スキル zinc-database
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zinc-database

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Rechercher des composés ZINC pour la découverte de médicaments

La recherche de composés disponibles à l'achat et d'analogues utiles dans ZINC peut nécessiter une syntaxe de requête spécialisée. Cette compétence fournit des conseils pour les recherches, les téléchargements, le filtrage et la préparation à l'amarrage moléculaire.

対応: Claude Codex Code(CC)
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エージェントリクエスト
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エージェントが読めるリソース

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テストする

「zinc-database」を使用しています。 Trouve ZINC000000000001 et résume les champs disponibles pour ce composé.

期待される結果:

  • Type de recherche : recherche exacte par identifiant ZINC.
  • Champs demandés : identifiant ZINC, SMILES, tranche, code fournisseur et catalogues.
  • Remarque sur le résultat : vérifiez la disponibilité actuelle auprès du fournisseur avant toute commande.

「zinc-database」を使用しています。 Trouve des analogues proches pour un SMILES d'ibuprofène en utilisant une distance de trois.

期待される結果:

  • Type de recherche : recherche de similarité SMILES.
  • Filtre : distance de trois avec les champs de disponibilité à l'achat et de fournisseur.
  • Examen : comparez les structures, les propriétés des tranches et la disponibilité actuelle auprès des fournisseurs.

「zinc-database」を使用しています。 Planifie le téléchargement d'une bibliothèque de composés de type lead pour l'amarrage moléculaire.

期待される結果:

  • Commencez par un petit échantillon de composés de type lead et un nombre limité de champs de réponse.
  • Regroupez les composés sélectionnés par tranche avant de télécharger les structures 3D.
  • Validez les structures et les besoins en stockage avant de préparer les fichiers d'amarrage moléculaire.

セキュリティ監査

安全

Review found no malicious intent, prompt injection, secret access, or data exfiltration. Subprocess examples use argument lists without shell expansion; URL, database, and reconnaissance detections are documentation or file-format false positives. Network access remains an expected dependency on public ZINC services.

2
スキャンされたファイル
1,092
解析済み行数
0
レビュー項目
0
誤検知を無視

リスク要因

⚙️ 外部コマンド (50)
🌐 ネットワークアクセス (50)
最新の完了済み静的・セマンティック監査では、確認済みのセキュリティ検出事項は見つかりませんでした。これは、スキルに副作用がないことを証明するものではありません。
監査者: codex 監査履歴を表示 →
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セキュリティ評価

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埋め込みカード

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学術引用 (APA · BibTeX · CFF)

APA形式の引用

davila7. (2026). zinc-database security audit report (audit version 9) [Author version unspecified]. Skillstore. https://skillstore.io/skills/davila7-zinc-database/audits/9

BibTeX形式の引用

@techreport{davila7-davila7-zinc-database-2026, author = {davila7}, title = {zinc-database security audit report (audit version 9)}, institution = {Skillstore}, year = {2026}, number = {9}, url = {https://skillstore.io/skills/davila7-zinc-database/audits/9}, note = {Author version unspecified} }

CITATION.cff

cff-version: 1.2.0 message: "If you use this Skill, cite its author and this versioned security audit report." title: "zinc-database security audit report (audit version 9)" version: "unspecified" type: report authors: - name: "davila7" date-released: "2026-07-23" url: "https://skillstore.io/skills/davila7-zinc-database/audits/9" identifiers: - type: other value: "skillstore:davila7-zinc-database:audit:9" description: "Skillstore immutable audit report identifier"

バリアントを比較

インストール可能なバリアント 2 件

各作者のスキルは個別のインストール項目として維持されます。推奨バリアントは Skillstore の証拠で順位付けされます。

このバリアントが首位の理由

Skillstore スコアが最高
davila7 推奨 現在

davila7-zinc-database

Skillstore スコア 74
証拠の信頼度 高
Skillstore 利用状況 16
更新済み

2026-09-09

k-dense-ai-zinc-database

Skillstore スコア 73
証拠の信頼度 高
Skillstore 利用状況 16
更新済み

2026-09-09

Skillstore スコア

このスコアの理由 証拠の信頼度: 高
41
アーキテクチャ
85
保守性
87
コンテンツ
71
コミュニティ
83
仕様準拠

作成できるもの

Préparer une bibliothèque de criblage virtuel

Sélectionner un sous-ensemble ZINC, récupérer les identifiants et les structures, puis organiser les fichiers pour l'amarrage moléculaire.

Trouver des analogues disponibles à l'achat

Effectuer une recherche autour du SMILES d'un composé actif et comparer les composés correspondants, les fournisseurs, les tranches et leur disponibilité.

Créer un pipeline de données sur les composés

Exécuter des requêtes ZINC par lots, analyser les réponses tabulaires, mettre les résultats en cache et préparer des enregistrements validés pour l'analyse.

これらのプロンプトを試す

Rechercher un composé
Trouve l'identifiant ZINC {zinc_id}. Renvoie son SMILES, sa tranche, ses codes fournisseurs, ses catalogues et toute réserve concernant sa disponibilité.
Trouver des composés similaires
Recherche dans ZINC22 des analogues du SMILES {smiles} en utilisant la distance {distance}. Renvoie {count} correspondances disponibles à l'achat avec leurs identifiants ZINC, leurs SMILES et leurs fournisseurs.
Créer un échantillon de criblage
Crée un plan pour récupérer {count} composés du sous-ensemble {subset} depuis ZINC22. Demande uniquement les champs relatifs à l'identifiant ZINC, au SMILES, à la tranche et au fournisseur.
Préparer un workflow d'amarrage moléculaire
Conçois un workflow ZINC22 pour la cible {target}. Inclus la sélection des requêtes, les filtres de tranche, les téléchargements 3D, la validation, les limites de débit et la préparation à l'amarrage moléculaire.

ベストプラクティス

  • Commencez par des requêtes exactes ou de petite taille avant de lancer des recherches de similarité étendues et des téléchargements en masse.
  • Demandez uniquement les champs nécessaires, traitez les identifiants par lots, mettez les résultats en cache et respectez la capacité du service.
  • Validez les structures, la stéréochimie, la disponibilité auprès des fournisseurs et les licences avant toute utilisation expérimentale ou commerciale.

回避

  • Ne lancez pas de téléchargements récursifs de dépôts sans limites de stockage ni périmètre de tranches préalablement vérifié.
  • Ne considérez pas les enregistrements ZINC comme des preuves garanties de qualité, de sécurité ou de disponibilité.
  • Ne transmettez pas directement des URLs non fiables à des wrappers curl ou à d'autres commandes externes.

よくある質問

Qu'est-ce que la base de données ZINC ?
ZINC est une base de données publique de composés disponibles à l'achat, utilisée pour la découverte de ligands, le criblage virtuel et l'amarrage moléculaire.
Cette compétence peut-elle effectuer des recherches par SMILES ?
Oui. Elle documente les recherches exactes et de similarité utilisant SMILES avec des paramètres de distance configurables.
Peut-elle récupérer des structures 3D ?
Elle explique comment localiser et télécharger les fichiers de structures ZINC organisés par tranche.
Garantit-elle la disponibilité des composés ?
Non. Les catalogues des fournisseurs et les enregistrements de composés peuvent changer ; la disponibilité doit donc être vérifiée indépendamment.
Quels outils externes peuvent être nécessaires ?
Les workflows peuvent nécessiter curl, wget, pandas, RDKit, OpenBabel, DOCK ou AutoDock Vina.
Peut-elle valider des composés pour des expériences ?
Non. Effectuez des vérifications chimio-informatiques indépendantes, vérifiez les informations auprès des fournisseurs et obtenez l'approbation de votre établissement avant tout travail expérimental.

開発者情報

作成者

davila7

ライセンス

MIT

Skillstore リビジョン

r2

バージョンに関する注意

作者はバージョンを宣言していません。

参照

c43861a65bb95efcae259cd161c9d6f4dc7eec6f

メンテナンスの新しさ

2026/7/26

利用状況

10 ダウンロード · 269 閲覧

ファイル構成

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