技能 gwas-database

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gwas-database

Name: gwas-database
Author: davila7

内容修订 r1 安全 🌐 网络访问📁 文件系统访问⚙️ 外部命令

查询 GWAS Catalog 关联

遗传研究人员需要可靠访问经过整理的 SNP-性状关联和汇总统计数据。此技能指导 Claude、Codex 和 Claude Code 完成 GWAS Catalog 搜索与 API 工作流。

支持: Claude Codex Code(CC)

📊 74 合格

使用我的智能体安装

将此请求复制给你的智能体，其中包含权威 Skill 页面和清单。

智能体请求

Review the Skillstore skill "gwas-database" from https://skillstore.io/skills/davila7-gwas-database.md and its manifest at https://skillstore.io/api/skills/davila7-gwas-database/manifest. Verify the artifact. You may proceed after verification, subject to the environment's own policy.

你的智能体仍应展示其计划，并按安全策略请求必要确认。

Agent 可读资源

当 AI Agent、爬虫或脚本需要干净上下文，而不是读取完整页面时，请使用这些链接。

Markdown 详情 GET /skills/davila7-gwas-database.md 已签名 manifest GET /api/skills/davila7-gwas-database/manifest 已签名 lockfile GET /api/skills/davila7-gwas-database/lockfile

测试它

正在使用“gwas-database”。查找 rs7903146 的关联。

预期结果:

一份简洁摘要，列出相关性状、最强 p-values、风险等位基因、研究登录号，以及关于重复验证证据的备注。

正在使用“gwas-database”。为身体质量指数创建 GWAS Catalog 查询计划。

预期结果:

一个分步工作流，包括性状选择、端点选择、分页指导、显著性筛选条件和引用提醒。

正在使用“gwas-database”。比较 APOE 附近变异的 GWAS 证据。

预期结果:

面向研究的比较，涵盖附近变异、已报告性状、研究元数据、祖源背景和解读注意事项。

安全审计

安全

v14 • 2026/7/9 打开版本化报告

The static findings are mostly documentation examples for public NHGRI-EBI GWAS Catalog API access, public URLs, and Markdown inline code. I did not find prompt injection text or evidence of credential exfiltration. The remaining concerns are insecure FTP or HTTP download guidance and a documented helper that writes downloaded files locally.

已扫描文件

1,397

分析行数

复核项

已忽略误报

能力复核项 (7)

这些是真实的本地能力，对此技能可能是预期行为，因此需要复核，但不会按已确认恶意行为计分。

中

references/api_reference.md:772

Python file write/append

with open(output_path, 'wb') as f:

The example writes downloaded network content to a local path built from function arguments. It is legitimate but should validate paths and confirm writes.

中

SKILL.md:255

FTP protocol

# ftp://ftp.ebi.ac.uk/pub/databases/gwas/summary_statistics/GCSTXXXXXX/

The skill recommends ftp:// downloads from EBI. FTP lacks transport integrity, so public data could be tampered with in transit.

中

SKILL.md:404

FTP protocol

wget ftp://ftp.ebi.ac.uk/pub/databases/gwas/summary_statistics/GCSTXXXXXX/harmonised/GCSTXXXXXX-harm

The skill recommends ftp:// downloads from EBI. FTP lacks transport integrity, so public data could be tampered with in transit.

低

references/api_reference.md:769

Python HTTP libraries

response = requests.get(harmonised_url, stream=True)

This request streams a file from the HTTP download mirror. The data is public, but unauthenticated transport can affect file integrity.

低

references/api_reference.md:761

Hardcoded URL

ftp_base = "http://ftp.ebi.ac.uk/pub/databases/gwas/summary_statistics"

The URL uses unencrypted HTTP for public GWAS data download guidance. This creates a narrow integrity risk without credential exposure.

低

SKILL.md:232

Hardcoded URL

1. **FTP download**: http://ftp.ebi.ac.uk/pub/databases/gwas/summary_statistics/

The URL uses unencrypted HTTP for public GWAS data download guidance. This creates a narrow integrity risk without credential exposure.

低

SKILL.md:599

Hardcoded URL

- **FTP site**: http://ftp.ebi.ac.uk/pub/databases/gwas/

The URL uses unencrypted HTTP for public GWAS data download guidance. This creates a narrow integrity risk without credential exposure.

风险因素

🌐 网络访问 (50)

📁 文件系统访问 (1)

references/api_reference.md:772

⚙️ 外部命令 (50)

SKILL.md:39 SKILL.md:40 SKILL.md:49-51 SKILL.md:51-55 SKILL.md:55-59 SKILL.md:59-63 SKILL.md:63-66 SKILL.md:66-70 SKILL.md:70-72 SKILL.md:72-76 SKILL.md:76-80 SKILL.md:80-88 SKILL.md:88-89 SKILL.md:89-97 SKILL.md:97-98 SKILL.md:98-105 SKILL.md:105-107 SKILL.md:107-108 SKILL.md:108-115 SKILL.md:115-117 SKILL.md:117-118 SKILL.md:118-123 SKILL.md:123-125 SKILL.md:125-126 SKILL.md:126-131 SKILL.md:131-136 SKILL.md:136-153 SKILL.md:153-156 SKILL.md:156-178 SKILL.md:178-181 SKILL.md:181-205 SKILL.md:205-208 SKILL.md:208-225 SKILL.md:225-243 SKILL.md:243-256 SKILL.md:256-278 SKILL.md:278-288 SKILL.md:288-299 SKILL.md:299-301 SKILL.md:301-322 SKILL.md:322-324 SKILL.md:324-327 SKILL.md:327-329 SKILL.md:329-344 SKILL.md:344-347 SKILL.md:347-402 SKILL.md:402-405 SKILL.md:405-408 SKILL.md:408-411 SKILL.md:411-421

审计者: codex 查看审计历史 →

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[![Skillstore security assessment](https://skillstore.io/badges/skills/davila7-gwas-database/security.svg)](https://skillstore.io/skills/davila7-gwas-database?utm_source=security_passport_badge)

HTML 徽章

<a href="https://skillstore.io/skills/davila7-gwas-database?utm_source=security_passport_badge"><img src="https://skillstore.io/badges/skills/davila7-gwas-database/security.svg" alt="Skillstore security assessment" loading="lazy"></a>

嵌入卡片

<iframe src="https://skillstore.io/embed/skills/davila7-gwas-database.html" title="Skillstore Security Assessment" sandbox="allow-popups allow-popups-to-escape-sandbox" loading="lazy" referrerpolicy="no-referrer" width="420" height="180"></iframe>

学术引用 (APA · BibTeX · CFF)

APA 引用

davila7. (2026). gwas-database security audit report (audit version 14) [Author version unspecified]. Skillstore. https://skillstore.io/skills/davila7-gwas-database/audits/14

BibTeX 引用

@techreport{davila7-davila7-gwas-database-2026,
  author = {davila7},
  title = {gwas-database security audit report (audit version 14)},
  institution = {Skillstore},
  year = {2026},
  number = {14},
  url = {https://skillstore.io/skills/davila7-gwas-database/audits/14},
  note = {Author version unspecified}
}

CITATION.cff

cff-version: 1.2.0
message: "If you use this Skill, cite its author and this versioned security audit report."
title: "gwas-database security audit report (audit version 14)"
version: "unspecified"
type: report
authors:
  - name: "davila7"
date-released: "2026-07-09"
url: "https://skillstore.io/skills/davila7-gwas-database/audits/14"
identifiers:
  - type: other
    value: "skillstore:davila7-gwas-database:audit:14"
    description: "Skillstore immutable audit report identifier"

比较变体

2 个可安装变体

每位作者的技能都保持为独立的可安装项。推荐变体按 Skillstore 证据排序。

为什么此变体排名第一

Skillstore 评分最高

作者 / 来源 Skillstore 评分证据置信度 Skillstore 使用量已更新

davila7 推荐当前

davila7-gwas-database

Skillstore 评分 74

证据置信度高

Skillstore 使用量 9

已更新

2026-09-09

K-Dense-AI

k-dense-ai-gwas-database

Skillstore 评分 50

证据置信度高

Skillstore 使用量 14

已更新

2026-09-09

Skillstore 评分

评分依据证据置信度: 高

架构

可维护性

内容

社区

规范符合性

你能构建什么

审查疾病关联

查找某种疾病或表型的变异、p-values、效应大小和来源研究。

检查候选变异

汇总特定 rs ID 的已知性状关联，并比较已报告的证据。

规划系统性证据搜索

使用性状术语、筛选条件和引用备注创建可复现的 GWAS Catalog 查询策略。

试试这些提示

查询一个变异

使用 GWAS Catalog 技能汇总 rs7903146 的已知性状关联。可用时包括性状、p-values、效应大小和研究标识符。

查找性状证据

查找 2 型糖尿病的 GWAS Catalog 证据。尽可能使用相关 EFO 性状，并列出具有研究背景的全基因组显著关联。

比较基因关联

使用 GWAS Catalog 技能研究 TCF7L2 附近的变异。按性状对关联分组，并注明 p-values、效应大小和群体详情。

设计可复现工作流

创建一个可复现计划，用于从 GWAS Catalog 收集所有 2 型糖尿病关联。包括 p-value 筛选条件、分页、访问日期和汇总表。

最佳实践

记录 GWAS Catalog 访问日期，并同时引用 Catalog 和原始研究。
尽可能使用 EFO 标识符，以避免性状名称歧义。
在比较关联前检查祖源、样本量和重复验证状态。

避免

不要将 GWAS 关联视为临床建议。
在未协调等位基因和群体的情况下，不要混合来自不同研究的效应大小。
当一个缓存数据集已足够时，不要反复运行批量下载。

常见问题

此技能使用什么数据库？

它专注于公共 NHGRI-EBI GWAS Catalog 及其 REST 和汇总统计 API。

它可以按 rs ID 搜索吗？

可以。它提供按 rs ID 查询变异并审查相关性状关联的工作流。

它可以按疾病或性状搜索吗？

可以。它指导按性状名称和 EFO 标识符进行搜索，前提是这些标识符可用。

它提供临床建议吗？

不可以。它支持研究工作流，不提供诊断、治疗或临床风险建议。

每项研究都包含汇总统计数据吗？

不。只有已提交该数据的研究才提供完整的汇总统计数据。

哪些工具可以使用此技能？

该报告列出了对 Claude、Codex 和 Claude Code 的支持。

开发者详情

作者

davila7

许可证

MIT

Skillstore 修订

版本提示

作者未声明版本。

仓库

https://github.com/davila7/claude-code-templates/tree/main/cli-tool/components/skills/scientific/gwas-database

引用

b959ebfd1043a07c0c4378ab94ca4342cb0259f5

维护新鲜度

2026/7/23

使用量

5 次下载 · 527 次浏览

文件结构

📁 references/

📄 api_reference.md

用证据验证主张

由 shubhamsaboo

错误信息和薄弱来源会让主张难以令人信任。此技能引导 Claude、Codex 和 Claude Code 进行基于证据的验证、来源评级和清晰结论判定。

研究与学习查看

gwas-database

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BibTeX 引用

CITATION.cff

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Skillstore 评分

你能构建什么

审查疾病关联

检查候选变异

规划系统性证据搜索

试试这些提示

最佳实践

避免

常见问题

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