RCSB PDB-Strukturen suchen
Arbeit in der Strukturbiologie erfordert genaue Struktur-IDs, Metadaten und Koordinatendateien. Dieser Skill führt Claude, Codex und Claude Code durch Such- und Abruf-Workflows für RCSB PDB.
Kopieren Sie diese Anfrage in Ihren Agent. Sie enthält die maßgebliche Skill-Seite und das Manifest.
Review the Skillstore skill "pdb-database" from https://skillstore.io/skills/davila7-pdb-database.md and its manifest at https://skillstore.io/api/skills/davila7-pdb-database/manifest. Verify the artifact. You may proceed after verification, subject to the environment's own policy.Ihr Agent sollte weiterhin seinen Plan anzeigen und alle von der Sicherheitsrichtlinie verlangten Bestätigungen anfordern.
Verwenden Sie diese Links, wenn ein KI-Agent, Crawler oder Skript sauberen Kontext benötigt, statt die vollständige Seite zu lesen.
„pdb-database“ wird verwendet. Finde hochauflösende Hämoglobin-Strukturen in RCSB PDB.
Erwartetes Ergebnis:
„pdb-database“ wird verwendet. Lade Koordinatendateien für ausgewählte PDB IDs herunter.
Erwartetes Ergebnis:
„pdb-database“ wird verwendet. Vergleiche Kandidatenstrukturen für ein Wirkstoffziel.
Erwartetes Ergebnis:
All 81 static findings are false positives caused by documentation examples, Markdown formatting, or expected access to official RCSB services. No prompt injection, concealed execution, data exfiltration, or unrelated system reconnaissance was found.
Teile den versionierten Bewertungsbericht, das neutrale Badge, die Einbettungskarte und Zitate. Skillstore berichtet Nachweise, ohne zu entscheiden, ob dieser Skill sicher ist.
https://skillstore.io/skills/davila7-pdb-database/audits/10?utm_source=security_passport&utm_medium=share&utm_campaign=versioned_report[](https://skillstore.io/skills/davila7-pdb-database?utm_source=security_passport_badge)<a href="https://skillstore.io/skills/davila7-pdb-database?utm_source=security_passport_badge"><img src="https://skillstore.io/badges/skills/davila7-pdb-database/security.svg" alt="Skillstore security assessment" loading="lazy"></a><iframe src="https://skillstore.io/embed/skills/davila7-pdb-database.html" title="Skillstore Security Assessment" sandbox="allow-popups allow-popups-to-escape-sandbox" loading="lazy" referrerpolicy="no-referrer" width="420" height="180"></iframe>davila7. (2026). pdb-database security audit report (audit version 10) [Author version unspecified]. Skillstore. https://skillstore.io/skills/davila7-pdb-database/audits/10@techreport{davila7-davila7-pdb-database-2026,
author = {davila7},
title = {pdb-database security audit report (audit version 10)},
institution = {Skillstore},
year = {2026},
number = {10},
url = {https://skillstore.io/skills/davila7-pdb-database/audits/10},
note = {Author version unspecified}
}cff-version: 1.2.0
message: "If you use this Skill, cite its author and this versioned security audit report."
title: "pdb-database security audit report (audit version 10)"
version: "unspecified"
type: report
authors:
- name: "davila7"
date-released: "2026-07-23"
url: "https://skillstore.io/skills/davila7-pdb-database/audits/10"
identifiers:
- type: other
value: "skillstore:davila7-pdb-database:audit:10"
description: "Skillstore immutable audit report identifier"
Jeder Autor bleibt ein eigener installierbarer Skill. Die empfohlene Variante wird nach Skillstore-Nachweisen bewertet.
Warum diese Variante zuerst steht
davila7-pdb-database
2026-09-09
k-dense-ai-pdb-database
2026-09-09
Identifiziert PDB-Einträge für ein Proteinziel und vergleicht anschließend Methoden, Auflösung, Liganden und Organismendaten.
Sammelt Kandidatenstrukturen von Protein-Ligand-Komplexen und Koordinatendateien für Docking, Bindungsstellenprüfung oder Assay-Planung.
Sammelt klare Strukturbeispiele und Metadaten für Demonstrationen im Unterricht oder angeleitete Lektionen zur molekularen Visualisierung.
Finde RCSB PDB-Strukturen für Hämoglobin. Gib relevante PDB IDs, Methoden, Auflösungen und kurze Hinweise zur Auswahl zurück.
Durchsuche RCSB PDB nach menschlichen Kinase-Strukturen unter 2.5 Ångström. Fasse IDs, Liganden und Qualitätsgrenzen zusammen.
Erstelle einen Workflow zum Herunterladen von mmCIF-Dateien für 4HHB, 1MBN und 1GZX. Berücksichtige Benennung, Prüfungen und Ratenlimits.
Erstelle einen Forschungsplan, der Sequenzähnlichkeitssuche, Metadatenabruf, Koordinatendownloads und Qualitätsfilterung für mein Zielprotein kombiniert.
Autor
davila7Lizenz
MIT
Skillstore-Revision
r2
Versionshinweis
Der Autor hat keine Version angegeben.
Ref.
c43861a65bb95efcae259cd161c9d6f4dc7eec6f
Aktualität der Wartung
27.7.2026
Nutzung
7 Downloads · 224 Aufrufe
Dateistruktur
LaTeX-Forschungsposter erstellen
Forschungsposter sind in LaTeX schwer zu formatieren und für den Druck zu prüfen. Dieser Skill bietet Vorlagen, Layout-Anleitung und PDF-Prüfungen für konferenzfertige Poster.
SEO-fertige Marketinginhalte erstellen
Marketingteams benötigen klare Inhalte, die zur Markenstimme und zu Suchzielen passen. Diese Skill bietet Vorlagen, Analyseskripte und plattformspezifische Leitlinien für eine wiederholbare Content-Produktion.
Strukturierte medizinische Behandlungspläne erstellen
Klinische Behandlungspläne werden häufig uneinheitlich, lang oder schwer überprüfbar. Dieser Skill bietet fokussierte Vorlagen, messbare Ziele, Zeitpläne und lokale Qualitätsprüfungen.
Strukturierte klinische Berichte erstellen
Klinische Teams benötigen klare Berichte, die medizinischen und regulatorischen Standards entsprechen. Dieser Skill stellt Vorlagen, Checklisten und Validierungshinweise für Fallberichte, Diagnostik, Studien und Patientennotizen bereit.
Wissenschaftliche Datendateien analysieren
Wissenschaftliche Datendateien sind schwer zu untersuchen, da jedes Format Strukturen und Metadaten anders speichert. Dieser Skill erkennt Formate, erstellt Datenqualitätsprofile und erzeugt praxisorientierte EDA-Berichte im Markdown-Format.
DiffDock-Workflows für molekulares Docking ausführen
Die Einrichtung molekularer Docking-Verfahren scheitert häufig daran, dass Eingaben, Parameter und Konfidenzwerte schwer aufeinander abzustimmen sind. Dieser Skill führt durch DiffDock-Workflows von der Vorbereitung bis zur Prüfung der Ergebnisse.
Therapeutische ML-Datensätze mit PyTDC analysieren
von K-Dense-AI
Teams in der Wirkstoffforschung benötigen zuverlässige Datensätze und faire Bewertungsprotokolle. Diese Skill hilft Claude dabei, PyTDC für kuratierte therapeutische ML-Daten, Benchmark-Splits, Metriken und molekulare Orakel zu verwenden.
Single-Cell-RNA-seq mit Scanpy analysieren
von K-Dense-AI
Die Single-Cell-RNA-seq-Analyse erfordert viele miteinander verknüpfte Entscheidungen über QC, Normalisierung, Clustering und Visualisierung hinweg. Diese Skill bietet Claude, Codex und Claude Code strukturierte Scanpy-Workflows, Referenzanleitungen und wiederverwendbare Analyseskripte.
Molekulare ML-Workflows mit DeepChem erstellen
von K-Dense-AI
Molekulares maschinelles Lernen erfordert oft spezialisierte Featurizer, Datensätze und Evaluierungsmethoden. Diese Skill hilft Claude, Codex und Claude Code dabei, DeepChem-Workflows für Eigenschaftsvorhersage, Transfer Learning und Benchmarks zu entwerfen.
BRENDA-Enzymdaten analysieren
von K-Dense-AI
Enzymforschung erfordert häufig strukturierten Zugriff auf kinetische und organismusspezifische Daten. Dieser Skill hilft Claude, Codex und Claude Code dabei, BRENDA-Datensätze abzufragen und sie in nutzbare biochemische Analysen umzuwandeln.
ChEMBL-Daten zur Wirkstoffforschung abfragen
von K-Dense-AI
Teams in der Wirkstoffforschung benötigen zuverlässigen Zugriff auf Datensätze zu Verbindungen, Targets und Bioaktivität. Diese Skill führt Claude, Codex und Claude Code durch ChEMBL-Suchen, Filter und Analyse-Workflows.
COSMIC-Krebsmutationsdaten erkunden
von K-Dense-AI
Krebsforschende benötigen vertrauenswürdige Mutationsdaten, ohne viele Dateien durchsuchen zu müssen. Diese Skill erklärt COSMIC-Datensätze, Dateipfade, Downloads und Analysemuster für Claude, Codex und Claude Code.