ena-database
低リスク 66European Nucleotide Archiveのクエリ
作成者 K-Dense-AI
研究者は分析のためにゲノムデータへの効率的なアクセスを必要としています。このスキルは、REST APIとFTPを通じてENAへのプログラマティックアクセスを提供し、アクセッション番号によるDNA/RNA配列、FASTQファイル、ゲノムアセンブリの取得を可能にします。
drugbank-database
安全 77DrugBank医薬品データベース情報へのアクセス
作成者 K-Dense-AI
DrugBankは詳細な医薬品情報を含む包括的なバイオインフォマティクスデータベースです。このスキルは、薬理学研究や創薬のために、医薬品の特性、相互作用、ターゲット、経路、および化学構造へのプログラムによるアクセスを可能にします。
docx
安全 70Word 文書の作成と編集
作成者 K-Dense-AI
このスキルは、Word 文書操作のための完全なツールキットを提供します。JavaScript で新規ドキュメントをゼロから作成し、Python で既存の文書を編集し、適切な OOXML 準拠で変更履歴やコメントを管理できます。
dnanexus-integration
安全 70DNAnexusゲノミクスプラットフォームワークフローの統合
作成者 K-Dense-AI
DNAnexusはクラウドベースのゲノミクス分析を提供しますが、プラットフォーム固有の知識が必要です。このスキルは、アプリの構築、データ管理、およびバイオインフォマティクスワークフローの実行に関する完全なドキュメントを提供します。
diffdock
安全 79AIドッキングによる分子結合ポーズ予測
作成者 K-Dense-AI
DiffDockは高度な拡散モデルを使用して、小さな分子がタンパク質にどのように3次元空間で結合するかを予測します。研究者は、正確な結合ポーズと構造ベース創薬のための信頼度スコアを生成することで、創薬を加速できます。
denario
低リスク 70科学的研究ワークフローの自動化
作成者 K-Dense-AI
仮説生成、方法論開発、計算実験、LaTeX論文執筆を自動化することで、データセットを公開可能な研究に変換します。マルチエージェントAIがエンドツーエンドの研究パイプラインを調整します。
deeptools
安全 79deepToolsでNGSデータを解析する
作成者 K-Dense-AI
次世代シーケンシングデータを処理・可視化。BAMからbigWigへの変換、品質管理プロットの生成、ChIP-seq、RNA-seq、ATAC-seq実験のための出版品質ヒートマップの作成。
deepchem
安全 75機械学習を化学と創薬に適用する
作成者 K-Dense-AI
DeepChemを使用して、溶解性、毒性、結合親和性などの分子特性を予測します。グラフニューラルネットワークを訓練するか、ChemBERTaなどの事前学習済みモデルを使用して、創薬や材料科学のアプリケーションに活用します。
datamol
安全 70Datamolで分子構造を分析する
作成者 K-Dense-AI
RDKitへのPython的なインターフェースで化学データを効率的に処理します。DatamolはRDKitエコシステムとの完全な互換性を維持しながら、複雑なケモインフォマティクス操作を簡素化します。
datacommons-client
低リスク 70Data Commonsから公開統計データを取得する
作成者 K-Dense-AI
Data Commonsから人口統計、経済、 健康、環境指標を含むグローバル統計データにアクセスします。Pythonクライアントメソッドを使用して、人口、GDP、失業率、地理的関係性をクエリします。
dask
安全 71Dask分散コンピューティングでpandasとNumPyをスケール
作成者 K-Dense-AI
並列コンピューティングを使用して、利用可能なRAMより大きなデータセットを処理します。コードを書き換えることなく、単一マシーンのpandasとNumPyのワークフローを複数のコアまたは分散クラスターで実行するように変換します。
cosmic-database
安全 75COSMICがん変異データベースへのアクセス
作成者 K-Dense-AI
がん研究者は研究のために包括的な変異データを必要としています。このスキルは、数百万の体細胞変異 CURATEされたがん遺伝子リスト、および精密がん治療研究のための突然変異署名を含むCOSMICデータベースへのプログラムによるアクセスを提供します。
cobrapy
安全 69COBRApyで代謝モデルを解析する
作成者 K-Dense-AI
代謝モデリングには制約ベースの再構築と解析手法の専門知識が必要です。COBRApyは、フラックスバランス解析、遺伝子ノックアウト研究、およびシステム生物学研究のための生産エンベロープ計算のための包括的なPythonインターフェースを提供します。
clinvar-database
低リスク 68ClinVar遺伝子変異データベースのクエリ
作成者 K-Dense-AI
ClinVarには臨床遺伝学のための重要な変異分類が含まれていますが、このデータにアクセスして解釈するには専門的な知識が必要です。このスキルは、ウェブインターフェース、API、またはFTPダウンロードを通じてClinVarをクエリするための包括的なガイダンスと、臨床的意義分類の詳細な解釈ガイドラインを提供します。
clinpgx-database
安全 73ClinPGx pharmacogenomicsデータベースへの問い合わせ
作成者 K-Dense-AI
ClinPGxにアクセスして、遺伝子-薬物相互作用、CPICガイドライン、アリル機能情報を含むファーマコジェノミクスデータを取得します。このスキルは、遺伝子型ガイド投薬に関する臨床的意思決定支援を提供することで、精密医療をサポートします。
clinicaltrials-database
安全 75ClinicalTrials.govで医学研究を検索
作成者 K-Dense-AI
関連する臨床試験を見つけるには、大規模なレジストリデータベースを検索する必要があります。このスキルは、ClinicalTrials.gov API v2に対してPythonインターフェースを提供し、疾患、薬物、場所、またはスポンサーで試験を検索し、詳細な研究情報を取得できます。
clinical-reports
安全 78コンプライアンス遵守の臨床レポート作成
作成者 K-Dense-AI
臨床文書作成には正確性と規制への準拠が求められます。このスキルは、CARE、FDA、ICH-GCPの基準に従った症例レポート、診断レポート、臨床試験文書、患者記録のためのテンプレートとバリデーションツールを提供します。
clinical-decision-support
安全 79臨床意思決定支援文書の生成
作成者 K-Dense-AI
臨床研究者は、創薬および規制当局への提出に必要なエビデンスベースの文書が必要です。このスキルは Biomarker 層別化と GRADE エビデンスグレーディングを備えた出版可能な臨床意思決定支援文書を作成します。
citation-management
低リスク 77学術引用と文献管理
作成者 K-Dense-AI
このスキルは、研究者が論文を見つけ、メタデータを抽出し、適切にフォーマットされたBibTeXエントリを生成するのに役立ちます。既存の引用を検証し、科学論文の執筆と出版における参照の正確性を確保します。
cirq
安全 71GoogleのCirq量子コンピューティングフレームワークを扱う
作成者 K-Dense-AI
GoogleのCirqフレームワークを使用して量子回路を設計およびシミュレートします。このスキルは、量子回路の構築、ノイズモデリング、ハードウェア統合、および量子コンピュータとシミュレータでの実験実行に関する包括的なドキュメントを提供します。