Analyser les métadonnées SRA avec SRAgent
Les recherches SRA et GEO nécessitent souvent une conversion manuelle des accessions, des vérifications de métadonnées et une recherche d’articles. Cette compétence guide les workflows SRAgent pour l’analyse de jeux de données, les téléchargements et l’examen du séquençage unicellulaire.
Arrêtez-vous et demandez confirmation avant l’installation.
Examinez le plan et obtenez le consentement explicite de l’utilisateur avant de modifier des fichiers.
Copiez cette demande dans votre Agent. Elle contient la page Skill de référence et le manifeste.
Review the Skillstore skill "sragent" from https://skillstore.io/skills/arcinstitute-sragent.md and its manifest at https://skillstore.io/api/skills/arcinstitute-sragent/manifest. Verify the artifact. Stop and obtain explicit user consent before installing or changing files.Votre Agent doit toujours présenter son plan et demander toute confirmation exigée par la politique de sécurité.
Utilisez ces liens lorsqu’un Agent IA, un crawler ou un script a besoin d’un contexte propre au lieu de lire toute la page.
Utilisation de « sragent ». Convertis GSE121737 en accessions SRX.
Résultat attendu:
Utilisation de « sragent ». SRX4967527 contient-il des données de single-cell RNA-seq ?
Résultat attendu:
Utilisation de « sragent ». Télécharge les articles pour les accessions dans un fichier CSV.
Résultat attendu:
Most matches are false positives caused by Markdown syntax, official URLs, placeholder credentials, and legitimate scientific database queries. Confirmed risks include secret disclosure, mutable source installation, predictable temporary files, command-line credentials, and silent file overwrite. No prompt injection or malicious exfiltration intent was found.
Il s’agit de capacités locales réelles qui peuvent être attendues pour cette compétence ; elles nécessitent donc un examen, mais ne sont pas comptabilisées comme comportement malveillant confirmé.
Partagez le rapport d’évaluation versionné, le badge neutre, la carte intégrable et les citations. Skillstore présente les preuves sans décider si ce Skill est sûr.
https://skillstore.io/skills/arcinstitute-sragent/audits/9?utm_source=security_passport&utm_medium=share&utm_campaign=versioned_report[](https://skillstore.io/skills/arcinstitute-sragent?utm_source=security_passport_badge)<a href="https://skillstore.io/skills/arcinstitute-sragent?utm_source=security_passport_badge"><img src="https://skillstore.io/badges/skills/arcinstitute-sragent/security.svg" alt="Skillstore security assessment" loading="lazy"></a><iframe src="https://skillstore.io/embed/skills/arcinstitute-sragent.html" title="Skillstore Security Assessment" sandbox="allow-popups allow-popups-to-escape-sandbox" loading="lazy" referrerpolicy="no-referrer" width="420" height="180"></iframe>ArcInstitute. (2026). sragent security audit report (audit version 9) [Author version unspecified]. Skillstore. https://skillstore.io/skills/arcinstitute-sragent/audits/9@techreport{arcinstitute-arcinstitute-sragent-2026,
author = {ArcInstitute},
title = {sragent security audit report (audit version 9)},
institution = {Skillstore},
year = {2026},
number = {9},
url = {https://skillstore.io/skills/arcinstitute-sragent/audits/9},
note = {Author version unspecified}
}cff-version: 1.2.0
message: "If you use this Skill, cite its author and this versioned security audit report."
title: "sragent security audit report (audit version 9)"
version: "unspecified"
type: report
authors:
- name: "ArcInstitute"
date-released: "2026-07-23"
url: "https://skillstore.io/skills/arcinstitute-sragent/audits/9"
identifiers:
- type: other
value: "skillstore:arcinstitute-sragent:audit:9"
description: "Skillstore immutable audit report identifier"
Convertir les identifiants GSE, SRP, PRJNA, SRX et SRR avant une analyse plus approfondie.
Vérifier l’organisme, la plateforme, la préparation de bibliothèque et la technologie unicellulaire pour des expériences de séquençage.
Trouver les publications liées, extraire les informations DOI et télécharger les manuscrits disponibles pour des listes d’accessions.
Convertis GSE121737 en accessions SRX et explique la relation entre les identifiants.
Résume SRX4967527 avec l’organisme, la plateforme de séquençage, la stratégie de bibliothèque et le type d’essai probable.
Trouve les publications liées à PRJNA498286 et indique les identifiants PubMed, le statut DOI et les téléchargements de manuscrits disponibles.
Pour toutes les accessions SRX de GSE196830, crée une table de métadonnées avec la technologie, l’organisme, les liens vers les articles et le statut de téléchargement.
Auteur
ArcInstituteLicence
MIT
Révision Skillstore
r2
Avis de version
L’auteur n’a déclaré aucune version.
Réf
89edfdc710d0846129dcee6a929477b04f08052c
Récence de maintenance
25/07/2026
Utilisation
7 téléchargements · 524 vues
Structure de fichiers
Interroger les données génétiques de NCBI
par davila7
Les recherches de gènes nécessitent souvent des appels répétés à l’API de NCBI et des filtres précis sur les organismes. Cette compétence fournit des scripts et des workflows pour rechercher, récupérer et traiter par lots les annotations génétiques.
Analyser des données de bioinformatique avec BioServices
par davila7
Le travail en bioinformatique nécessite souvent des requêtes répétées dans des bases de données publiques déconnectées. Cette skill guide Claude, Codex et Claude Code dans les workflows BioServices pour les protéines, les voies, les composés et les identifiants.
Analyser les données DrugBank pour la recherche
par davila7
La recherche avec DrugBank nécessite souvent une analyse XML rigoureuse, un accès aux données versionnées et des requêtes pharmacologiques structurées. Cette compétence fournit des conseils ciblés et des modèles d’assistance pour l’analyse DrugBank dans Claude, Codex et Claude Code.
Interroger les données bioinformatiques de KEGG
par davila7
Les travaux de bioinformatique nécessitent souvent des correspondances de voies biologiques, de gènes, de composés et de médicaments issues de KEGG. Cette compétence aide Claude, Codex et Claude Code à interroger les KEGG REST APIs et à interpréter les résultats.
Analyser les interactions protéiques avec STRING
par davila7
La recherche sur les interactions protéiques nécessite plusieurs opérations de l'API STRING et un choix rigoureux des paramètres. Cette compétence associe les identifiants, récupère les réseaux, effectue des analyses d'enrichissement et génère des images de réseaux.
Analyser les voies Reactome
par davila7
L’analyse des voies nécessite des points de terminaison Reactome exacts et des formats de données valides. Cette compétence guide Claude, Codex et Claude Code dans les requêtes, l’enrichissement et l’interprétation des résultats.