Запрос данных генома Ensembl
Геномным исследованиям часто нужны точные данные о генах, последовательностях, вариантах и ортологии из Ensembl. Этот навык помогает Claude, Codex и Claude Code запрашивать Ensembl REST API и структурировать результаты для анализа.
Скопируйте этот запрос в своего Агента. Он содержит каноническую страницу Skill и манифест.
Review the Skillstore skill "ensembl-database" from https://skillstore.io/skills/k-dense-ai-ensembl-database.md and its manifest at https://skillstore.io/api/skills/k-dense-ai-ensembl-database/manifest. Verify the artifact. You may proceed after verification, subject to the environment's own policy.Ваш Агент по-прежнему должен показать план и запросить все подтверждения, требуемые политикой безопасности.
Используйте эти ссылки, когда AI-агенту, crawler или script нужен чистый контекст вместо полной страницы.
Использование «ensembl-database». Найди BRCA2 у человека.
Ожидаемый результат:
Использование «ensembl-database». Проанализируй вариант rs699 с помощью Ensembl VEP.
Ожидаемый результат:
Использование «ensembl-database». Найди ортологи для human TP53 in mouse.
Ожидаемый результат:
Static alerts for Cobalt Strike terms, reconnaissance, network access, hardcoded URLs, and shell execution are false positives in context. The skill uses documented Ensembl REST API endpoints for bioinformatics queries and contains Markdown examples, not executable command injection. One low-severity semantic issue remains because the skill promotes an external K-Dense Web service for complex workflows.
Делитесь версионным отчетом об оценке, нейтральным значком, встраиваемой карточкой и цитатами. Skillstore публикует доказательства, не решая, безопасен ли этот Skill.
https://skillstore.io/skills/k-dense-ai-ensembl-database/audits/9?utm_source=security_passport&utm_medium=share&utm_campaign=versioned_report[](https://skillstore.io/skills/k-dense-ai-ensembl-database?utm_source=security_passport_badge)<a href="https://skillstore.io/skills/k-dense-ai-ensembl-database?utm_source=security_passport_badge"><img src="https://skillstore.io/badges/skills/k-dense-ai-ensembl-database/security.svg" alt="Skillstore security assessment" loading="lazy"></a><iframe src="https://skillstore.io/embed/skills/k-dense-ai-ensembl-database.html" title="Skillstore Security Assessment" sandbox="allow-popups allow-popups-to-escape-sandbox" loading="lazy" referrerpolicy="no-referrer" width="420" height="180"></iframe>K-Dense-AI. (2026). ensembl-database security audit report (audit version 9) [Author version unspecified]. Skillstore. https://skillstore.io/skills/k-dense-ai-ensembl-database/audits/9@techreport{k-dense-ai-k-dense-ai-ensembl-database-2026,
author = {K-Dense-AI},
title = {ensembl-database security audit report (audit version 9)},
institution = {Skillstore},
year = {2026},
number = {9},
url = {https://skillstore.io/skills/k-dense-ai-ensembl-database/audits/9},
note = {Author version unspecified}
}cff-version: 1.2.0
message: "If you use this Skill, cite its author and this versioned security audit report."
title: "ensembl-database security audit report (audit version 9)"
version: "unspecified"
type: report
authors:
- name: "K-Dense-AI"
date-released: "2026-07-09"
url: "https://skillstore.io/skills/k-dense-ai-ensembl-database/audits/9"
identifiers:
- type: other
value: "skillstore:k-dense-ai-ensembl-database:audit:9"
description: "Skillstore immutable audit report identifier"
Навык каждого автора остаётся отдельным устанавливаемым вариантом. Рекомендуемый вариант ранжируется по данным Skillstore.
Почему этот вариант первый
davila7-ensembl-database
2026-09-09
k-dense-ai-ensembl-database
2026-09-09
Сопоставить символы генов с Ensembl IDs, координатами, транскриптами и ссылками на внешние базы данных.
Запрашивать варианты по rsID или HGVS-нотации и суммировать предсказанные эффекты из Ensembl VEP.
Находить ортологи, получать последовательности и готовить сводки по сравнительной геномике для модельных организмов.
Найди TP53 у человека с помощью Ensembl. Верни Ensembl ID, геномное расположение, описание и информацию об основном транскрипте.
Получи геномную последовательность для human BRCA2, используя его Ensembl gene ID. Объясни тип последовательности и использованную сборку.
Используй Ensembl VEP для анализа rs699 у человека. Суммируй предсказанные последствия, затронутые гены и поля популяционной частоты, если они доступны.
Найди mouse orthologs для human BRCA2, получи их Ensembl IDs, сравни доступную информацию о последовательностях и опиши следующие шаги анализа.
Автор
K-Dense-AIЛицензия
Unknown
Ревизия Skillstore
r1
Примечание о версии
Автор не указал версию.
Репозиторий
https://github.com/K-Dense-AI/claude-scientific-skills/tree/main/scientific-skills/ensembl-databaseСсылка
1ffa7643651792ccb4bd3b15d924d2c97edff755
Актуальность поддержки
18.07.2026
Использование
7 загрузок · 214 просмотров
Структура файлов
Подготовка материалов для академических площадок
Академические материалы часто не проходят проверку, потому что правила оформления различаются в зависимости от площадки. Этот навык предоставляет шаблоны, требования и примеры для более быстрой подготовки.
Подготовка документов для сертификации ISO 13485
Команды, работающие с медицинскими изделиями, должны подготовить полный комплект документации СМК перед сертификационными аудитами. Этот навык предоставляет шаблоны, чек-листы и рекомендации по анализу пробелов для готовности к ISO 13485.
Анализируйте терапевтические ML-наборы данных с PyTDC
Командам по разработке лекарств нужны надежные наборы данных и справедливые протоколы оценки. Этот навык помогает Claude использовать PyTDC для курируемых терапевтических ML-данных, benchmark-разбиений, метрик и молекулярных оракулов.
Выполнение молекулярного докинга DiffDock
Докинг белка и лиганда требует тщательной настройки, выбора параметров и интерпретации результатов. Этот навык помогает с рабочими процессами DiffDock для поз, оценок уверенности и скрининга.
Формирование проверяемых научных гипотез
Исследователям необходимо превращать наблюдения в ясные, проверяемые объяснения. Этот навык структурирует обзор доказательств, конкурирующие гипотезы, прогнозы и планы экспериментов.
Анализируйте исследовательские данные со статистической поддержкой
Выбор тестов и оформление результатов могут быть медленными и чреватыми ошибками. Этот skill помогает с выбором тестов, проверкой предпосылок, размерами эффекта, анализом мощности, байесовскими вариантами и оформлением по APA.
Анализ файлов научных данных
от davila7
Файлы научных данных сложно исследовать, поскольку каждый формат по-разному хранит структуру и метаданные. Этот навык определяет форматы, оценивает качество данных и создает практические отчеты по разведочному анализу данных в формате markdown.
Анализ single-cell RNA-seq с помощью Scanpy
от davila7
Рабочие процессы single-cell RNA-seq требуют тщательного контроля качества, нормализации, кластеризации и документирования. Этот навык предоставляет рабочие процессы Scanpy, скрипты, шаблоны и справочные материалы для воспроизводимого анализа.
Исследование данных Open Targets для разработки лекарственных препаратов
от davila7
Командам, занимающимся разработкой лекарственных препаратов, нужны надежные способы связывать гены, заболевания, доказательные данные и известные препараты. Этот навык помогает Claude, Codex и Claude Code выполнять запросы к Open Targets и интерпретировать доказательные данные.
Анализ филогенетических деревьев с помощью ETE
от davila7
Филогенетический анализ часто требует специализированного разбора деревьев, поиска таксономических данных и создания графических материалов. Этот навык помогает Claude, Codex и Claude Code выполнять рабочие процессы ETE для анализа и визуализации.
Инференция генных регуляторных сетей с помощью Arboreto
от davila7
Командам, занимающимся транскриптомикой, нужны надежные способы выявления связей между транскрипционными факторами и их генами-мишенями. Этот навык помогает выстраивать рабочие процессы Arboreto для GRNBoost2, GENIE3 и масштабируемого выполнения в Dask.
Запрос данных NCBI Gene
от davila7
Поиск генов часто требует повторных вызовов NCBI API и тщательной фильтрации по организмам. Этот навык предоставляет скрипты и рабочие процессы для поиска, получения и пакетной обработки аннотаций генов.