📦

gene-database

Name: gene-database
Author: davila7

Inhaltsrevision r1 Sicher 🌐 Netzwerkzugriff🔑 Umgebungsvariablen📁 Dateisystemzugriff⚙️ Externe Befehle

NCBI-Gendaten abfragen

Genabfragen erfordern häufig wiederholte Aufrufe der NCBI API und sorgfältige Organismusfilter. Dieser Skill bietet Skripte und Arbeitsabläufe zum Suchen, Abrufen und zur Stapelverarbeitung von Genannotationen.

Unterstützt: Claude Codex Code(CC)

🥉 79 Bronze

Mit meinem Agent installieren

Kopieren Sie diese Anfrage in Ihren Agent. Sie enthält die maßgebliche Skill-Seite und das Manifest.

Agent-Anfrage

Review the Skillstore skill "gene-database" from https://skillstore.io/skills/davila7-gene-database.md and its manifest at https://skillstore.io/api/skills/davila7-gene-database/manifest. Verify the artifact. You may proceed after verification, subject to the environment's own policy.

Ihr Agent sollte weiterhin seinen Plan anzeigen und alle von der Sicherheitsrichtlinie verlangten Bestätigungen anfordern.

Agent-lesbare Ressourcen

Verwenden Sie diese Links, wenn ein KI-Agent, Crawler oder Skript sauberen Kontext benötigt, statt die vollständige Seite zu lesen.

Markdown-Detailseite GET /skills/davila7-gene-database.md Signiertes manifest GET /api/skills/davila7-gene-database/manifest Signiertes lockfile GET /api/skills/davila7-gene-database/lockfile

Testen

„gene-database“ wird verwendet. Finde BRCA1 beim Menschen.

Erwartetes Ergebnis:

Eine prägnante Genzusammenfassung mit Gene ID 672, Symbol BRCA1, Organismus Homo sapiens, Chromosom 17 und Genkartenposition.

„gene-database“ wird verwendet. Annotiere eine Liste menschlicher Onkologiegene.

Erwartetes Ergebnis:

Eine tabellenfertige Zusammenfassung mit einer Beschreibung jedes gefundenen Gens, nicht gefundener Symbole und etwaiger Abfragefehler.

„gene-database“ wird verwendet. Rufe TP53 mit ausführlichen Details ab.

Erwartetes Ergebnis:

Eine strukturierte Darstellung von Aliassen, chromosomaler Position, Gentyp und Transkriptbeispielen.

Sicherheitsaudit

Sicher

v14 • 9.7.2026 Versionsbericht öffnen

The executable scripts make intended outbound requests to NCBI Gene APIs and one batch workflow can write results to a user-selected file. API-key and command-execution alerts are false positives from parameter names, placeholders, and Markdown examples; no hardcoded secrets, environment access, prompt injection, or hidden system reconnaissance was found.

Gescannte Dateien

1,837

Analysierte Zeilen

Prüfelemente

Falschmeldungen ignoriert

Elemente der Fähigkeitsprüfung (19)

Dies sind echte lokale Fähigkeiten, die für diese Fähigkeit erwartet werden können; daher müssen sie überprüft werden, werden jedoch nicht als bestätigtes bösartiges Verhalten gezählt.

Mittel

scripts/batch_gene_lookup.py:287

Python file write/append

with open(args.output, 'w') as f:

batch_gene_lookup.py writes JSON results to args.output supplied on the command line. This is intended output behavior, but an unsafe path could overwrite an arbitrary local file.

Niedrig

scripts/batch_gene_lookup.py:14

Python HTTP libraries

import urllib.request

This executable script performs outbound HTTPS requests to NCBI public gene APIs using user-provided gene IDs or search terms. The behavior is intended, but it can disclose queries and optional API keys to an external service.

Niedrig

scripts/batch_gene_lookup.py:78

Python HTTP libraries

with urllib.request.urlopen(url) as response:

Niedrig

scripts/batch_gene_lookup.py:131

Python HTTP libraries

with urllib.request.urlopen(url) as response:

Niedrig

scripts/batch_gene_lookup.py:53

Hardcoded URL

base_url = "https://eutils.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/eutils/"

Niedrig

scripts/batch_gene_lookup.py:109

Hardcoded URL

base_url = "https://eutils.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/eutils/"

Niedrig

scripts/fetch_gene_data.py:13

Python HTTP libraries

import urllib.request

Niedrig

scripts/fetch_gene_data.py:74

Python HTTP libraries

req = urllib.request.Request(url, headers=headers)

Niedrig

scripts/fetch_gene_data.py:75

Python HTTP libraries

with urllib.request.urlopen(req) as response:

Niedrig

scripts/fetch_gene_data.py:112

Python HTTP libraries

req = urllib.request.Request(url, headers=headers)

Niedrig

scripts/fetch_gene_data.py:113

Python HTTP libraries

with urllib.request.urlopen(req) as response:

Niedrig

scripts/fetch_gene_data.py:146

Python HTTP libraries

req = urllib.request.Request(url, data=data, headers=headers, method='POST')

Niedrig

scripts/fetch_gene_data.py:147

Python HTTP libraries

with urllib.request.urlopen(req) as response:

Niedrig

scripts/fetch_gene_data.py:17

Hardcoded URL

DATASETS_API_BASE = "https://api.ncbi.nlm.nih.gov/datasets/v2alpha/gene"

Niedrig

scripts/query_gene.py:14

Python HTTP libraries

import urllib.request

Niedrig

scripts/query_gene.py:48

Python HTTP libraries

with urllib.request.urlopen(url) as response:

Niedrig

scripts/query_gene.py:88

Python HTTP libraries

with urllib.request.urlopen(url) as response:

Niedrig

scripts/query_gene.py:123

Python HTTP libraries

with urllib.request.urlopen(url) as response:

Niedrig

scripts/query_gene.py:19

Hardcoded URL

BASE_URL = "https://eutils.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/eutils/"

Risikofaktoren

🌐 Netzwerkzugriff (39)

🔑 Umgebungsvariablen (50)

📁 Dateisystemzugriff (1)

scripts/batch_gene_lookup.py:287

⚙️ Externe Befehle (22)

Geprüft von: codex Audit-Verlauf anzeigen →

Diesen Bericht teilen & zitieren

Teile den versionierten Bewertungsbericht, das neutrale Badge, die Einbettungskarte und Zitate. Skillstore berichtet Nachweise, ohne zu entscheiden, ob dieser Skill sicher ist.

Versionsbericht öffnen

Berichtslink kopieren

https://skillstore.io/skills/davila7-gene-database/audits/14?utm_source=security_passport&utm_medium=share&utm_campaign=versioned_report

Markdown-Badge

[![Skillstore security assessment](https://skillstore.io/badges/skills/davila7-gene-database/security.svg)](https://skillstore.io/skills/davila7-gene-database?utm_source=security_passport_badge)

HTML-Badge

<a href="https://skillstore.io/skills/davila7-gene-database?utm_source=security_passport_badge"><img src="https://skillstore.io/badges/skills/davila7-gene-database/security.svg" alt="Skillstore security assessment" loading="lazy"></a>

Einbettungskarte

<iframe src="https://skillstore.io/embed/skills/davila7-gene-database.html" title="Skillstore Security Assessment" sandbox="allow-popups allow-popups-to-escape-sandbox" loading="lazy" referrerpolicy="no-referrer" width="420" height="180"></iframe>

Wissenschaftliche Zitate (APA · BibTeX · CFF)

APA-Zitat

davila7. (2026). gene-database security audit report (audit version 14) [Author version unspecified]. Skillstore. https://skillstore.io/skills/davila7-gene-database/audits/14

BibTeX-Zitat

@techreport{davila7-davila7-gene-database-2026,
  author = {davila7},
  title = {gene-database security audit report (audit version 14)},
  institution = {Skillstore},
  year = {2026},
  number = {14},
  url = {https://skillstore.io/skills/davila7-gene-database/audits/14},
  note = {Author version unspecified}
}

CITATION.cff

cff-version: 1.2.0
message: "If you use this Skill, cite its author and this versioned security audit report."
title: "gene-database security audit report (audit version 14)"
version: "unspecified"
type: report
authors:
  - name: "davila7"
date-released: "2026-07-09"
url: "https://skillstore.io/skills/davila7-gene-database/audits/14"
identifiers:
  - type: other
    value: "skillstore:davila7-gene-database:audit:14"
    description: "Skillstore immutable audit report identifier"

Varianten vergleichen

2 installierbare Varianten

Jeder Autor bleibt ein eigener installierbarer Skill. Die empfohlene Variante wird nach Skillstore-Nachweisen bewertet.

Warum diese Variante zuerst steht

Höchster Skillstore-Score

Autor / Quelle Skillstore-Score Evidenzvertrauen Skillstore-Nutzung Aktualisiert

davila7 Empfohlen Aktuell

davila7-gene-database

Skillstore-Score 79

Evidenzvertrauen Hoch

Skillstore-Nutzung 9

Aktualisiert

2026-09-09

K-Dense-AI

k-dense-ai-gene-database

Skillstore-Score 38

Evidenzvertrauen Mittel

Skillstore-Nutzung 8

Aktualisiert

2026-09-09

Skillstore-Score

Warum dieser Score Evidenzvertrauen: Hoch

Architektur

Wartbarkeit

Inhalt

Gemeinschaft

Spezifikationskonformität

Was Sie erstellen können

Krankheitsbezogene Genlisten annotieren

Nach Krankheitsbegriffen suchen und Genidentifikatoren, Beschreibungen, Organismen, Chromosomen und Genkartenpositionen abrufen.

Genpanels validieren

Gensymbole oder IDs vor Pipeline-Analysen, Berichten oder Veröffentlichungstabellen stapelweise prüfen.

Modellorganismen vergleichen

Dasselbe Gen in unterstützten Taxa nachschlagen und Identifikatoren, Aliasse und genomische Positionen vergleichen.

Diese Prompts ausprobieren

Ein einzelnes Gen suchen

Verwende den gene-database-Skill, um BRCA1 beim Menschen zu suchen. Fasse Gene ID, Symbol, Beschreibung, Organismus und Chromosom zusammen.

Anhand der Gene ID abrufen

Verwende den NCBI Datasets-Arbeitsablauf, um Gene ID 672 abzurufen. Gib eine lesbare Zusammenfassung mit Aliassen, Position und Transkripten zurück.

Ein Panel annotieren

Verwende die Stapelabfrage für BRCA1, TP53, EGFR und KRAS beim Menschen. Gib Status, Gene ID, Symbol, Organismus und Genkartenposition an.

Signalwegabfrage entwerfen

Plane eine NCBI Gene-Suche nach Apoptosegenen bei Mäusen. Gib Suchbegriffe, Ratenbegrenzungen und Ausgabefelder für die nachgelagerte Analyse an.

Bewährte Praktiken

Gib bei jeder Symbolsuche den Organismus an.
Verwende Gene IDs, wenn Präzision entscheidend ist.
Speichere wiederholt abgerufene Ergebnisse im Cache und halte die Ratenbegrenzungen von NCBI ein.

Vermeiden

Behandle Genannotationen nicht als klinische Leitlinien.
Verarbeite große Listen nicht ohne Ratenbegrenzung stapelweise.
Füge private API-Schlüssel nicht in gemeinsam genutzte Transkripte oder Protokolle ein.