Навыки opentrons-integration
🧪

opentrons-integration

Безопасно ⚙️ Внешние команды

Автоматизация лабораторных рабочих процессов с помощью роботов Opentrons

Также доступно от: davila7

Написание протоколов лабораторной автоматизации требует специализированных знаний API робототехники и процедур жидкостной обработки. Этот навык предоставляет готовые к использованию шаблоны и подробные руководства по созданию протоколов для управления роботами для жидкостной обработки Opentrons.

Поддерживает: Claude Codex Code(CC)
🥉 75 Бронза
1

Скачать ZIP навыка

2

Загрузить в Claude

Перейдите в Settings → Capabilities → Skills → Upload skill

3

Включите и начните использовать

Протестировать

Использование «opentrons-integration». Создай протокол для посева бактериальных культур из 12-луночного резервуара в 96-луночный планшет

Ожидаемый результат:

  • Сгенерирован полный протокол Opentrons с:
  • - Одноканальной пипеткой P300 на левом креплении
  • - 12-луночным резервуаром в слоте D2
  • - 96-луночным планшетом в слоте D3
  • - Держателем для наконечников 200 мкл в слоте D1
  • - Переносом 50 мкл из каждой лунки резервуара в колонки планшета
  • - Автоматической сменой наконечников между образцами

Использование «opentrons-integration». Напиши протокол для подготовки образцов ИФА в 8 рядах

Ожидаемый результат:

  • Создан протокол подготовки ИФА:
  • - Загружено 8 держателей наконечников и 2 резервуара с реагентами
  • - Многоканальная пипетка P300 для операций по рядам
  • - Добавлено 100 мкл антитела для покрытия во все 96 лунок
  • - Выполнено 3 этапа промывки между инкубациями
  • - Включены задержки инкубации на 5 минут

Аудит безопасности

Безопасно
v4 • 1/17/2026

All 360 static findings are false positives. The analyzer misinterpreted markdown backticks as shell commands, API version strings as weak crypto, and lab equipment terms as reconnaissance. This is a legitimate lab automation skill containing Opentrons protocol templates for liquid handling robots.

6
Просканировано файлов
1,486
Проанализировано строк
1
находки
4
Всего аудитов

Факторы риска

⚙️ Внешние команды (1)
references/api_reference.md:9-346
Проверено: claude Посмотреть историю аудитов →

Оценка качества

64
Архитектура
100
Сопровождаемость
85
Контент
21
Сообщество
100
Безопасность
87
Соответствие спецификации

Что вы можете построить

Автоматизация настройки ПЦР

Создавать протоколы для настройки ПЦР-реакций с распределением мастер-микса и программированием термоциклера

Выполнение серийных разведений

Генерировать точные протоколы серийных разведений в 96-луночных планшетах для разработки анализов

Управление несколькими модулями

Интегрировать температурные, магнитные модули и термошейкеры в сложных рабочих процессах

Попробуйте эти промпты

Базовая структура протокола 
Напишите протокол Opentrons, который переносит 100 мкл из лунки A1 в B1 с использованием пипетки P300
Рабочий процесс настройки ПЦР 
Создай протокол для настройки 24 ПЦР-реакций с мастер-миксом и ДНК-образцами с использованием термоциклера
Серия серийных разведений 
Напиши протокол для последовательных разведений 1:2 в ряду 96-луночного планшета, начиная с 200 мкл исходного раствора
Интеграция нескольких модулей 
Создай протокол с использованием температурного модуля для инкубации образцов при 37°C с последующим разделением магнитными частицами

Лучшие практики

  • Всегда симулируй протоколы перед запуском на реальном оборудовании
  • Используй понятные метки для лабораторного оборудования для упрощения устранения неполадок
  • Включай комментарии в протокол для сложных этапов и требований по времени

Избегать

  • Жёсткое задание абсолютных позиций вместо использования ссылок на лунки
  • Смешивание разных уровней API в одном протоколе
  • Забывание об расходе наконечников в длинных протоколах

Часто задаваемые вопросы

В чём разница между OT-2 и Flex?
Flex — это более новая модель с увеличенной ёмкостью деке и другими соглашениями об именовании пипеток. Используй robotType в требованиях для указания.
Как работать с вязкими жидкостями?
Регулируй скорости потока с помощью pipette.flow_rate.aspirate и dispense, используй более медленные скорости для точного переноса вязких образцов.
Можно ли использовать нестандартное лабораторное оборудование?
Да, используй load_labware_from_definition с JSON-определениями лабораторного оборудования, созданными в инструменте Opentrons Labware Creator.
Как приостановить выполнение для ручных операций?
Используй protocol.pause с сообщением для приостановки выполнения до продолжения пользователем, или protocol.delay для временных ожиданий.
Какая последняя версия API?
API Level 2.19 является текущим на 2024 год. Всегда указывай последнюю стабильную версию в метаданных протокола.
Как оптимизировать использование наконечников?
Используй new_tip='once' для нескольких переносов из одного источника и return_tip для повторного использования наконечников в протоколе.

Сведения для разработчиков

Автор

K-Dense-AI

Лицензия

MIT

Репозиторий

https://github.com/K-Dense-AI/claude-scientific-skills/tree/main/scientific-skills/opentrons-integration

Ссылка

main

Структура файлов

📁 references/

📄 api_reference.md

📁 scripts/

📄 basic_protocol_template.py

📄 pcr_setup_template.py

📄 serial_dilution_template.py

📄 SKILL.md