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latex-posters
87创建 LaTeX 科研海报
科研海报在 LaTeX 中很难排版，也很难为印刷进行校对。此技能提供模板、布局指导和 PDF 检查，帮助制作符合会议要求的海报。
设计与创意 查看
技能 rdkit
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rdkit
内容修订 r2 高风险 📁 文件系统访问⚡ 包含脚本⚙️ 外部命令
使用 RDKit 分析分子
化学信息学工作通常需要精确的分子解析、描述符、指纹和子结构逻辑。此技能提供 RDKit 指导和可复用脚本，用于研究工作流。
支持: Claude Codex Code(CC)
安装前请停下并请求确认。
请审查安装计划，并在更改文件前获得用户明确同意。
使用我的智能体安装
将此请求复制给你的智能体，其中包含权威 Skill 页面和清单。
智能体请求
Review the Skillstore skill "rdkit" from https://skillstore.io/skills/davila7-rdkit.md and its manifest at https://skillstore.io/api/skills/davila7-rdkit/manifest. Verify the artifact. Stop and obtain explicit user consent before installing or changing files.你的智能体仍应展示其计划，并按安全策略请求必要确认。
Agent 可读资源
当 AI Agent、爬虫或脚本需要干净上下文，而不是读取完整页面时，请使用这些链接。
测试它
正在使用“rdkit”。 阿司匹林、咖啡因和乙醇的 SMILES 列表。
预期结果:
包含分子式、分子量、LogP、TPSA、氢键计数和 Lipinski 通过状态的描述符摘要。
正在使用“rdkit”。 一个苯查询分子和一个化合物库文件。
预期结果:
包含化合物名称、canonical SMILES 和 Tanimoto 分数的排序相似性命中列表。
正在使用“rdkit”。 一个分子文件，以及用于 PAINS 和反应性基团的 SMARTS 模式。
预期结果:
一份筛选摘要，将包含、排除和未匹配的分子按匹配模式名称区分开。
安全审计
高风险v9 • 2026/7/23 打开版本化报告
All 115 static findings are false positives after contextual review. They represent Markdown syntax, chemistry notation, expected output writes, dictionary keys, or normal error messages. A separate high-severity issue remains because SKILL.md demonstrates unsafe pickle deserialization without a trust warning.
7
已扫描文件
3,389
分析行数
0
复核项
0
已忽略误报
已确认安全问题 (1)
高
Unsafe Pickle Deserialization Guidance
The documentation recommends pickle.load without a trust warning. Loading an attacker-controlled pickle can execute arbitrary Python code.
The cited example directly calls pickle.load on a file. Python pickle deserialization is code-execution capable when the input is untrusted.
风险因素
📁 文件系统访问 (6)
⚡ 包含脚本 (1)
⚙️ 外部命令 (50)
SKILL.md:20-34 SKILL.md:34-40 SKILL.md:40-49 SKILL.md:49-55 SKILL.md:55-81 SKILL.md:81-84 SKILL.md:84 SKILL.md:85-94 SKILL.md:94-109 SKILL.md:109-120 SKILL.md:120-141 SKILL.md:141-145 SKILL.md:145-158 SKILL.md:158-162 SKILL.md:162-173 SKILL.md:173-179 SKILL.md:179-201 SKILL.md:201-205 SKILL.md:205-212 SKILL.md:212-216 SKILL.md:216-224 SKILL.md:224-230 SKILL.md:230-254 SKILL.md:254-258 SKILL.md:258-272 SKILL.md:272-276 SKILL.md:276-289 SKILL.md:289-295 SKILL.md:295-307 SKILL.md:307-311 SKILL.md:311-326 SKILL.md:326-338 SKILL.md:338-353 SKILL.md:353-363 SKILL.md:363-369 SKILL.md:369-375 SKILL.md:375-385 SKILL.md:385-389 SKILL.md:389-410 SKILL.md:410-414 SKILL.md:414-417 SKILL.md:417-423 SKILL.md:423-436 SKILL.md:436-440 SKILL.md:440-451 SKILL.md:451-455 SKILL.md:455-474 SKILL.md:474-478 SKILL.md:478-488 SKILL.md:488-492
审计者: codex 查看审计历史 →
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[](https://skillstore.io/skills/davila7-rdkit?utm_source=security_passport_badge)HTML 徽章
<a href="https://skillstore.io/skills/davila7-rdkit?utm_source=security_passport_badge"><img src="https://skillstore.io/badges/skills/davila7-rdkit/security.svg" alt="Skillstore security assessment" loading="lazy"></a>嵌入卡片
<iframe src="https://skillstore.io/embed/skills/davila7-rdkit.html" title="Skillstore Security Assessment" sandbox="allow-popups allow-popups-to-escape-sandbox" loading="lazy" referrerpolicy="no-referrer" width="420" height="180"></iframe>学术引用 (APA · BibTeX · CFF)
APA 引用
davila7. (2026). rdkit security audit report (audit version 9) [Author version unspecified]. Skillstore. https://skillstore.io/skills/davila7-rdkit/audits/9BibTeX 引用
@techreport{davila7-davila7-rdkit-2026,
author = {davila7},
title = {rdkit security audit report (audit version 9)},
institution = {Skillstore},
year = {2026},
number = {9},
url = {https://skillstore.io/skills/davila7-rdkit/audits/9},
note = {Author version unspecified}
}CITATION.cff
cff-version: 1.2.0
message: "If you use this Skill, cite its author and this versioned security audit report."
title: "rdkit security audit report (audit version 9)"
version: "unspecified"
type: report
authors:
- name: "davila7"
date-released: "2026-07-23"
url: "https://skillstore.io/skills/davila7-rdkit/audits/9"
identifiers:
- type: other
value: "skillstore:davila7-rdkit:audit:9"
description: "Skillstore immutable audit report identifier"
比较变体
2 个可安装变体每位作者的技能都保持为独立的可安装项。推荐变体按 Skillstore 证据排序。
为什么此变体排名第一
Skillstore 使用量更高
作者 / 来源 Skillstore 评分 证据置信度 Skillstore 使用量 已更新
Skillstore 评分
评分依据 证据置信度: 中 68
架构
85
可维护性
87
内容
71
社区
83
规范符合性
你能构建什么
筛选化合物库
在 SMILES 或 SDF 文件中运行指纹相似性搜索和子结构筛选。
准备分子特征
为建模、聚类或质量控制工作流生成描述符和指纹。
检查化学结构
创建可视化结构图、突出显示子结构，并排查清理问题。
试试这些提示
计算基础属性
使用 RDKit 技能计算这些 SMILES 的分子量、LogP、TPSA、HBD、HBA 和 Lipinski 状态：[paste molecules]。
查找相似化合物
使用 RDKit Morgan 指纹将此查询分子与我的 SMILES 文件进行比较，并解释相似性最高的命中结果。
按 SMARTS 筛选
构建一个 SMARTS 筛选计划，其中包含芳香胺、排除酰氯，并报告每个模式匹配了哪些分子。
设计工作流
设计一个 RDKit 工作流，用于清理分子、生成描述符、按指纹聚类，并导出可供审阅者使用的摘要。
最佳实践
- 在计算描述符或指纹之前，检查每个分子是否存在解析失败。
- 处理异常价态、盐或自由基时，使用显式清理处理。
- 选择与科学问题匹配的指纹方法和相似性阈值。
避免
- 不要在没有验证数据的情况下将描述符值视为生物活性。
- 不要从不受信任的来源加载 pickle 文件。
- 不要在未确认其符合目标化学场景的情况下复用 SMARTS 筛选器。
常见问题
这个技能有什么用途？
它帮助 Claude、Codex 和 Claude Code 使用 RDKit 进行分子分析、搜索、筛选、反应和可视化。
它会安装 RDKit 吗？
不会。RDKit 必须已安装在受支持的 Python 环境中。
它可以处理 SDF 和 SMILES 文件吗？
可以。示例和脚本涵盖 SDF、MOL、SMILES 和文本分子输入。
它可以生成分子图像吗？
可以。它记录了 RDKit 绘图工具，用于单个分子、网格、突出显示的原子和指纹位。
它适合药物发现工作吗？
适合用于描述符、筛选器、指纹和相似性分析等计算支持任务。
用户应该注意什么？
用户应验证分子、避免使用不受信任的 pickle 文件，并与领域专家审查化学假设。
开发者详情
作者
davila7许可证
MIT
Skillstore 修订
r2
版本提示
作者未声明版本。
引用
c43861a65bb95efcae259cd161c9d6f4dc7eec6f
维护新鲜度
2026/7/26
使用量
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76分析 Open Targets 证据
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74路由生物医学研究工作流
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