gene-database
NCBI-Gendatenbank abfragen
Auch verfügbar von: davila7
Umfassende gendaten von NCBI abrufen, einschließlich Sequenzen, Annotationen und funktioneller Informationen. Nach Gensymbol, ID oder biologischem Kontext suchen, um RefSeqs, Genontologie, chromosomale Standorte und Phänotypen für die Bioinformatikforschung zu erhalten.
Die Skill-ZIP herunterladen
In Claude hochladen
Gehe zu Einstellungen → Fähigkeiten → Skills → Skill hochladen
Einschalten und loslegen
Teste es
Verwendung von "gene-database". Informationen über BRCA1 beim Menschen finden
Erwartetes Ergebnis:
- Gen-ID: 672
- Symbol: BRCA1
- Beschreibung: BRCA1 DNA-Reparatur-assoziiert
- Organismus: Homo sapiens
- Chromosom: 17
- Position: 17q21.31
Verwendung von "gene-database". Gene finden, die mit Diabetes beim Menschen assoziiert sind
Erwartetes Ergebnis:
- Gen-ID-Liste mit Symbol, Beschreibung und Chromosom für Diabetes-assoziierte Gene
- Suchanfrage: diabetes[disease] AND human[organism]
Verwendung von "gene-database". Stapelweise gendaten für TP53, EGFR, KRAS abrufen
Erwartetes Ergebnis:
- Stapelweise Ergebnisse mit Gen-ID, Symbol, Beschreibung, Organismus, Chromosom und Kartenposition für jedes Gen
Sicherheitsaudit
Niedriges RisikoThis is a legitimate bioinformatics tool for querying NCBI Gene database. All 374 static findings are false positives: markdown backticks in documentation are code formatting (not shell execution), API keys are user-provided CLI arguments (not hardcoded secrets), hardcoded URLs are official NCBI API endpoints, and the network+credential+file pattern is standard API client behavior. No data exfiltration or malicious patterns detected.
Risikofaktoren
🌐 Netzwerkzugriff (4)
⚙️ Externe Befehle (3)
🔑 Umgebungsvariablen (3)
📁 Dateisystemzugriff (1)
Qualitätsbewertung
Was du bauen kannst
Gen-Annotations-Workflows
Umfassende Gendaten abrufen, einschließlich Sequenzen, GO-Begriffe und Phänotypen für die Funktionsanalyse.
Stapelweise Gensammlung
Genlisten effizient mit Ratenbegrenzung für groß angelegte Genomstudien verarbeiten.
Geninformationen nachschlagen
Gensymbole abfragen und detaillierte Informationen für Bildungszwecke abrufen.
Probiere diese Prompts
Informationen über das {gene_symbol}-Gen in {organism} finden, einschließlich seiner chromosomalen Position und Funktion.RefSeq-Zugangsnummern und Gensequenzdaten für {gene_id} im JSON-Format abrufen.Geninformationen für die folgenden Gene aus {organism} nachschlagen: {gene_list}. Die Ergebnisse als JSON zurückgeben.Gene finden, die mit {biological_process} in {organism} unter Verwendung von Genontologie-Begriffen assoziiert sind.Bewährte Verfahren
- Den Organismus in Ihre Abfrage einbeziehen, um mehrdeutige Ergebnisse von Gensymbolen zu vermeiden, die bei mehreren Arten vorkommen
- Gen-IDs anstelle von Symbolen verwenden, wenn Präzision erforderlich ist, da sich Gensymbolle im Laufe der Zeit ändern können
- Ihren NCBI-API-Schlüssel für schnellere Stapelverarbeitung einbeziehen (bis zu 10 Anfragen pro Sekunde)
Vermeiden
- Keine einzelnen Anfragen in einer Schleife ohne Ratenbegrenzung durchführen, da dies NCBI-Ratenlimits auslöst
- Sich nicht ausschließlich auf Gensymbole für die permanente Speicherung verlassen, da sich die offizielle Nomenklatur ändern kann
- Nicht davon ausgehen, dass alle Gensymbole innerhalb eines Organismus eindeutig sind, ohne dies zu überprüfen
Häufig gestellte Fragen
Wie erhalte ich einen NCBI-API-Schlüssel?
Welche Genformate werden unterstützt?
Kann ich Proteinsequenzen abrufen?
Wie viele Gene kann ich auf einmal abfragen?
Welche Ausgabeformate sind verfügbar?
Speichert diese Fähigkeit Daten?
Entwicklerdetails
Autor
K-Dense-AILizenz
MIT
Repository
https://github.com/K-Dense-AI/claude-scientific-skills/tree/main/scientific-skills/gene-databaseRef
main
Dateistruktur