string-database
Interroger la base de données d'interactions protéiques STRING
또한 다음에서 사용할 수 있습니다: K-Dense-AI
Accédez aux réseaux d'interactions protéine-protéine de la base de données STRING couvrant 59 millions de protéines et 20 milliards d'interactions. Effectuez des analyses d'enrichissement fonctionnel, découvrez des partenaires d'interaction et générez des visualisations de réseaux pour la recherche en biologie des systèmes.
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토글을 켜고 사용 시작
테스트해 보기
"string-database" 사용 중입니다. Get interaction partners for TP53
예상 결과:
- Principaux interacteurs de TP53 : MDM2 (score 999), MDM4 (score 995), ATM (score 957)
- MDM2 est l'interacteur le plus fort avec des preuves expérimentales
"string-database" 사용 중입니다. Enrich BRCA1 gene list
예상 결과:
- Réparation de l'ADN (GO:0006281) FDR: 1.2e-15
- Cycle cellulaire (GO:0007049) FDR: 3.4e-12
- Recombinaison homologue (GO:0000724) FDR: 8.9e-10
"string-database" 사용 중입니다. Create network image
예상 결과:
- Image de réseau générée montrant les connexions TP53, ATM, CHEK2, BRCA1
- Arêtes colorées par type de preuve, épaisseur selon le score de confiance
보안 감사
안전All static findings are false positives. External command detections are markdown code fences, network access is to legitimate STRING database API, filesystem operations save visualization images, and heuristic alerts are standard API client patterns. No malicious intent detected.
위험 요인
🌐 네트워크 접근 (1)
📁 파일 시스템 액세스 (1)
품질 점수
만들 수 있는 것
Analyse d'interactions protéiques
Analyser les réseaux de protéines pour les listes de gènes issues d'expériences de protéomique ou RNA-seq
Enrichissement de voies métaboliques
Identifier les termes GO et les voies KEGG enrichis dans des ensembles de protéines
Découverte de partenaires d'interaction
Trouver et visualiser les protéines interagissant avec une protéine d'intérêt
이 프롬프트를 사용해 보세요
Use string-database to get the interaction network for TP53 and MDM2 at high confidence (score 700)
Perform GO and KEGG enrichment analysis on these proteins: TP53, BRCA1, ATM, CHEK2, MDM2
Create a confidence-colored network image for these cancer genes and save as png
Check if these proteins form a significantly connected module: BRCA1, BRCA2, PALB2, RAD51, ATM
모범 사례
- Convertir d'abord les noms de gènes en identifiants STRING pour des requêtes plus rapides
- Utiliser un seuil de score de confiance approprié pour vos objectifs d'analyse
- Attendre 1 seconde entre les appels API pour respecter les limites de débit
피하기
- Ne pas utiliser de seuils de confiance faibles pour les figures de publication
- Ne pas omettre le paramètre d'espèce pour les grandes listes de protéines
- Ne pas négliger la vérification des erreurs lors de l'analyse des réponses API