 생성합니다.

주요 한계는 무엇인가요?

대규모 데이터셋에서는 실행 시간이 길 수 있으며, 생물학적 가정은 여전히 전문가 검토가 필요합니다.

개발자 세부 정보

작성자

brunoasm

라이선스

MIT

Skillstore 리비전

버전 안내

작성자가 버전을 선언하지 않았습니다.

리포지토리

https://github.com/brunoasm/my_claude_skills/tree/main/biogeobears

참조

a39a91716eadede5f4cdefd78178fed4e837a128

유지보수 최신성

2026. 7. 26.

사용량

18 다운로드 · 271 조회

파일 구조

📄 README.md

📁 references/

📄 biogeobears_details.md

📁 scripts/

📄 biogeobears_analysis_template.Rmd

📄 validate_geography_file.py

📄 SKILL.md

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보안 감사

위험 요인

보고서 링크 복사

Markdown 배지

HTML 배지

임베드 카드

APA 인용

BibTeX 인용

CITATION.cff

Skillstore 점수

만들 수 있는 것

조상 분포 범위 연구 준비

재현 가능한 BioGeoBEARS 워크플로 교육

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